干擾PTEN基因?qū)δ躺窖蛉橄偕掀ぜ?xì)胞脂質(zhì)合成相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄及脂肪酸組成的影響
發(fā)布時間:2022-12-04 06:24
旨在通過RNA干擾技術(shù)揭示蛋白酪氨酸磷酸酶(phosphatase and tensin homolog deleted on chromosome 10,PTEN)基因在奶山羊乳腺上皮細(xì)胞中對乳脂合成及脂肪酸組成的影響。利用RT-PCR方法擴增到西農(nóng)薩能奶山羊乳腺組織中PTEN基因(GenBank登錄號:MK158074.1)的CDS區(qū),進行序列分析和不同泌乳時期差異轉(zhuǎn)錄分析。合成靶向該基因的siRNA,由RT-qPCR結(jié)果篩選出有效siRNA,將其轉(zhuǎn)染至奶山羊的乳腺上皮細(xì)胞,進一步檢測干擾該基因后對脂質(zhì)合成相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平及脂肪酸組成的影響。結(jié)果表明:本研究首次克隆到奶山羊(Capra hircus)PTEN基因的CDS區(qū),全長為1 212 bp;經(jīng)序列比對發(fā)現(xiàn),山羊的PTEN基因核苷酸序列同牛(Bos taurus)、豬(Sus scrofa)和人(Homo sapiens)的相似度分別為99%、98%和97%,編碼氨基酸序列相似性均在99%以上;蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測發(fā)現(xiàn):其蛋白不存在跨膜結(jié)構(gòu)域,亞細(xì)胞定位于細(xì)胞質(zhì)中,N端具有保守的磷酸酶功能區(qū);該基因在奶山羊泌乳盛期乳腺組織中的轉(zhuǎn)錄量...
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣品采集
1.1.2 主要試劑
1.2 方法
1.2.1 PTEN基因CDS區(qū)的克隆
1.2.2 PTEN基因生物信息學(xué)分析
1.2.3 不同泌乳時期PTEN基因差異轉(zhuǎn)錄分析
1.2.4 siRNA的設(shè)計與合成
1.2.5 細(xì)胞的培養(yǎng)與siRNA的轉(zhuǎn)染
1.2.6 PTEN基因的干擾效果檢測及有效siRNA的篩選
1.2.7 RT-qPCR檢測干擾PTEN基因?qū)θ橄僦x關(guān)鍵基因的影響
1.2.8 脂肪酸的提取與檢測
2 結(jié) 果
2.1 奶山羊PTEN基因CDS區(qū)的克隆
2.2 奶山羊PTEN基因生物信息學(xué)分析
2.3 不同泌乳時期奶山羊乳腺組織PTEN基因的差異轉(zhuǎn)錄分析
2.4 有效siRNA序列的篩選及干擾效率檢測
2.5 干擾PTEN基因?qū)χx關(guān)鍵基因的RT-qPCR檢測影響
2.6 干擾PTEN基因?qū)χ舅峤M成的影響
3 討 論
4 結(jié) 論
本文編號:3707756
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 樣品采集
1.1.2 主要試劑
1.2 方法
1.2.1 PTEN基因CDS區(qū)的克隆
1.2.2 PTEN基因生物信息學(xué)分析
1.2.3 不同泌乳時期PTEN基因差異轉(zhuǎn)錄分析
1.2.4 siRNA的設(shè)計與合成
1.2.5 細(xì)胞的培養(yǎng)與siRNA的轉(zhuǎn)染
1.2.6 PTEN基因的干擾效果檢測及有效siRNA的篩選
1.2.7 RT-qPCR檢測干擾PTEN基因?qū)θ橄僦x關(guān)鍵基因的影響
1.2.8 脂肪酸的提取與檢測
2 結(jié) 果
2.1 奶山羊PTEN基因CDS區(qū)的克隆
2.2 奶山羊PTEN基因生物信息學(xué)分析
2.3 不同泌乳時期奶山羊乳腺組織PTEN基因的差異轉(zhuǎn)錄分析
2.4 有效siRNA序列的篩選及干擾效率檢測
2.5 干擾PTEN基因?qū)χx關(guān)鍵基因的RT-qPCR檢測影響
2.6 干擾PTEN基因?qū)χ舅峤M成的影響
3 討 論
4 結(jié) 論
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