天然免疫系統(tǒng)是機(jī)體抵抗外來(lái)微生物入侵的第一道防線。干擾素基因刺激因子STING（Stimulator of interferon genes）是天然免疫信號(hào)通路中重要的銜接蛋白。細(xì)胞內(nèi)第二信使環(huán)磷酸鳥苷-腺苷（Cyclic guanosine monophosphate-adenosine monophosphate,c GAMP）是STING的內(nèi)源性激活劑,二者結(jié)合后可以活化STING/TBK1/IRF3信號(hào)通路,最終激活I(lǐng)型干擾素（Type I interferon）的表達(dá)。為了建立基于STING為靶點(diǎn)的抗病毒小分子化合物篩選工具,本文使用慢病毒介導(dǎo)的CRISPR/Cas9基因組編輯技術(shù)建立了STING基因敲除豬肺巨噬細(xì)胞系。通過設(shè)計(jì)單鏈引導(dǎo)RNA（Single guide RNA,sg RNA）構(gòu)建重組質(zhì)粒pSTING-sgRNA,將質(zhì)粒轉(zhuǎn)染人胚胎腎細(xì)胞（Human embryonic kidney 293T/17,HEK293/T17）收取慢病毒并感染3D4/21豬肺巨噬細(xì)胞,經(jīng)嘌呤霉素（Puromycin）篩選獲得STING基因敲除多克隆細(xì)胞系。再通過有限稀釋法,獲得STIN... 

【文章頁(yè)數(shù)】：56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
英文縮略表
摘要
1.文獻(xiàn)綜述
    1.1 天然免疫概述
    1.2 天然免疫系統(tǒng)識(shí)別病原分子
        1.2.1 Toll樣受體家族
        1.2.2 DNA識(shí)別受體家族
        1.2.3 RNA識(shí)別受體家族
        1.2.4 其他的PRRs
    1.3 STING的發(fā)現(xiàn)及臨床意義
        1.3.1 STING的結(jié)構(gòu)
        1.3.2 STING的抗病毒機(jī)制
        1.3.3 STING與G10
    1.4 干擾素的簡(jiǎn)介
        1.4.1 干擾素的分類
        1.4.2 干擾素抗病毒的作用機(jī)制
        1.4.3 干擾素刺激因子
    1.5 偽狂犬病
        1.5.1 偽狂犬病
        1.5.2 PRV的生物學(xué)特性
        1.5.3 PRV與DNA識(shí)別受體
    1.6 CRISPR/Cas9的研究進(jìn)展
        1.6.1 CRISPR/Cas9的結(jié)構(gòu)及原理
        1.6.2 CRISPR/Cas9的優(yōu)勢(shì)及局限
    1.7 展望
2.引言
3.材料與方法
    3.1 材料
        3.1.1 細(xì)胞和病毒
        3.1.2 細(xì)胞培養(yǎng)耗材
        3.1.3 感受態(tài)和質(zhì)粒
        3.1.4 主要儀器設(shè)備
        3.1.5 主要試劑
        3.1.6 常規(guī)生化試劑的配制
    3.2 試驗(yàn)方法
        3.2.1 E.coli Top10感受態(tài)的制備
        3.2.2 引物設(shè)計(jì)與合成
            3.2.2.1 sgRNA引物設(shè)計(jì)與合成
            3.2.2.2 PCR克隆引物設(shè)計(jì)與合成
            3.2.2.3 Q-PCR克隆引物設(shè)計(jì)與合成
        3.2.3 pSTING-sgRNA載體構(gòu)建
            3.2.3.1 sgRNA引物退火
            3.2.3.2 質(zhì)粒酶切與回收
            3.2.3.3 重組質(zhì)粒的連接與轉(zhuǎn)化
            3.2.3.4 質(zhì)粒提取
        3.2.4 3D4/21-STING~(-/-)多克隆細(xì)胞系構(gòu)建
            3.2.4.1 STING-sgRNA慢病毒的包裝
            3.2.4.2 感染細(xì)胞篩選細(xì)胞系
            3.2.4.3 細(xì)胞基因組提取
            3.2.4.4 PCR擴(kuò)增及切膠純化
            3.2.4.5 T7酶切檢測(cè)
        3.2.5 3D4/21-STING~(-/-)單克隆細(xì)胞系的篩選
        3.2.6 酶標(biāo)儀檢測(cè)
        3.2.7 熒光觀察及流式檢測(cè)
        3.2.8 PRV病毒滴度的測(cè)定
            3.2.8.1 病毒的擴(kuò)增和收取
            3.2.8.2 病毒滴度的測(cè)定
        3.2.9 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
            3.2.9.1 細(xì)胞總RNA的提取
            3.2.9.2 反轉(zhuǎn)錄合成cDNA
            3.2.9.3 熒光定量PCR檢測(cè)
            3.2.9.4 mRNA相對(duì)表達(dá)量的計(jì)算
        3.2.10 數(shù)據(jù)處理
4.結(jié)果與分析
    4.1 豬STING-sgRNA重組質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定
        4.1.1 52961質(zhì)粒酶切結(jié)果
        4.1.2 質(zhì)粒測(cè)序結(jié)果
    4.2 3D4/21-STING~(-/-)多克隆細(xì)胞系的構(gòu)建
        4.2.1 STING基因編輯效率的檢測(cè)
        4.2.2 T7酶切鑒定
    4.3 3D4/21-STING~(-/-)單克隆細(xì)胞系的篩選
    4.4 G10抑制PRV-GFP在3D4/21-WT細(xì)胞中的復(fù)制
    4.5 3D4/21-STING~(-/-)單克隆細(xì)胞系的鑒定
        4.5.1 STING基因敲除對(duì)PRV-GFP病毒復(fù)制的影響
        4.5.2 STING基因敲除對(duì)PRV-GFP和PRV-QXX病毒滴度的影響
        4.5.3 STING基因敲除對(duì)ISG基因的影響
5.討論與結(jié)論
    5.1 討論
    5.2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
英文摘要



本文編號(hào)：3719449