奶牛冠狀病毒的分子檢測(cè)、基因組特征及ELISA試劑盒的研制
發(fā)布時(shí)間:2023-02-05 12:09
牛冠狀病毒(Bovine Coronavirus,BCoV)主要引起新生犢牛腹瀉、成年牛冬季腹瀉和牛呼吸道疾病,在全球范圍內(nèi)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。血清流行病學(xué)資料顯示國(guó)內(nèi)BCoV陽(yáng)性率高且分布廣泛,但關(guān)于BCoV的病原流行病學(xué)資料欠缺。本研究的目的是開展國(guó)內(nèi)部分地區(qū)奶牛BCoV分子檢測(cè)及基因組研究,同時(shí)研制基于重組N蛋白間接ELISA抗體檢測(cè)試劑盒,取得如下成果:1.國(guó)內(nèi)部分省區(qū)奶牛冠狀病毒的分子檢測(cè)2017年9月到2018年5月,采集了6省14個(gè)奶牛場(chǎng)的190份犢牛腹瀉糞便樣本,采用特異性RT-PCR方法檢測(cè)BCoV的陽(yáng)性率,并選取代表性樣本同時(shí)克隆纖突蛋白(S)、血凝素/酯酶蛋白(HE)、核衣殼蛋白(N)和跨膜蛋白(M)的完整基因,分析其分子特征。結(jié)果表明,BCoV的檢測(cè)率為18.95%,場(chǎng)陽(yáng)性率為92.86%(13/14),表明BCoV在采樣省區(qū)的奶牛中廣泛流行;從4個(gè)省8個(gè)牛場(chǎng)的13個(gè)陽(yáng)性樣本中同時(shí)成功擴(kuò)增出完整的S、HE、N和M基因,與GenBank中的全部163條完整BCoV S基因相比,本實(shí)驗(yàn)克隆的12條序列和中國(guó)其它13個(gè)毒株(12株牦牛和1株奶牛)在進(jìn)化樹上聚為獨(dú)立一...
【文章頁(yè)數(shù)】:94 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 牛冠狀病毒流行特征及其S和HE基因的研究進(jìn)展
1 牛冠狀病毒的流行情況
1.1 牛冠狀病毒引起的新生犢牛腹瀉
1.2 牛冠狀病毒引起的成年牛冬痢疾
1.3 牛冠狀病毒引起的牛呼吸道疾病
1.4 牛冠狀病毒國(guó)內(nèi)外的流行情況
1.5 牛冠狀病毒跨中間傳播
2 牛冠狀病毒S蛋白的研究進(jìn)展
2.1 牛冠狀病毒S蛋白的分子特征
2.2 牛冠狀病毒S蛋白的功能
3 牛冠狀病毒HE蛋白的研究進(jìn)展
3.1 牛冠狀病毒HE蛋白的起源
3.2 牛冠狀病毒HE蛋白的分子特征
3.3 牛冠狀病毒HE蛋白功能
4 小結(jié)
第二章 國(guó)內(nèi)部分省區(qū)奶牛冠狀病毒分子檢測(cè)
1 材料與方法
1.1 臨床樣本
1.2 試驗(yàn)儀器
1.3 主要試劑
1.4 引物的設(shè)計(jì)與合成
1.5 RNA的提取與c DNA的合成
1.6 BCoV陽(yáng)性質(zhì)粒的制備
1.7 PCR擴(kuò)增與測(cè)序
1.8 序列的拼接及進(jìn)化關(guān)系分析
2 結(jié)果
2.1 2017 ~2018 年中國(guó)部分省區(qū)奶牛BCo V分子流行學(xué)調(diào)查
2.2 BCoV S、HE、N和 M完整基因的克隆結(jié)果
2.3 BCoV S、HE、N和 M基因序列、系統(tǒng)發(fā)育和重組分析結(jié)果
3 討論
3.1 部分省區(qū)奶牛BCoV的病原流行病學(xué)
3.2 BCoV S、HE、N和 M基因的分子特征
4 小結(jié)
第三章 奶牛冠狀病毒SWUN/A10/2018 的基因組研究
1 材料和方法
1.1 病毒樣本
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 引物的設(shè)計(jì)與合成
1.5 病毒RNA的提取與c DNA的合成
1.6 BCoV陽(yáng)性質(zhì)粒的制備
1.7 PCR擴(kuò)增與測(cè)序
1.8 全基因序列的拼接及分析
2 結(jié)果
2.1 分離株SWUN/A10/2018 基因組序列及結(jié)構(gòu)特征
2.2 分離株SWUN/A10/2018 毒株S基因分子特征
2.3 分離株SWUN/A10/2018 毒株HE基因分子特征
2.4 分離株SWUN/A10/2018 毒株N、M和 E基因分子特征
2.5 分離株SWUN/A10/2018 毒株ORF1a和 ORF1b基因分子特征
3 討論
3.1 SWUN/A10/2018 基因組特征
3.2 SWUN/A10/2018 S基因的分子特征
3.3 SWUN/A10/2018 HE基因變異
4 小結(jié)
第四章 基于重組N蛋白檢測(cè)BCoV抗體的間接ELISA試劑盒的研發(fā)
1 材料和方法
1.1 主要質(zhì)粒、試驗(yàn)用血清
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 BCoV重組N蛋白的表達(dá)
1.5 基于重組N蛋白間接ELISA檢測(cè)方法條件的優(yōu)化
1.6 間接ELISA方法陰陽(yáng)性臨界值的確定
1.7 基于重組N蛋白間接ELISA檢測(cè)方法的評(píng)價(jià)
1.8 試劑盒的組裝
1.9 對(duì)川西北牦牛血清BCo V流行病學(xué)調(diào)查
2 結(jié)果
2.1 重組原核表達(dá)載體的構(gòu)建結(jié)果
2.2 重組質(zhì)粒在大腸桿菌中的表達(dá)及SDS-PAGE凝膠電泳結(jié)果
2.3 表達(dá)蛋白的回收、純化及Western blot鑒定結(jié)果
2.4 基于重組N蛋白間接ELISA檢測(cè)方法條件的優(yōu)化結(jié)果
2.5 間接ELISA方法陰陽(yáng)性臨界值的確定結(jié)果
2.6 基于重組N蛋白間接ELISA檢測(cè)方法的評(píng)價(jià)結(jié)果
2.7 試劑盒的組裝結(jié)果
2.8 對(duì)川西北牦牛血清BCo V流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果
3 討論
3.1 BCoV的間接ELISA方法
3.2 BCoV的重組N蛋白的表達(dá)
3.3 基于重組N蛋白檢測(cè)BCo V抗體的間接ELISA方法的建立
4 小節(jié)
結(jié)論及創(chuàng)新
參考文獻(xiàn)
作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號(hào):3734945
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
Abstract
第一章 牛冠狀病毒流行特征及其S和HE基因的研究進(jìn)展
1 牛冠狀病毒的流行情況
1.1 牛冠狀病毒引起的新生犢牛腹瀉
1.2 牛冠狀病毒引起的成年牛冬痢疾
1.3 牛冠狀病毒引起的牛呼吸道疾病
1.4 牛冠狀病毒國(guó)內(nèi)外的流行情況
1.5 牛冠狀病毒跨中間傳播
2 牛冠狀病毒S蛋白的研究進(jìn)展
2.1 牛冠狀病毒S蛋白的分子特征
2.2 牛冠狀病毒S蛋白的功能
3 牛冠狀病毒HE蛋白的研究進(jìn)展
3.1 牛冠狀病毒HE蛋白的起源
3.2 牛冠狀病毒HE蛋白的分子特征
3.3 牛冠狀病毒HE蛋白功能
4 小結(jié)
第二章 國(guó)內(nèi)部分省區(qū)奶牛冠狀病毒分子檢測(cè)
1 材料與方法
1.1 臨床樣本
1.2 試驗(yàn)儀器
1.3 主要試劑
1.4 引物的設(shè)計(jì)與合成
1.5 RNA的提取與c DNA的合成
1.6 BCoV陽(yáng)性質(zhì)粒的制備
1.7 PCR擴(kuò)增與測(cè)序
1.8 序列的拼接及進(jìn)化關(guān)系分析
2 結(jié)果
2.1 2017 ~2018 年中國(guó)部分省區(qū)奶牛BCo V分子流行學(xué)調(diào)查
2.2 BCoV S、HE、N和 M完整基因的克隆結(jié)果
2.3 BCoV S、HE、N和 M基因序列、系統(tǒng)發(fā)育和重組分析結(jié)果
3 討論
3.1 部分省區(qū)奶牛BCoV的病原流行病學(xué)
3.2 BCoV S、HE、N和 M基因的分子特征
4 小結(jié)
第三章 奶牛冠狀病毒SWUN/A10/2018 的基因組研究
1 材料和方法
1.1 病毒樣本
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 引物的設(shè)計(jì)與合成
1.5 病毒RNA的提取與c DNA的合成
1.6 BCoV陽(yáng)性質(zhì)粒的制備
1.7 PCR擴(kuò)增與測(cè)序
1.8 全基因序列的拼接及分析
2 結(jié)果
2.1 分離株SWUN/A10/2018 基因組序列及結(jié)構(gòu)特征
2.2 分離株SWUN/A10/2018 毒株S基因分子特征
2.3 分離株SWUN/A10/2018 毒株HE基因分子特征
2.4 分離株SWUN/A10/2018 毒株N、M和 E基因分子特征
2.5 分離株SWUN/A10/2018 毒株ORF1a和 ORF1b基因分子特征
3 討論
3.1 SWUN/A10/2018 基因組特征
3.2 SWUN/A10/2018 S基因的分子特征
3.3 SWUN/A10/2018 HE基因變異
4 小結(jié)
第四章 基于重組N蛋白檢測(cè)BCoV抗體的間接ELISA試劑盒的研發(fā)
1 材料和方法
1.1 主要質(zhì)粒、試驗(yàn)用血清
1.2 主要儀器
1.3 主要試劑
1.4 BCoV重組N蛋白的表達(dá)
1.5 基于重組N蛋白間接ELISA檢測(cè)方法條件的優(yōu)化
1.6 間接ELISA方法陰陽(yáng)性臨界值的確定
1.7 基于重組N蛋白間接ELISA檢測(cè)方法的評(píng)價(jià)
1.8 試劑盒的組裝
1.9 對(duì)川西北牦牛血清BCo V流行病學(xué)調(diào)查
2 結(jié)果
2.1 重組原核表達(dá)載體的構(gòu)建結(jié)果
2.2 重組質(zhì)粒在大腸桿菌中的表達(dá)及SDS-PAGE凝膠電泳結(jié)果
2.3 表達(dá)蛋白的回收、純化及Western blot鑒定結(jié)果
2.4 基于重組N蛋白間接ELISA檢測(cè)方法條件的優(yōu)化結(jié)果
2.5 間接ELISA方法陰陽(yáng)性臨界值的確定結(jié)果
2.6 基于重組N蛋白間接ELISA檢測(cè)方法的評(píng)價(jià)結(jié)果
2.7 試劑盒的組裝結(jié)果
2.8 對(duì)川西北牦牛血清BCo V流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果
3 討論
3.1 BCoV的間接ELISA方法
3.2 BCoV的重組N蛋白的表達(dá)
3.3 基于重組N蛋白檢測(cè)BCo V抗體的間接ELISA方法的建立
4 小節(jié)
結(jié)論及創(chuàng)新
參考文獻(xiàn)
作者在攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號(hào):3734945
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