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雞CALB1基因的SNPs檢測及其與蛋品質(zhì)的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2022-10-08 14:56
  蛋殼品質(zhì)是蛋禽的重要經(jīng)濟性狀。鈣結(jié)合蛋白是機體內(nèi)調(diào)節(jié)鈣離子轉(zhuǎn)運的重要蛋白,CALB1,即Calbindin-D28k,是Ca BP的一種位于胞漿中可溶性蛋白質(zhì),可與Ca2+相結(jié)合,直接調(diào)節(jié)Ca2+轉(zhuǎn)運,介導(dǎo)調(diào)節(jié)參與Ca2+的多種生理功能。本試驗以濟寧百日雞為試驗材料,搜集了43周齡母雞所產(chǎn)雞蛋560枚,測定了蛋重、蛋形指數(shù)、蛋殼厚度、蛋殼強度、蛋殼重、蛋黃重、蛋白重、蛋白高度、蛋黃顏色、哈氏單位、蛋殼比率、蛋黃比率、蛋白比率等蛋品質(zhì)指標,檢測了CALB1基因5’調(diào)控區(qū)SNPs,并將其與蛋品質(zhì)性狀進行關(guān)聯(lián)分析。主要研究結(jié)果如下:(1)濟寧百日雞平均蛋重為44.04±0.15g、蛋殼厚度為0.31±0.03mm、蛋殼強度為38.13±0.29N/cm2、蛋形指數(shù)為1.31±0.00,哈氏單位為61.17±0.30。蛋殼比率、蛋黃比率和蛋白比率分別為9.90%、37.60%和52.52%。蛋形指數(shù)的變異系數(shù)最小,為4.06%;蛋殼強度和蛋白高度的變異系數(shù)最大,均超過了15%。變異系數(shù)在5%~10%的性狀有蛋重、蛋殼比率、蛋白比率和蛋黃比率。其余性狀的變異系數(shù)在10%~15%之間。蛋重與蛋殼重... 

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
1 引言
    1.1 濟寧百日雞及蛋品質(zhì)
    1.2 蛋殼品質(zhì)的研究進展
        1.2.1 蛋殼性狀的評定指標
        1.2.2 影響蛋殼品質(zhì)的因素
        1.2.3 蛋殼的成分
    1.3 鈣結(jié)合蛋白的研究進展
        1.3.1 鈣結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)
        1.3.2 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的分子生物學特性
        1.3.3 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的作用
    1.4 CALB1基因的研究進展
        1.4.1 CALB1基因的結(jié)構(gòu)
        1.4.2 CALB1基因在雌性生殖系統(tǒng)中的表達
    1.5 單核苷酸多態(tài)性與蛋殼性狀分子遺傳標記
    1.6 本研究的目的與意義
2 材料與方法
    2.1 試驗材料
        2.1.1 試驗動物
        2.1.2 數(shù)據(jù)庫及軟件
        2.1.3 主要儀器設(shè)備
        2.1.4 主要試劑
    2.2 試驗方法
        2.2.1 蛋品質(zhì)指標測量
        2.2.2 雞血液DNA的提取
        2.2.3 試驗引物設(shè)計
        2.2.4 混池測序篩選CALB1基因的SNPs位點
        2.2.5 5'調(diào)控區(qū)各SNPs位點突變前后轉(zhuǎn)錄因子變化預(yù)測
        2.2.6 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)甲基化預(yù)測
        2.2.7 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)大群檢測和基因分型
    2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
        2.3.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)
        2.3.2 群體基因頻率、基因型頻率及遺傳多樣性
        2.3.3 SNPs與蛋品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析
        2.3.4 單倍型效應(yīng)分析
3 結(jié)果與分析
    3.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)分析
    3.2 濟寧百日雞蛋品質(zhì)性狀相關(guān)性分析
    3.3 濟寧百日雞CALB1基因SNPs位點檢測及群體遺傳學分析
        3.3.1 目的片段PCR擴增結(jié)果
        3.3.2 混池測序結(jié)果
        3.3.3 部分SNPs位點突變前后轉(zhuǎn)錄因子比較
        3.3.4 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)的甲基化預(yù)測結(jié)果
        3.3.5 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs直接測序結(jié)果
        3.3.6 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點群體遺傳學分析
    3.4 濟寧百日雞CALB1基因SNPs與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
        3.4.1 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
        3.4.2 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點連鎖不平衡分析
        3.4.3 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)單倍型與聯(lián)合基因型效應(yīng)分析
4 討論
    4.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)特點
    4.2 雞CALB15'調(diào)控區(qū)的多態(tài)性
    4.3 濟寧百日雞CALB15'調(diào)控區(qū)SNPs對蛋殼品質(zhì)的影響
5 結(jié)論
參考文獻
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:3687916

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