為了對氣腫疽梭菌NanA基因進(jìn)行克隆及生物信息學(xué)分析,試驗根據(jù)GenBank中已發(fā)表的氣腫疽梭菌NanA基因序列設(shè)計并合成1對特異性引物,以氣腫疽梭菌總DNA為模板,擴(kuò)增出NanA目的基因并克隆至pMD18-T載體中,對測序正確的NanA基因進(jìn)行序列對比分析,對NanA蛋白進(jìn)行理化性質(zhì)分析與二級結(jié)構(gòu)預(yù)測,同時使用在線軟件預(yù)測NanA蛋白三級結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明:成功擴(kuò)增出氣腫疽梭菌Nan A基因,與參考序列相比,共存在3處核苷酸突變,核苷酸序列和氨基酸序列與NCBI公布的JF4135 NanA基因序列的同源性均為99.8%。NanA蛋白分子質(zhì)量約為71 ku,具有較高的抗原指數(shù),二級結(jié)構(gòu)以β-折疊和無規(guī)則卷曲為主,有多個抗原表位區(qū)域。 

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 菌株及主要試劑
    1.2 Nana基因引物的設(shè)計與合成
    1.3 NanA基因的PCR擴(kuò)增與克隆
    1.4 NanA基因序列對比分析
    1.5 NanA蛋白理化性質(zhì)分析與二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    1.6 NanA蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2 結(jié)果與分析
    2.1 NanA基因PCR擴(kuò)增與克隆
    2.2 NanA基因序列比對分析
    2.3 NanA蛋白理化性質(zhì)分析
    2.4 NanA蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
    2.5 NanA蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]利用SOE-PCR與TD-PCR技術(shù)對氣腫疽梭菌FliA（C）-NanA融合基因擴(kuò)增方法的構(gòu)建[J]. 李香春,金鑫,樸春宇,金成德,樸春實.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(24)
[2]吉林延邊地區(qū)牛氣腫疽病的診斷報告[J]. 段雪巖,金東春,任春宇,車達(dá),云巾宴,齊強,金鑫.  中國畜牧獸醫(yī). 2015(10)
[3]氣腫疽梭菌PCR檢測方法的建立[J]. 云巾宴,任春宇,車達(dá),段雪巖,司唯,金鑫.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(10)
[4]肉牛氣腫疽病的流行與綜合防控措施分析[J]. 武成威.  畜禽業(yè). 2018(07)

碩士論文
[1]延邊株氣腫疽梭菌的分離鑒定及cctA基因的克隆和表達(dá)[D]. 云巾宴.延邊大學(xué) 2015



本文編號：3714432