目的:血小板活化因子(Platelet-activating factor, PAF)廣泛存在于哺乳動物多種器官組織當(dāng)中，它通過其受體(Platelet-activating factor receptor, PAFR)表達(dá)生物學(xué)活性。為了進(jìn)一步了解PAF及PAFR的功能，本研究擬克隆這兩個基因，并對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析，然后檢測它們在牦牛妊娠前后子宮中的表達(dá)量，以探究PAF和PAFR與牦牛妊娠之間的關(guān)系。 方法：首先根據(jù)黃牛PAF、PAFR和β-actin基因的cDNA序列設(shè)計(jì)引物，然后通過RT-PCR方法克隆牦牛PAF和PAFR基因序列，再利用網(wǎng)絡(luò)資源及相關(guān)軟件對這兩個基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析；通過qRT-PCR方法檢測PAF和PAFR基因在牦牛妊娠前后子宮中的表達(dá)量。 結(jié)果:PAF基因包含一個1179bp的開放閱讀框，編碼392個氨基酸。經(jīng)軟件分析得出：PAF蛋白無跨膜區(qū)、無信號肽片段、無蛋白結(jié)構(gòu)域，整體表現(xiàn)為親水性。牦牛PAF氨基酸序列與黃牛同源性最高，為98.7%。二級結(jié)構(gòu)預(yù)測分析表明其主要由α-螺旋、無規(guī)卷曲和延伸鏈組成，與按同源建模法構(gòu)建的三級結(jié)構(gòu)結(jié)果相符。PAFR基因包含...

【文章頁數(shù)】：46 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Summary
第一部分 文獻(xiàn)綜述
    1. PAF，PAFR
        1.1 PAF 簡介
        1.2 PAFR 簡介
        1.3 PAF 的作用機(jī)制
        1.4 PAF 的合成與代謝
        1.5 PAF，PAFR 在附植中的作用
            1.5.1 PAF 與子宮
            1.5.2 PAFR 與子宮
            1.5.3 PAF-AH 與子宮
            1.5.4 PAF 與前列腺素
    2. 牦牛概況
    3. 生物信息學(xué)分析
        3.1 生物信息學(xué)概況
        3.2 生物信息學(xué)的研究內(nèi)容
第二部分 牦牛 PAF，PAFR 基因克隆及生物信息學(xué)分析
    1 實(shí)驗(yàn)材料與研究方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
            1.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
            1.1.2 主要試劑
            1.1.3 主要儀器
        1.2 實(shí)驗(yàn)方法
            1.2.1 引物設(shè)計(jì)
            1.2.2 總 RNA 的提取及反轉(zhuǎn)錄
            1.2.3 牦牛 PAF，PAFR 基因的克隆與擴(kuò)增
            1.2.4 牦牛 PAF，PAFR 基因的生物信息學(xué)分析
    2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.1 牦牛 PAF，PAFR 基因的克隆與擴(kuò)增
        2.2 牦牛 PAF，PAFR 基因的生物信息學(xué)分析
            2.2.1 牦牛 PAF，PAFR 基因編碼蛋白的理化性質(zhì)
            2.2.2 牦牛 PAF，PAFR 基因編碼蛋白的系統(tǒng)發(fā)育分析
            2.2.3 牦牛 PAFR 基因編碼蛋白信號肽、跨膜區(qū)及結(jié)構(gòu)域分析
            2.2.4 牦牛 PAFR 基因編碼蛋白二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    3 討論
第三部分 牦牛 PAF、PAFR 基因在妊娠前后子宮中的表達(dá)
    1. 實(shí)驗(yàn)材料與研究方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
            1.1.1 實(shí)驗(yàn)樣品
            1.1.2 主要試劑
            1.1.3 主要儀器
        1.2 研究方法
            1.2.1 引物設(shè)計(jì)
            1.2.2 總 RNA 的提取及反轉(zhuǎn)錄
            1.2.3 qRT-PCR 法檢測妊娠前后牦牛子宮中 PAF，PAFR 基因的表達(dá)
    2. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.1 PAF 在妊娠前后牦牛子宮中的表達(dá)
        2.2 PAFR 在妊娠前后牦牛子宮中的表達(dá)
    3. 討論
第四部分 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡介
導(dǎo)師簡介



本文編號：3749361