為了鑒定和分析五指山豬不同部位肌肉和脂肪組織中差異表達的微小RNA (miRNA),采用高通量測序和生物信息學方法對五指山豬肌肉和脂肪組織中的miRNA進行分析篩選,運用DESeq分別鑒定背最長肌和半腱肌、背部和腹部皮下脂肪組織間差異表達的miRNA,并對miRNA進行靶基因預測分析。結果:在五指山豬肌肉組織中共鑒定出344個miRNA,其中已知miRNA 256個、新預測miRNA 88個,肌肉組織中預測到靶基因9 712個;在五指山豬皮下脂肪組織中共鑒定出447個miRNA,其中已知miRNA 279個、新預測miRNA 168個,脂肪組織中預測到靶基因11 510個;五指山豬背最長肌與半腱肌間存在41個差異表達的miRNA,腹部皮下脂肪與背部皮下脂肪間存在83個差異表達的miRNA。本試驗為進一步研究miRNA調控豬骨骼肌和皮下脂肪發(fā)育的分子機制提供科學依據。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 主要試劑
    1.3 肌肉和脂肪組織總RNA提取
    1.4 miRNA文庫構建與測序數據分析
    1.5 miRNA的鑒定
    1.6 miRNA的差異表達分析
    1.7 miRNA靶基因的預測分析
2 結果與分析
    2.1 五指山豬肌肉和脂肪組織miRNA測序數據質量分析
    2.2 五指山豬肌肉和脂肪組織miRNA鑒定分析
    2.3 五指山豬肌肉和脂肪組織miRNA差異表達分析
    2.4 miRNA靶基因的預測分析
3 討論
4 結論



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