以單、多羔黔北麻羊?yàn)樵囼?yàn)對象,采用PCR法擴(kuò)增克隆獲得黔北麻羊CTSB、CTSD基因CDS區(qū)序列,生物信息學(xué)方法分析黔北麻羊CTSB、CTSD的理化性質(zhì)、蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位情況和信號肽位點(diǎn),并進(jìn)行氨基酸同源性分析構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹;應(yīng)用qRT-PCR法對目的基因在單、多羔黔北麻羊下丘腦、垂體、子宮、輸卵管和卵巢5個性腺組織中的表達(dá)量進(jìn)行差異分析。結(jié)果表明:黔北麻羊CTSB、CTSD基因編碼序列全長為1 008和1 239 bp,共編碼335和412個氨基酸。其蛋白相對分子質(zhì)量分別為36 780和44 590,理論等電點(diǎn)為5.65和7.03,不穩(wěn)定系數(shù)為65.16和37.82。CTSB、CTSD蛋白二級結(jié)構(gòu)均主要由無規(guī)則卷曲構(gòu)成;三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果與二級結(jié)構(gòu)一致,且CTSB蛋白屬于親水性蛋白,信號肽剪切位點(diǎn)位于第17～18號氨基酸,亞細(xì)胞定位發(fā)現(xiàn)CTSB蛋白有66.7%的可能定位于細(xì)胞外;而CTSD屬于疏水性蛋白,信號肽剪切位點(diǎn)位于第22～23號氨基酸,亞細(xì)胞定位表明其有44.4%的可能定位于細(xì)胞外（包括細(xì)胞壁）。與其他動物相比,黔北麻羊CTSB、CTSD編碼氨基酸序列與綿羊的親緣性最... 

【文章頁數(shù)】：11 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)試劑
    1.3 引物的設(shè)計(jì)與合成
    1.4 組織總RNA的提取與cDNA第1鏈的合成
    1.5 實(shí)時熒光定量PCR
    1.6 PCR擴(kuò)增黔北麻羊CTSB、CTSD基因CDS區(qū)
    1.7 目的基因CTSB、CTSD的克隆
    1.8 黔北麻羊CTSB、CTSD基因生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 PCR擴(kuò)增黔北麻羊CTSB、CTSD基因
    2.2 CTSB、CTSD基因在單、多羔黔北麻羊不同組織中的表達(dá)
    2.3 CTSB、CTSD基因T克隆載體的鑒定與測序鑒定
    2.4 黔北麻羊CTSB、CTSD基因CDS區(qū)生物信息學(xué)分析
        2.4.1 黔北麻羊CTSB、CTSD蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析
        2.4.2 黔北麻羊CTSB、CTSD蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)分析與預(yù)測
        2.4.3 黔北麻羊CTSB、CTSD蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位分析與信號肽預(yù)測
        2.4.4 CTSB、CTSD氨基酸同源性分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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