雞CALB1基因的SNPs檢測及其與蛋品質(zhì)的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2022-10-08 14:56
蛋殼品質(zhì)是蛋禽的重要經(jīng)濟性狀。鈣結(jié)合蛋白是機體內(nèi)調(diào)節(jié)鈣離子轉(zhuǎn)運的重要蛋白,CALB1,即Calbindin-D28k,是Ca BP的一種位于胞漿中可溶性蛋白質(zhì),可與Ca2+相結(jié)合,直接調(diào)節(jié)Ca2+轉(zhuǎn)運,介導(dǎo)調(diào)節(jié)參與Ca2+的多種生理功能。本試驗以濟寧百日雞為試驗材料,搜集了43周齡母雞所產(chǎn)雞蛋560枚,測定了蛋重、蛋形指數(shù)、蛋殼厚度、蛋殼強度、蛋殼重、蛋黃重、蛋白重、蛋白高度、蛋黃顏色、哈氏單位、蛋殼比率、蛋黃比率、蛋白比率等蛋品質(zhì)指標,檢測了CALB1基因5’調(diào)控區(qū)SNPs,并將其與蛋品質(zhì)性狀進行關(guān)聯(lián)分析。主要研究結(jié)果如下:(1)濟寧百日雞平均蛋重為44.04±0.15g、蛋殼厚度為0.31±0.03mm、蛋殼強度為38.13±0.29N/cm2、蛋形指數(shù)為1.31±0.00,哈氏單位為61.17±0.30。蛋殼比率、蛋黃比率和蛋白比率分別為9.90%、37.60%和52.52%。蛋形指數(shù)的變異系數(shù)最小,為4.06%;蛋殼強度和蛋白高度的變異系數(shù)最大,均超過了15%。變異系數(shù)在5%~10%的性狀有蛋重、蛋殼比率、蛋白比率和蛋黃比率。其余性狀的變異系數(shù)在10%~15%之間。蛋重與蛋殼重...
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 濟寧百日雞及蛋品質(zhì)
1.2 蛋殼品質(zhì)的研究進展
1.2.1 蛋殼性狀的評定指標
1.2.2 影響蛋殼品質(zhì)的因素
1.2.3 蛋殼的成分
1.3 鈣結(jié)合蛋白的研究進展
1.3.1 鈣結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3.2 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的分子生物學特性
1.3.3 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的作用
1.4 CALB1基因的研究進展
1.4.1 CALB1基因的結(jié)構(gòu)
1.4.2 CALB1基因在雌性生殖系統(tǒng)中的表達
1.5 單核苷酸多態(tài)性與蛋殼性狀分子遺傳標記
1.6 本研究的目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗動物
2.1.2 數(shù)據(jù)庫及軟件
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.1.4 主要試劑
2.2 試驗方法
2.2.1 蛋品質(zhì)指標測量
2.2.2 雞血液DNA的提取
2.2.3 試驗引物設(shè)計
2.2.4 混池測序篩選CALB1基因的SNPs位點
2.2.5 5'調(diào)控區(qū)各SNPs位點突變前后轉(zhuǎn)錄因子變化預(yù)測
2.2.6 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)甲基化預(yù)測
2.2.7 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)大群檢測和基因分型
2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
2.3.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)
2.3.2 群體基因頻率、基因型頻率及遺傳多樣性
2.3.3 SNPs與蛋品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析
2.3.4 單倍型效應(yīng)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)分析
3.2 濟寧百日雞蛋品質(zhì)性狀相關(guān)性分析
3.3 濟寧百日雞CALB1基因SNPs位點檢測及群體遺傳學分析
3.3.1 目的片段PCR擴增結(jié)果
3.3.2 混池測序結(jié)果
3.3.3 部分SNPs位點突變前后轉(zhuǎn)錄因子比較
3.3.4 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)的甲基化預(yù)測結(jié)果
3.3.5 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs直接測序結(jié)果
3.3.6 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點群體遺傳學分析
3.4 濟寧百日雞CALB1基因SNPs與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
3.4.1 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
3.4.2 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點連鎖不平衡分析
3.4.3 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)單倍型與聯(lián)合基因型效應(yīng)分析
4 討論
4.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)特點
4.2 雞CALB15'調(diào)控區(qū)的多態(tài)性
4.3 濟寧百日雞CALB15'調(diào)控區(qū)SNPs對蛋殼品質(zhì)的影響
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]懸浮紅細胞輸注量對受血者血鈣濃度變化的影響[J]. 王晶晶,劉愛華. 醫(yī)學信息. 2020(03)
[2]京粉1號商品蛋雞蛋品質(zhì)分析[J]. 陳志明. 綠色科技. 2019(13)
[3]影響蛋殼質(zhì)量的因素分析及對策[J]. 孫豐蘭,趙黎明. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2019(02)
[4]不同飼養(yǎng)方式對雞蛋品質(zhì)及其常規(guī)化學成分的影響[J]. 劉帥,溫杰鋒,康麗,李顯耀,樊新忠,唐輝. 家禽科學. 2017(07)
[5]雞蛋蛋殼性狀功能基因的鑒定及應(yīng)用[J]. 田小龍,張瑩,張紅亮,張浩,吳常信. 中國家禽. 2017(13)
[6]鈣結(jié)合蛋白-D28K在神經(jīng)退行性疾病中的作用[J]. 何蓮子,鄧媛媛,高健美,龔其海. 中國新藥與臨床雜志. 2017(05)
[7]礦物質(zhì)元素和維生素對雞蛋殼顏色的影響及其可能機制[J]. 黃選洋,張克英,王建萍,丁雪梅,曾秋鳳,白世平. 動物營養(yǎng)學報. 2016(09)
[8]礦物元素對雞蛋蛋殼質(zhì)量的營養(yǎng)調(diào)控研究進展[J]. 趙必遷,李學海,錢文. 廣東飼料. 2016(05)
[9]Expression analysis for candidate genes associated with eggshell mechanical property[J]. SUN Cong-jiao,DUAN Zhong-yi,QU Lu-jiang,ZHENG Jiang-xia,YANG Ning,XU Gui-yun. Journal of Integrative Agriculture. 2016(02)
[10]不同地方雞種蛋品質(zhì)比較和相關(guān)性分析[J]. 董志梅,劉曉曉,龍君江,李永洙,秦四海. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(03)
博士論文
[1]雞OC17基因克隆、表達及其Ser61位點對碳酸鈣結(jié)晶功能研究[D]. 張權(quán).中國農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]雞蛋殼品質(zhì)的比較蛋白質(zhì)組研究及離子轉(zhuǎn)運基因抑制表達分析[D]. 孫從佼.中國農(nóng)業(yè)大學 2014
[3]雞CRBPs基因家族克隆、表達及其與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 肖禮華.四川農(nóng)業(yè)大學 2011
[4]鈣結(jié)合蛋白Calbindin-d28k在女性生殖系統(tǒng)表達與變化的研究[D]. 許多.暨南大學 2006
[5]雞鈣代謝調(diào)節(jié)相關(guān)基因的克隆重組與表達研究[D]. 章世元.南京農(nóng)業(yè)大學 2005
碩士論文
[1]濟寧百日雞產(chǎn)蛋曲線擬合及ASMT基因5’調(diào)控區(qū)多態(tài)性分析[D]. 滕軍.山東農(nóng)業(yè)大學 2019
[2]汶上蘆花雞蛋品質(zhì)及其候選基因遺傳效應(yīng)分析[D]. 夏佳豪.山東農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]壽光雞AANAT基因5’調(diào)控區(qū)的多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 郝園麗.山東農(nóng)業(yè)大學 2015
[4]雞產(chǎn)蛋相關(guān)基因多態(tài)性檢測及其與蛋用性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊桓.華中農(nóng)業(yè)大學 2011
[5]蛋殼顏色、成分和結(jié)構(gòu)與蛋殼質(zhì)量關(guān)系的研究[D]. 周光玉.揚州大學 2010
[6]D28k鈣結(jié)合蛋白基因真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建及其表達效果的研究[D]. 李燕舞.揚州大學 2004
本文編號:3687916
【文章頁數(shù)】:72 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 濟寧百日雞及蛋品質(zhì)
1.2 蛋殼品質(zhì)的研究進展
1.2.1 蛋殼性狀的評定指標
1.2.2 影響蛋殼品質(zhì)的因素
1.2.3 蛋殼的成分
1.3 鈣結(jié)合蛋白的研究進展
1.3.1 鈣結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)
1.3.2 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的分子生物學特性
1.3.3 鈣結(jié)合Calbindin-D28k的作用
1.4 CALB1基因的研究進展
1.4.1 CALB1基因的結(jié)構(gòu)
1.4.2 CALB1基因在雌性生殖系統(tǒng)中的表達
1.5 單核苷酸多態(tài)性與蛋殼性狀分子遺傳標記
1.6 本研究的目的與意義
2 材料與方法
2.1 試驗材料
2.1.1 試驗動物
2.1.2 數(shù)據(jù)庫及軟件
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.1.4 主要試劑
2.2 試驗方法
2.2.1 蛋品質(zhì)指標測量
2.2.2 雞血液DNA的提取
2.2.3 試驗引物設(shè)計
2.2.4 混池測序篩選CALB1基因的SNPs位點
2.2.5 5'調(diào)控區(qū)各SNPs位點突變前后轉(zhuǎn)錄因子變化預(yù)測
2.2.6 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)甲基化預(yù)測
2.2.7 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)大群檢測和基因分型
2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析
2.3.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)
2.3.2 群體基因頻率、基因型頻率及遺傳多樣性
2.3.3 SNPs與蛋品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析
2.3.4 單倍型效應(yīng)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)分析
3.2 濟寧百日雞蛋品質(zhì)性狀相關(guān)性分析
3.3 濟寧百日雞CALB1基因SNPs位點檢測及群體遺傳學分析
3.3.1 目的片段PCR擴增結(jié)果
3.3.2 混池測序結(jié)果
3.3.3 部分SNPs位點突變前后轉(zhuǎn)錄因子比較
3.3.4 CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)的甲基化預(yù)測結(jié)果
3.3.5 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs直接測序結(jié)果
3.3.6 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點群體遺傳學分析
3.4 濟寧百日雞CALB1基因SNPs與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
3.4.1 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點與蛋品質(zhì)關(guān)聯(lián)分析
3.4.2 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)SNPs位點連鎖不平衡分析
3.4.3 濟寧百日雞CALB1基因 5'調(diào)控區(qū)單倍型與聯(lián)合基因型效應(yīng)分析
4 討論
4.1 濟寧百日雞蛋品質(zhì)特點
4.2 雞CALB15'調(diào)控區(qū)的多態(tài)性
4.3 濟寧百日雞CALB15'調(diào)控區(qū)SNPs對蛋殼品質(zhì)的影響
5 結(jié)論
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]懸浮紅細胞輸注量對受血者血鈣濃度變化的影響[J]. 王晶晶,劉愛華. 醫(yī)學信息. 2020(03)
[2]京粉1號商品蛋雞蛋品質(zhì)分析[J]. 陳志明. 綠色科技. 2019(13)
[3]影響蛋殼質(zhì)量的因素分析及對策[J]. 孫豐蘭,趙黎明. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2019(02)
[4]不同飼養(yǎng)方式對雞蛋品質(zhì)及其常規(guī)化學成分的影響[J]. 劉帥,溫杰鋒,康麗,李顯耀,樊新忠,唐輝. 家禽科學. 2017(07)
[5]雞蛋蛋殼性狀功能基因的鑒定及應(yīng)用[J]. 田小龍,張瑩,張紅亮,張浩,吳常信. 中國家禽. 2017(13)
[6]鈣結(jié)合蛋白-D28K在神經(jīng)退行性疾病中的作用[J]. 何蓮子,鄧媛媛,高健美,龔其海. 中國新藥與臨床雜志. 2017(05)
[7]礦物質(zhì)元素和維生素對雞蛋殼顏色的影響及其可能機制[J]. 黃選洋,張克英,王建萍,丁雪梅,曾秋鳳,白世平. 動物營養(yǎng)學報. 2016(09)
[8]礦物元素對雞蛋蛋殼質(zhì)量的營養(yǎng)調(diào)控研究進展[J]. 趙必遷,李學海,錢文. 廣東飼料. 2016(05)
[9]Expression analysis for candidate genes associated with eggshell mechanical property[J]. SUN Cong-jiao,DUAN Zhong-yi,QU Lu-jiang,ZHENG Jiang-xia,YANG Ning,XU Gui-yun. Journal of Integrative Agriculture. 2016(02)
[10]不同地方雞種蛋品質(zhì)比較和相關(guān)性分析[J]. 董志梅,劉曉曉,龍君江,李永洙,秦四海. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(03)
博士論文
[1]雞OC17基因克隆、表達及其Ser61位點對碳酸鈣結(jié)晶功能研究[D]. 張權(quán).中國農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]雞蛋殼品質(zhì)的比較蛋白質(zhì)組研究及離子轉(zhuǎn)運基因抑制表達分析[D]. 孫從佼.中國農(nóng)業(yè)大學 2014
[3]雞CRBPs基因家族克隆、表達及其與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 肖禮華.四川農(nóng)業(yè)大學 2011
[4]鈣結(jié)合蛋白Calbindin-d28k在女性生殖系統(tǒng)表達與變化的研究[D]. 許多.暨南大學 2006
[5]雞鈣代謝調(diào)節(jié)相關(guān)基因的克隆重組與表達研究[D]. 章世元.南京農(nóng)業(yè)大學 2005
碩士論文
[1]濟寧百日雞產(chǎn)蛋曲線擬合及ASMT基因5’調(diào)控區(qū)多態(tài)性分析[D]. 滕軍.山東農(nóng)業(yè)大學 2019
[2]汶上蘆花雞蛋品質(zhì)及其候選基因遺傳效應(yīng)分析[D]. 夏佳豪.山東農(nóng)業(yè)大學 2018
[3]壽光雞AANAT基因5’調(diào)控區(qū)的多態(tài)性及其與產(chǎn)蛋性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 郝園麗.山東農(nóng)業(yè)大學 2015
[4]雞產(chǎn)蛋相關(guān)基因多態(tài)性檢測及其與蛋用性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 楊桓.華中農(nóng)業(yè)大學 2011
[5]蛋殼顏色、成分和結(jié)構(gòu)與蛋殼質(zhì)量關(guān)系的研究[D]. 周光玉.揚州大學 2010
[6]D28k鈣結(jié)合蛋白基因真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建及其表達效果的研究[D]. 李燕舞.揚州大學 2004
本文編號:3687916
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/3687916.html
最近更新
教材專著