中國黃牛Y-SNPs和Y-STRs遺傳多樣性及父系起源研究
發(fā)布時(shí)間:2022-12-09 03:42
分子遺傳標(biāo)記廣泛用于動物起源進(jìn)化和遺傳多樣性研究。不同于線粒體和常染色體DNA,Y染色體分子遺傳標(biāo)記反映動物的父系遺傳特征,提供父系起源證據(jù)。常用的Y染色體特異性分子標(biāo)記包括單核苷酸多態(tài)性(SNP)和微衛(wèi)星標(biāo)記(STR)。我國幅員遼闊,自然環(huán)境復(fù)雜多樣,蘊(yùn)育了十分豐富的黃牛遺傳資源。但目前有關(guān)中國黃牛的Y染色體分子遺傳多樣性及父系起源研究主要集中在北方黃牛和中原黃牛,南方黃牛研究的較少。本研究采用PCR擴(kuò)增、測序和生物信息學(xué)等方法,利用已發(fā)表的2對Y-SNPs標(biāo)記(UTY19和ZFY10)和2對經(jīng)典的Y-STRs標(biāo)記(INRA189和BM861),以荷斯坦牛(N=30)和夏南牛品種(N=32)作對照,對我國23個(gè)地方黃牛品種/群體共575頭公牛進(jìn)行遺傳多樣性分析,并結(jié)合本課題組前期已發(fā)表的302頭公牛的相應(yīng)數(shù)據(jù),共同探討中國33個(gè)黃牛品種/群體共計(jì)877頭公牛的遺傳多樣性、群體結(jié)構(gòu)和父系起源。本研究的主要結(jié)果如下:(1)中國黃牛具有較高的Y染色體遺傳多樣性。中國北方黃牛以普通牛Y2單倍型組為主,南方黃牛以瘤牛Y3單倍型組為主。少量Y1單倍型組可能與國外牛的基因滲入有關(guān)。(2)普通牛和瘤...
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 中國黃牛遺傳資源概述
1.1.1 中國黃牛的系統(tǒng)分類學(xué)
1.1.2 中國黃牛遺傳資源的分類與分布
1.2 Y染色體的結(jié)構(gòu)特征
1.2.1 Y染色體的基本結(jié)構(gòu)和特征
1.2.2 牛Y染色體基本結(jié)構(gòu)
1.3 Y染色體遺傳標(biāo)記
1.3.1 Y染色體的多態(tài)類型
1.3.2 單核苷酸多態(tài)標(biāo)記技術(shù)
1.3.3 微衛(wèi)星標(biāo)記分型技術(shù)
1.4 哺乳動物Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.4.1 馬屬動物Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.4.2 綿羊Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.4.3 豬Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.5 牛遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.5.1 牛線粒體DNA遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.5.2 牛常染色體微衛(wèi)星遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.5.3 牛Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.6 家牛的起源與馴化
1.7 研究的目的與意義
第二章 中國黃牛Y-SNPs和Y-STRs遺傳多樣性及父系起源研究
2.1 材料與方法
2.1.1 樣本采集與數(shù)據(jù)來源
2.1.2 試劑與儀器
2.1.3 試驗(yàn)方法
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 基因組DNA檢測
2.2.2 中國黃牛Y-SNPs標(biāo)記的多態(tài)性檢測
2.2.3 中國黃牛Y-STRs標(biāo)記的多態(tài)性檢測
2.2.4 中國黃牛的Y染色體遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)
2.2.5 中國黃牛群體間的遺傳分化、遺傳距離和群體結(jié)構(gòu)水平
2.3 討論
2.3.1 Y染色體分子標(biāo)記在中國黃牛中的特異性
2.3.2 中國黃牛品種/群體的Y染色體遺傳多樣性
2.3.3 Y染色體單倍型在中國黃牛中的地理分布
2.3.4 中國黃牛具有向?qū)iT化肉牛品種培育的潛力
結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
本文編號:3714747
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級別】:碩士
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摘要
abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 中國黃牛遺傳資源概述
1.1.1 中國黃牛的系統(tǒng)分類學(xué)
1.1.2 中國黃牛遺傳資源的分類與分布
1.2 Y染色體的結(jié)構(gòu)特征
1.2.1 Y染色體的基本結(jié)構(gòu)和特征
1.2.2 牛Y染色體基本結(jié)構(gòu)
1.3 Y染色體遺傳標(biāo)記
1.3.1 Y染色體的多態(tài)類型
1.3.2 單核苷酸多態(tài)標(biāo)記技術(shù)
1.3.3 微衛(wèi)星標(biāo)記分型技術(shù)
1.4 哺乳動物Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.4.1 馬屬動物Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.4.2 綿羊Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.4.3 豬Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.5 牛遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.5.1 牛線粒體DNA遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.5.2 牛常染色體微衛(wèi)星遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.5.3 牛Y染色體遺傳多樣性研究進(jìn)展
1.6 家牛的起源與馴化
1.7 研究的目的與意義
第二章 中國黃牛Y-SNPs和Y-STRs遺傳多樣性及父系起源研究
2.1 材料與方法
2.1.1 樣本采集與數(shù)據(jù)來源
2.1.2 試劑與儀器
2.1.3 試驗(yàn)方法
2.2 結(jié)果與分析
2.2.1 基因組DNA檢測
2.2.2 中國黃牛Y-SNPs標(biāo)記的多態(tài)性檢測
2.2.3 中國黃牛Y-STRs標(biāo)記的多態(tài)性檢測
2.2.4 中國黃牛的Y染色體遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)
2.2.5 中國黃牛群體間的遺傳分化、遺傳距離和群體結(jié)構(gòu)水平
2.3 討論
2.3.1 Y染色體分子標(biāo)記在中國黃牛中的特異性
2.3.2 中國黃牛品種/群體的Y染色體遺傳多樣性
2.3.3 Y染色體單倍型在中國黃牛中的地理分布
2.3.4 中國黃牛具有向?qū)iT化肉牛品種培育的潛力
結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡介
本文編號:3714747
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