鴨三種吸蟲(chóng)線粒體全基因組的擴(kuò)增與進(jìn)化分析
發(fā)布時(shí)間:2022-10-04 17:10
鴨吸蟲(chóng)病是一類對(duì)鴨危害較嚴(yán)重的寄生蟲(chóng)病。目前對(duì)鴨吸蟲(chóng)的研究多數(shù)集中在形態(tài)學(xué)、流行病學(xué)、病原診斷及綜合防治等方面,關(guān)于其分子生物學(xué)方面的基礎(chǔ)研究相對(duì)較少。因此本研究擬對(duì)鴨體內(nèi)宮川棘口吸蟲(chóng)(Echinostoma miyagawai)、舟形嗜氣管吸蟲(chóng)(Tracheophilus cymbius)和鴨對(duì)體吸蟲(chóng)(Amphimerus anatis)三種吸蟲(chóng)的線粒體全基因組序列進(jìn)行擴(kuò)增及進(jìn)化分析,探討三種吸蟲(chóng)與其他吸蟲(chóng)的親緣關(guān)系及分類地位。利用PCR方法分別擴(kuò)增三種吸蟲(chóng)的線粒體全基因組序列,以線粒體串聯(lián)的12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因氨基酸序列為基因標(biāo)記,采用最大簡(jiǎn)約法(MP)、最大似然法(ML)及貝葉斯法(BI)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),探討實(shí)驗(yàn)中三種吸蟲(chóng)與其它相關(guān)吸蟲(chóng)的親緣關(guān)系。結(jié)果顯示宮川棘口吸蟲(chóng)、舟形嗜氣管吸蟲(chóng)和鴨對(duì)體吸蟲(chóng)線粒體全基因組全長(zhǎng)分別為14 416 bp、13 733bp和14 588 bp;每個(gè)線粒體基因組都含有36個(gè)基因,包括12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因、22個(gè)tRNA序列和2個(gè)rRNA序列,所有基因均在同一條鏈上且轉(zhuǎn)錄方向相同。宮川棘口吸蟲(chóng)和舟形嗜氣管吸蟲(chóng)有1個(gè)非編碼區(qū),鴨對(duì)體吸蟲(chóng)有2個(gè)非編碼區(qū);宮...
【文章頁(yè)數(shù)】:102 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 幾種鴨體內(nèi)重要的吸蟲(chóng)
1.1.1 宮川棘口吸蟲(chóng)
1.1.2 舟形嗜氣管吸蟲(chóng)
1.1.3 鴨對(duì)體吸蟲(chóng)
1.2 吸蟲(chóng)線粒體基因組研究進(jìn)展
1.2.1 吸蟲(chóng)線粒體基因組全序列測(cè)定完成概況
1.2.2 吸蟲(chóng)線粒體基因組的特點(diǎn)
1.3 線粒體基因組的應(yīng)用
1.4 研究目的和意義
2 材料
2.1 蟲(chóng)體采集
2.2 引物設(shè)計(jì)
2.3 主要儀器設(shè)備、試劑、培養(yǎng)基、應(yīng)用的生物信息學(xué)軟件
3 方法
3.1 三種吸蟲(chóng)的鑒定
3.2 蟲(chóng)體總DNA的提取
3.3 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組各部分的擴(kuò)增
3.3.1 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組PCR反應(yīng)條件體系
3.3.2 瓊脂糖凝膠電泳
3.3.3 PCR產(chǎn)物的純化
3.4 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組的拼接和分析
3.5 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組的比較分析
3.6 系統(tǒng)發(fā)生的研究
4 結(jié)果
4.1 三種吸蟲(chóng)的鑒定結(jié)果
4.1.1 三種吸蟲(chóng)的形態(tài)學(xué)鑒定
4.1.2 宮川棘口吸蟲(chóng)的分子生物學(xué)鑒定
4.2 三種吸蟲(chóng)線粒體全基因組序列擴(kuò)增
4.2.1 宮川棘口吸蟲(chóng)序列PCR結(jié)果
4.2.2 舟形嗜氣管吸蟲(chóng)序列PCR結(jié)果
4.2.3 鴨對(duì)體吸蟲(chóng)序列PCR結(jié)果
4.3 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組序列分析
4.3.1 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組的特征分析
4.3.2 三種吸蟲(chóng)的t RNA基因和r RNA基因
4.3.3 三種吸蟲(chóng)的非編碼區(qū)
4.3.4 三種吸蟲(chóng)的基因排列順序和密碼子使用情況
4.4 三種吸蟲(chóng)與其它復(fù)殖吸蟲(chóng)同源性比較分析
4.5 親緣關(guān)系分析
5 討論
5.1 吸蟲(chóng)線粒體全基因組的特征分析
5.2 吸蟲(chóng)線粒體12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因及基因排布情況
5.3 吸蟲(chóng)線粒體t RNA基因和r RNA基因
5.4 進(jìn)化分析
6 結(jié)論
附錄
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]上杭縣番鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病的診治報(bào)告[J]. 許建康. 福建畜牧獸醫(yī). 2018(06)
[2]黑龍江省2016年重點(diǎn)食源性寄生蟲(chóng)病和土源性線蟲(chóng)病調(diào)查分析[J]. 袁爽,邢智鋒,葛濤,尹世輝,唐磊. 中國(guó)公共衛(wèi)生管理. 2018(03)
[3]1例鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病診斷與治療[J]. 魯瑩,韓永剛,鄭澤紅. 養(yǎng)禽與禽病防治. 2017(08)
[4]鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病的防制[J]. 黃解珠,黃欣彥,劉洲,李蘭明. 江西畜牧獸醫(yī)雜志. 2014(06)
[5]鴨對(duì)體吸蟲(chóng)病的診治[J]. 鄒圣紅,鄧華成. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2013(02)
[6]吸蟲(chóng)線粒體基因組及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 賈萬(wàn)忠,閆鴻斌,史萬(wàn)貴,郭愛(ài)疆,詹芳. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(06)
[7]鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病的診治[J]. 倪國(guó)平. 浙江畜牧獸醫(yī). 2010(02)
[8]我國(guó)環(huán)腸科吸蟲(chóng)之研究[J]. 李慶奎,邱兆祉. 天津農(nóng)林科技. 2009(01)
[9]鴨后睪吸蟲(chóng)病研究進(jìn)展[J]. 周霖,盧明科. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2005(05)
[10]鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病的診斷和防治[J]. 全炳昭. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2003(08)
博士論文
[1]牛羊仰口線蟲(chóng)PCR-RFLP鑒別方法的建立及線粒體全基因組序列分析[D]. 王春仁.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]鴨對(duì)體吸蟲(chóng)形態(tài)、生物學(xué)、致病性及分子遺傳學(xué)研究[D]. 楊光友.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]馬五種盅口亞科線蟲(chóng)線粒體全基因組比較與進(jìn)化分析[D]. 高遠(yuǎn).黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2018
[2]圓圃棘口吸蟲(chóng)分子種系發(fā)生的研究[D]. 劉澤軒.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2016
[3]三種三齒線蟲(chóng)線粒體全基因組擴(kuò)增與親緣關(guān)系分析[D]. 段紅.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2016
[4]胰闊盤吸蟲(chóng)分子種系發(fā)生的研究[D]. 鄭旭.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2014
[5]土耳其斯坦東畢吸蟲(chóng)線粒體基因組的研究[D]. 王宇.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2010
[6]四種后睪科吸蟲(chóng)的遺傳多態(tài)性研究[D]. 郭莉.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3685431
【文章頁(yè)數(shù)】:102 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 幾種鴨體內(nèi)重要的吸蟲(chóng)
1.1.1 宮川棘口吸蟲(chóng)
1.1.2 舟形嗜氣管吸蟲(chóng)
1.1.3 鴨對(duì)體吸蟲(chóng)
1.2 吸蟲(chóng)線粒體基因組研究進(jìn)展
1.2.1 吸蟲(chóng)線粒體基因組全序列測(cè)定完成概況
1.2.2 吸蟲(chóng)線粒體基因組的特點(diǎn)
1.3 線粒體基因組的應(yīng)用
1.4 研究目的和意義
2 材料
2.1 蟲(chóng)體采集
2.2 引物設(shè)計(jì)
2.3 主要儀器設(shè)備、試劑、培養(yǎng)基、應(yīng)用的生物信息學(xué)軟件
3 方法
3.1 三種吸蟲(chóng)的鑒定
3.2 蟲(chóng)體總DNA的提取
3.3 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組各部分的擴(kuò)增
3.3.1 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組PCR反應(yīng)條件體系
3.3.2 瓊脂糖凝膠電泳
3.3.3 PCR產(chǎn)物的純化
3.4 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組的拼接和分析
3.5 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組的比較分析
3.6 系統(tǒng)發(fā)生的研究
4 結(jié)果
4.1 三種吸蟲(chóng)的鑒定結(jié)果
4.1.1 三種吸蟲(chóng)的形態(tài)學(xué)鑒定
4.1.2 宮川棘口吸蟲(chóng)的分子生物學(xué)鑒定
4.2 三種吸蟲(chóng)線粒體全基因組序列擴(kuò)增
4.2.1 宮川棘口吸蟲(chóng)序列PCR結(jié)果
4.2.2 舟形嗜氣管吸蟲(chóng)序列PCR結(jié)果
4.2.3 鴨對(duì)體吸蟲(chóng)序列PCR結(jié)果
4.3 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組序列分析
4.3.1 三種吸蟲(chóng)線粒體基因組的特征分析
4.3.2 三種吸蟲(chóng)的t RNA基因和r RNA基因
4.3.3 三種吸蟲(chóng)的非編碼區(qū)
4.3.4 三種吸蟲(chóng)的基因排列順序和密碼子使用情況
4.4 三種吸蟲(chóng)與其它復(fù)殖吸蟲(chóng)同源性比較分析
4.5 親緣關(guān)系分析
5 討論
5.1 吸蟲(chóng)線粒體全基因組的特征分析
5.2 吸蟲(chóng)線粒體12個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因及基因排布情況
5.3 吸蟲(chóng)線粒體t RNA基因和r RNA基因
5.4 進(jìn)化分析
6 結(jié)論
附錄
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]上杭縣番鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病的診治報(bào)告[J]. 許建康. 福建畜牧獸醫(yī). 2018(06)
[2]黑龍江省2016年重點(diǎn)食源性寄生蟲(chóng)病和土源性線蟲(chóng)病調(diào)查分析[J]. 袁爽,邢智鋒,葛濤,尹世輝,唐磊. 中國(guó)公共衛(wèi)生管理. 2018(03)
[3]1例鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病診斷與治療[J]. 魯瑩,韓永剛,鄭澤紅. 養(yǎng)禽與禽病防治. 2017(08)
[4]鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病的防制[J]. 黃解珠,黃欣彥,劉洲,李蘭明. 江西畜牧獸醫(yī)雜志. 2014(06)
[5]鴨對(duì)體吸蟲(chóng)病的診治[J]. 鄒圣紅,鄧華成. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2013(02)
[6]吸蟲(chóng)線粒體基因組及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 賈萬(wàn)忠,閆鴻斌,史萬(wàn)貴,郭愛(ài)疆,詹芳. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(06)
[7]鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病的診治[J]. 倪國(guó)平. 浙江畜牧獸醫(yī). 2010(02)
[8]我國(guó)環(huán)腸科吸蟲(chóng)之研究[J]. 李慶奎,邱兆祉. 天津農(nóng)林科技. 2009(01)
[9]鴨后睪吸蟲(chóng)病研究進(jìn)展[J]. 周霖,盧明科. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2005(05)
[10]鴨舟形嗜氣管吸蟲(chóng)病的診斷和防治[J]. 全炳昭. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2003(08)
博士論文
[1]牛羊仰口線蟲(chóng)PCR-RFLP鑒別方法的建立及線粒體全基因組序列分析[D]. 王春仁.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[2]鴨對(duì)體吸蟲(chóng)形態(tài)、生物學(xué)、致病性及分子遺傳學(xué)研究[D]. 楊光友.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
碩士論文
[1]馬五種盅口亞科線蟲(chóng)線粒體全基因組比較與進(jìn)化分析[D]. 高遠(yuǎn).黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2018
[2]圓圃棘口吸蟲(chóng)分子種系發(fā)生的研究[D]. 劉澤軒.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2016
[3]三種三齒線蟲(chóng)線粒體全基因組擴(kuò)增與親緣關(guān)系分析[D]. 段紅.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2016
[4]胰闊盤吸蟲(chóng)分子種系發(fā)生的研究[D]. 鄭旭.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2014
[5]土耳其斯坦東畢吸蟲(chóng)線粒體基因組的研究[D]. 王宇.黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué) 2010
[6]四種后睪科吸蟲(chóng)的遺傳多態(tài)性研究[D]. 郭莉.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3685431
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