為了獲得巴馬香豬脂肪酸結合蛋白4（FABP4）基因的編碼區(qū)序列（CDS）,并探究FABP4基因在巴馬香豬不同器官/組織中的mRNA表達水平,試驗以巴馬香豬背最長肌為材料,提取總RNA并擴增出FABP4基因的CDS,運用在線分析系統(tǒng)進行生物信息學分析,并利用實時熒光定量PCR技術檢測巴馬香豬心臟、脾臟、肝臟、腎臟、肺臟、背最長肌和胰腺等器官/組織中FABP4基因的mRNA表達水平。結果表明:成功克隆得到巴馬香豬FABP4基因的CDS,長度為488bp,與GenBank中公布的豬FABP4基因同源性為99.6%,并且存在2個突變位點,第421位點處G→A為同義突變,第462位點處A→G導致賴氨酸突變?yōu)榫彼?巴馬香豬FABP4基因CDS與豬、人、黑猩猩、獼猴、牛和家鼠的同源性分別為99.6%、89.3%、89.3%、88.7%、87.3%和82.8%,且與普通豬的遺傳距離最近,聚類為一支;巴馬香豬FABP4蛋白氨基酸組成中蘇氨酸和纈氨酸含量較高,均占氨基酸總數的10.6%;FABP4蛋白為親水蛋白,包含一個Lipocalin超家族結構域;巴馬香豬FABP4蛋白的二、三級結構包含α-螺旋、延... 

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗動物
    1.2 主要試劑
2 方法
    2.1 引物的設計與合成
    2.2 FABP4基因的PCR擴增及克隆
    2.3 生物信息學分析
    2.4 不同器官/組織中FABP4基因表達的檢測
3 結果與分析
    3.1 巴馬香豬FABP4基因的克隆
    3.2 巴馬香豬FABP4基因序列分析
    3.3 巴馬香豬FABP4基因CDS同源性比較及系統(tǒng)進化樹構建
    3.4 巴馬香豬FABP4基因氨基酸組成分析
    3.5 巴馬香豬FABP4蛋白親疏水性分析
    3.6 巴馬香豬FABP4蛋白保守結構域預測
    3.7 巴馬香豬FABP4蛋白的二級結構預測
    3.8 巴馬香豬FABP4蛋白的三級結構預測
    3.9 不同器官/組織中FABP4基因表達的檢測
4 討論與結論


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]大熊貓FABP4、FABP5及RPS9基因克隆與表達研究[D]. 宋波.四川農業(yè)大學 2015

碩士論文
[1]阿勒泰大尾羊FABP4、ADIPOQ和CFD基因分子克隆及其組織差異性表達的研究[D]. 許瑞霞.石河子大學 2015
[2]北京鴨A-FABP基因組織表達特征及表達效應[D]. 榮光輝.揚州大學 2014
[3]脂肪因子Lipocalin-2與2型糖尿病及肥胖的相關性研究[D]. 陳旖婷.蘇州大學 2011
[4]牛A-FABP多克隆抗血清制備及組織表達分析[D]. 季舒涵.西北農林科技大學 2010



本文編號：3689238