一株綠鷺源H9N2亞型禽流感病毒全基因組序列分析
發(fā)布時(shí)間:2022-10-11 11:54
為了解野生水禽綠鷺(Butorides striata)中分離到的1株H9N2亞型禽流感病毒(A/striated heron/Yunnan/2018)的生物學(xué)特性;對(duì)其進(jìn)行全基因組序列擴(kuò)增、測(cè)序、進(jìn)化分析;序列分析顯示:該分離株HA、NA基因位于Y280-like分支、PB2、M基因位于G1-like分支、PA、PB1、NP、NS基因位于F98-like分支,分別與H9、H7、H10等多種亞型的AIV同源性較高,該分離株不同基因片段來源較復(fù)雜。HA裂解位點(diǎn)氨基酸序列為333PSRSSR↓GL340,符合低致病性禽流感病毒(LPAIV)氨基酸序列特征; S145N突變?cè)黾恿艘粋(gè)糖基化位點(diǎn),提示該位點(diǎn)出現(xiàn)可能會(huì)使毒株致病性提高,免疫原性發(fā)生改變; HA受體結(jié)合位點(diǎn)發(fā)生Q234L突變,表現(xiàn)出人流感病毒受體結(jié)合特性; NA基因出現(xiàn)第63—65位氨基酸缺失,M1發(fā)生N30D,T215A突變,M2發(fā)生S31N的突變,PB2、PB1、NS、NP、PA關(guān)鍵位點(diǎn)未發(fā)生變化,分析結(jié)果提示當(dāng)前分離株已出現(xiàn)耐藥性、致病性增強(qiáng)的變化。本研究表明該分離株呈現(xiàn)遺傳演化的多樣性及基因重組的復(fù)雜性,因此加強(qiáng)對(duì)野生水禽...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品來源
1.2 主要試劑
1.3 病毒分離擴(kuò)增
1.4 病毒RNA提取和RT-PCR鑒定
1.5 全基因組序列擴(kuò)增
1.6 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 病毒PCR鑒定結(jié)果
2.2 病毒全基因組PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.3 基因組遺傳進(jìn)化分析
2.4 基因組序列關(guān)鍵位點(diǎn)分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]1株鵝源H9N2亞型禽流感病毒分子進(jìn)化分析及對(duì)鵝的致病性[J]. 張溢珊,陳濟(jì)鐺,陳建紅,劉敏芳,曹夢(mèng)蕊,張濟(jì)培. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]影響禽流感病毒致病性和傳播的關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)的研究進(jìn)展[J]. 徐曉龍,包紅梅,陳化蘭,王秀榮. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(02)
[3]H9N2 AIV HA蛋白S145N變異毒株的抗原性和免疫原性[J]. 王新衛(wèi),趙軍,陳陸,姚惠霞,王川慶,王澤霖. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(02)
[4]人H5N1亞型禽流感病毒安徽株NS1基因的克隆及在原核系統(tǒng)的表達(dá)[J]. 程從升,藍(lán)雨,柳燕,張智清,舒躍龍,姚立紅,溫樂英,王大燕,王偉,李希妍,王琦,趙新生,黃晶晶,聶凱,張曉光. 微生物學(xué)報(bào). 2007(03)
博士論文
[1]中國(guó)南方H9N2禽流感病毒的分子進(jìn)化分析及其對(duì)小鼠致病性研究[D]. 朱光劍.華東師范大學(xué) 2012
本文編號(hào):3690526
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣品來源
1.2 主要試劑
1.3 病毒分離擴(kuò)增
1.4 病毒RNA提取和RT-PCR鑒定
1.5 全基因組序列擴(kuò)增
1.6 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 病毒PCR鑒定結(jié)果
2.2 病毒全基因組PCR擴(kuò)增結(jié)果
2.3 基因組遺傳進(jìn)化分析
2.4 基因組序列關(guān)鍵位點(diǎn)分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]1株鵝源H9N2亞型禽流感病毒分子進(jìn)化分析及對(duì)鵝的致病性[J]. 張溢珊,陳濟(jì)鐺,陳建紅,劉敏芳,曹夢(mèng)蕊,張濟(jì)培. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]影響禽流感病毒致病性和傳播的關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn)的研究進(jìn)展[J]. 徐曉龍,包紅梅,陳化蘭,王秀榮. 中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(02)
[3]H9N2 AIV HA蛋白S145N變異毒株的抗原性和免疫原性[J]. 王新衛(wèi),趙軍,陳陸,姚惠霞,王川慶,王澤霖. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(02)
[4]人H5N1亞型禽流感病毒安徽株NS1基因的克隆及在原核系統(tǒng)的表達(dá)[J]. 程從升,藍(lán)雨,柳燕,張智清,舒躍龍,姚立紅,溫樂英,王大燕,王偉,李希妍,王琦,趙新生,黃晶晶,聶凱,張曉光. 微生物學(xué)報(bào). 2007(03)
博士論文
[1]中國(guó)南方H9N2禽流感病毒的分子進(jìn)化分析及其對(duì)小鼠致病性研究[D]. 朱光劍.華東師范大學(xué) 2012
本文編號(hào):3690526
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