發(fā)布時(shí)間：2022-11-04 19:21

　　運(yùn)用RT–PCR方法,克隆廣靈驢的ADD1基因的CDS區(qū),對(duì)其進(jìn)行序列分析,并通過qRT–PCR技術(shù)鑒定ADD1基因在廣靈驢心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟和背最長(zhǎng)肌中的相對(duì)表達(dá)水平。結(jié)果表明:廣靈驢ADD1基因完整的CDS序列全長(zhǎng)為2 223 bp,可編碼740個(gè)氨基酸,序列已提交到NCBI,登錄號(hào)為MN₁66472,其核苷酸序列與馬的核苷酸序列的同源性最高,達(dá)99.6%;生物信息學(xué)預(yù)測(cè)ADD1蛋白為結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的親水性蛋白,理論等電點(diǎn)為5.58,二級(jí)結(jié)構(gòu)主要以α–螺旋和無規(guī)則卷曲為主,存在1個(gè)Ⅱ類醛縮酶和內(nèi)收蛋白N端超家族結(jié)構(gòu)域,該蛋白沒有信號(hào)肽及跨膜區(qū)域,主要定位在細(xì)胞核中,序列中共存在88個(gè)磷酸化位點(diǎn),69個(gè)O–糖基化位點(diǎn)和3個(gè)N–糖基化位點(diǎn);實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)結(jié)果表明,ADD1基因在廣靈驢的6種組織中均有表達(dá),但存在差異,在背最長(zhǎng)肌中表達(dá)量最豐富,在肝臟中表達(dá)量最低。 

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
        1.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
        1.1.2 主要試劑
    1.2 方法
        1.2.1 引物的設(shè)計(jì)與合成
        1.2.2 總RNA提取和c DNA合成
        1.2.3 PCR擴(kuò)增與克隆測(cè)序
        1.2.4 序列分析
        1.2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增
2 結(jié)果與分析
    2.1 廣靈驢ADD1基因的序列
    2.2 廣靈驢ADD1基因及其編碼蛋白序列的同源性比對(duì)分析結(jié)果
    2.3 ADD1基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果
    2.4 廣靈驢ADD1蛋白分子特征的預(yù)測(cè)結(jié)果
        2.4.1 氨基酸序列的理化性質(zhì)和親/疏水性
        2.4.2 ADD1蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)
        2.4.3 ADD1蛋白的保守域
        2.4.4 ADD1蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)和信號(hào)肽及亞細(xì)胞定位
        2.4.5 ADD1蛋白的修飾結(jié)構(gòu)
    2.5 ADD1基因在廣靈驢不同組織中的表達(dá)情況
3 結(jié)論與討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]豬附紅細(xì)胞體MSG1基因的克隆與生物信息學(xué)分析[J]. 賈杏林,鄒亞文,劉思遠(yuǎn),程天印.  湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(05)
[2]人白細(xì)胞介素-29的生物信息學(xué)分析[J]. 鄭海軍,朱榮,葛春蕾,蔡鮮,徐望,陳偉,陸源.  中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2013(02)
[3]磷酸化蛋白質(zhì)分析技術(shù)在蛋白質(zhì)組研究中的應(yīng)用[J]. 王京蘭,錢小紅.  分析化學(xué). 2005(07)

博士論文
[1]雞肌肉生長(zhǎng)相關(guān)基因的表達(dá)與肌苷酸關(guān)鍵酶基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的構(gòu)建[D]. 欒德琴.揚(yáng)州大學(xué) 2012

碩士論文
[1]肉雞Ex-FABP和ADD1基因的遺傳多態(tài)性及其組織表達(dá)譜分析[D]. 楊娟娟.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號(hào)：3701187