【背景】豬非典型瘟病毒作為一種新發(fā)病毒,近幾年在國內(nèi)各省份中陸續(xù)被檢出,目前針對豬非典型瘟病毒（atypical porcine pestivirus,APPV）的研究報(bào)道大多集中于基因組學(xué)和流行病學(xué),而其感染宿主后的致病機(jī)制尚不清楚�！灸康摹坷酶咄繙y序技術(shù),對感染仔豬小腦組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄水平差異研究,初步探索APPV致病機(jī)制�！痉椒ā繉�(shí)驗(yàn)組3份排除其余能引發(fā)仔豬先天性震顫和神經(jīng)癥狀相關(guān)病原干擾的APPV感染仔豬的小腦組織,與對照組3份健康仔豬的小腦組織進(jìn)行高通量測序,比較實(shí)驗(yàn)組和對照組之間轉(zhuǎn)錄水平的差異。【結(jié)果】構(gòu)建了兩個(gè)cDNA文庫:APPV感染小腦組織文庫、健康小腦組織文庫。在P≤0.05,|Log2（FC）|≥0.263的篩選標(biāo)準(zhǔn)下,共篩選出差異表達(dá)基因（differentially expressed gene,DEG） 381個(gè),其中上調(diào)基因163個(gè),下調(diào)基因218個(gè);隨機(jī)選取8個(gè)差異表達(dá)的基因,經(jīng)RT-qPCR檢測,以β-actin作為內(nèi)參基因,結(jié)果顯示8個(gè)差異基因的表達(dá)趨勢與高通量測序一致�！窘Y(jié)論】通過對臨床感染APPV的仔豬小腦樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組研究,通過GO、KEGG... 

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

樣品檢測電泳圖

差異表達(dá)基因的GO分類統(tǒng)計(jì)

差異表達(dá)基因KEGG注釋分類

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]一種新型仔豬先天性震顫及其病原的初步研究[J]. 張文波,吳松松,鄧舜洲,周荷田,張志慶,楊丹鳳,曹亮亮.  中國畜牧獸醫(yī). 2017(07)
[2]Wnt信號通路在神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育中的作用研究進(jìn)展[J]. 劉麗,龍鼎新.  中南醫(yī)學(xué)科學(xué)雜志. 2017(03)
[3]軸突導(dǎo)向信號的研究進(jìn)展[J]. 馬振蓮,劉少君.  軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院院刊. 2006(02)



本文編號：3696377