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肉雞肺動(dòng)脈組織中MEOX2基因克隆與生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2022-10-19 14:08
  克隆構(gòu)建肉雞間充質(zhì)同源盒蛋白2(mesenchyme homeobox,MEOX2)重組質(zhì)粒pUCm-T-MEOX2,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。通過提取肉雞肺動(dòng)脈組織基因組RNA,并反轉(zhuǎn)錄為cDNA,利用PCR方法擴(kuò)增MEOX2基因片段,并將目的片段通過TA克隆到pUCm-T載體上獲得重組質(zhì)粒,測(cè)序后對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示,成功獲得pUCm-T-MEOX2重組質(zhì)粒,目的基因片段為819 bp,可編碼273個(gè)氨基酸,其序列同源性與原雞無差異;其存在45個(gè)磷酸化位點(diǎn)和1個(gè)N-糖基化修飾位點(diǎn);經(jīng)預(yù)測(cè)MEOX2蛋白亞細(xì)胞定位于細(xì)胞核,無信號(hào)肽;MEOX2蛋白為親水性蛋白且無跨膜結(jié)構(gòu);二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)為α-螺旋、延伸鏈、β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲,分別占22.79%,9.93%,3.68%,63.60%;三級(jí)結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)卷曲和α-螺旋組成;其有11個(gè)B細(xì)胞抗原表位。本試驗(yàn)結(jié)果可為MEOX2基因抗體制備奠定良好的基礎(chǔ),進(jìn)而為肉雞腹水綜合征的肺動(dòng)脈血管重構(gòu)病理檢測(cè)及基因藥物治療提供有力的依據(jù)。 

【文章頁數(shù)】:9 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)樣品及主要試劑
    1.2 引物設(shè)計(jì)與合成
    1.3 MEOX2 基因的PCR擴(kuò)增
    1.4 MEOX2基因的TA克隆
    1.5 MEOX2基因的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 MEOX2基因的PCR擴(kuò)增、克隆與鑒定
    2.2 MEOX2基因的生物信息學(xué)分析
        2.2.1 MEOX2基因同源性分析
        2.2.2 MEOX2蛋白的理化性質(zhì)
        2.2.3 MEOX2蛋白磷酸化位點(diǎn)和糖基化位點(diǎn)分析
        2.2.4 MEOX2 蛋白亞細(xì)胞定位和信號(hào)肽
        2.2.5 MEOX2蛋白的親/疏水性及跨膜結(jié)構(gòu)域
        2.2.6 MEOX2 蛋白的二三級(jí)結(jié)構(gòu)
        2.2.7 MEOX2 蛋白的抗原肽與保守域
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[2]草原紅牛ACSL3基因CDS區(qū)克隆、生物信息學(xué)分析及組織表達(dá)研究[J]. 呂陽,曹陽,高一,王玉婷,張國梁.  中國畜牧獸醫(yī). 2019(04)
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博士論文
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碩士論文
[1]肉雞腹水綜合征的gallus轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及丹參酮ⅡA對(duì)其防治的研究[D]. 鄧廣付.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015



本文編號(hào):3693506

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