絨山羊ALX4基因多態(tài)性與絨毛性狀相關(guān)性分析
發(fā)布時間:2022-10-23 19:34
在絨山羊(Capra hircus)絨毛生長發(fā)育的過程中,不同基因的表達調(diào)控在毛囊代謝中發(fā)揮著重要作用。本研究選擇無根狀同源異型盒-4 (aristaless-like homeobox 4, ALX4)為候選基因,旨在驗證ALX4基因與絨山羊絨毛性狀的相關(guān)性,為絨山羊分子標記輔助選育提供依據(jù)。首先提取20只絨細度處于最高和最低絨山羊血液DNA,采用PCR擴增技術(shù)對ALX4基因的3’-UTR、5’-UTR、外顯子、啟動子序列進行擴增并測序。根據(jù)Blast比對結(jié)果,統(tǒng)計ALX4基因發(fā)生突變的SNP位點,再利用競爭性等位基因特異性PCR (Kompetitive Allele-Specific PCR, KASP)基因分型技術(shù)對315只絨山羊個體進行檢測,應(yīng)用一般線性模型進行SNPs位點與絨毛性狀的相關(guān)性分析。結(jié)果表明,ALX4基因啟動子區(qū)存在SNP1 (T-1700C),3’-UTR區(qū)存在SNP2 (T-14621C)、SNP3 (T-15433C)、SNP4 (G-16377C)、SNP5 (A-17780G)和SNP6 (A-18044G),每個位點均符合Hardy-Weinberg...
【文章頁數(shù)】:10 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實驗材料
1.1.2 主要儀器和試劑
1.2 方法
1.2.1 基因組DNA提取
1.2.2 引物設(shè)計與合成
1.2.3 PCR擴增及SNP位點檢測
1.2.4 KASP (Kompetitive Allele-Specific PCR)基因分型
1.2.5 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組DNA提取結(jié)果及PCR擴增產(chǎn)物電泳檢測
2.2 ALX4基因PCR擴增產(chǎn)物測序
2.3 ALX4基因各位點基因型頻率和基因頻率
2.4 ALX4基因各位點的群體遺傳多樣性
2.5 ALX4基因SNPs位點與絨毛性狀的關(guān)聯(lián)性分析
2.6 ALX4基因SNPs單倍型重構(gòu)及單倍型組合與絨毛性狀關(guān)聯(lián)性分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]羊絨細度候選基因靶標miRNAs篩選和鑒定[J]. 惠太宇,鄭圓媛,岳暢,孫家明,郭丹,郭素玲,王意如,劉宇浩,王梓橙,王英軒,黃麗飛,白文林,王澤英. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(01)
[2]雞主要組織相容性復(fù)合體B區(qū)域多態(tài)性分析[J]. 袁海旭,王明月,趙越,王敏,原一桐,趙春江,連玲. 中國家禽. 2018(20)
[3]FGF7亞家族在小鼠毛囊第一生長周期的表達[J]. 牛姝,程笳琪,高淑媛,曹校瑞,吳晉強,陸娜,閆瑞琴,赫曉燕. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2018(03)
[4]河西絨山羊絨毛生長的季節(jié)性變化規(guī)律及其與生長激素關(guān)系的研究[J]. 魏云霞,肖玉萍,楊保平,程勝利,楊博輝. 中國草食動物科學(xué). 2012(06)
[5]褪黑激素對PDGFA基因在絨山羊皮膚毛囊中表達模式的影響[J]. 麗春,張文廣,楊文柱,王志新,張永斌,高愛琴,張燕軍,趙艷紅,蘇蕊,常子麗,金鑫,王鵬宇,馮林,劉慧,武瑞兵,王瑞軍,李金泉. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(10)
[6]性激素影響毛囊生長的機制進展[J]. 王利生,翁立強,程波. 國際皮膚性病學(xué)雜志. 2007(05)
博士論文
[1]內(nèi)蒙古絨山羊毛被類型遺傳規(guī)律及其對重要經(jīng)濟性狀間接選擇研究[D]. 李學(xué)武.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]內(nèi)蒙古絨山羊毛囊發(fā)育、生長周期及相關(guān)基因的研究[D]. 尹俊.內(nèi)蒙古大學(xué) 2004
本文編號:3696996
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實驗材料
1.1.2 主要儀器和試劑
1.2 方法
1.2.1 基因組DNA提取
1.2.2 引物設(shè)計與合成
1.2.3 PCR擴增及SNP位點檢測
1.2.4 KASP (Kompetitive Allele-Specific PCR)基因分型
1.2.5 統(tǒng)計分析
2 結(jié)果與分析
2.1 基因組DNA提取結(jié)果及PCR擴增產(chǎn)物電泳檢測
2.2 ALX4基因PCR擴增產(chǎn)物測序
2.3 ALX4基因各位點基因型頻率和基因頻率
2.4 ALX4基因各位點的群體遺傳多樣性
2.5 ALX4基因SNPs位點與絨毛性狀的關(guān)聯(lián)性分析
2.6 ALX4基因SNPs單倍型重構(gòu)及單倍型組合與絨毛性狀關(guān)聯(lián)性分析
3 討論
4 結(jié)論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]羊絨細度候選基因靶標miRNAs篩選和鑒定[J]. 惠太宇,鄭圓媛,岳暢,孫家明,郭丹,郭素玲,王意如,劉宇浩,王梓橙,王英軒,黃麗飛,白文林,王澤英. 沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2019(01)
[2]雞主要組織相容性復(fù)合體B區(qū)域多態(tài)性分析[J]. 袁海旭,王明月,趙越,王敏,原一桐,趙春江,連玲. 中國家禽. 2018(20)
[3]FGF7亞家族在小鼠毛囊第一生長周期的表達[J]. 牛姝,程笳琪,高淑媛,曹校瑞,吳晉強,陸娜,閆瑞琴,赫曉燕. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2018(03)
[4]河西絨山羊絨毛生長的季節(jié)性變化規(guī)律及其與生長激素關(guān)系的研究[J]. 魏云霞,肖玉萍,楊保平,程勝利,楊博輝. 中國草食動物科學(xué). 2012(06)
[5]褪黑激素對PDGFA基因在絨山羊皮膚毛囊中表達模式的影響[J]. 麗春,張文廣,楊文柱,王志新,張永斌,高愛琴,張燕軍,趙艷紅,蘇蕊,常子麗,金鑫,王鵬宇,馮林,劉慧,武瑞兵,王瑞軍,李金泉. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(10)
[6]性激素影響毛囊生長的機制進展[J]. 王利生,翁立強,程波. 國際皮膚性病學(xué)雜志. 2007(05)
博士論文
[1]內(nèi)蒙古絨山羊毛被類型遺傳規(guī)律及其對重要經(jīng)濟性狀間接選擇研究[D]. 李學(xué)武.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]內(nèi)蒙古絨山羊毛囊發(fā)育、生長周期及相關(guān)基因的研究[D]. 尹俊.內(nèi)蒙古大學(xué) 2004
本文編號:3696996
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