陰道蠅蛆病是目前己知對阿拉善雙峰駝危害性最嚴重的一種寄生蟲病。流行病學調查顯示,即使同一群落阿拉善雙峰駝對陰道蠅蛆病表現(xiàn)出的易感性不同。圍繞這種現(xiàn)象本試驗對阿拉善雙峰駝MHC基因的定位注釋與其陰道微生態(tài)進行了相關的研究。首先采用比較基因組學方法完成了與阿拉善雙峰駝陰道蠅蛆病的易感性和抗性相關的MHC基因的定位及注釋。然后采用高通量測序技術對阿拉善雙峰駝陰道黏膜免疫重要組成部分—陰道微生態(tài)菌群進行了分析,比較了陰道蠅蛆病易感駝與非易感駝陰道菌群的結構和多樣性差異。接著利用ACQUITY UPLC H-Class超高效液相色譜儀對陰道蠅蛆病易感駝與非易感駝陰道分泌物進行了代謝組學分析。最后選擇代謝組學分析中匹配到的3種化合物進行雌性黑須污蠅對寄主信息素類揮發(fā)性化合物的趨向性研究。結果表明:找到并注釋了存在于阿拉善雙峰駝基因組中的24個MHC基因;發(fā)現(xiàn)阿拉善雙峰駝陰道優(yōu)勢菌群結構有較強的穩(wěn)定性,但患病組雙峰駝因陰道菌群中產酸菌屬顯著增多而陰道pH顯著降低,同時在樣本組間門水平和屬水平分別鑒定到差異顯著的分類單元4個和51個,這些菌群的變化可能在阿拉善雙峰駝患陰道蠅蛆病的整個病理周期中多數(shù)與免... 

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略語表
1 引言
    1.1 阿拉善雙峰駝概述
    1.2 阿拉善雙峰駝陰道蠅蛆病概述
        1.2.1 陰道蠅蛆病
        1.2.2 陰道蠅蛆病病原——黑須污蠅幼蟲
        1.2.3 阿拉善雙峰駝陰道蠅蛆病治療現(xiàn)狀
    1.3 陰道黏膜免疫概述
        1.3.1 陰道黏膜免疫系統(tǒng)
        1.3.2 陰道微生態(tài)
        1.3.3 MHC基因
    1.4 昆蟲對寄主揮發(fā)性化合物的趨向性
    1.5 研究目的與意義
2 阿拉善雙峰駝MHC基因的定位及注釋
    2.1 實驗材料
    2.2 實驗方法
        2.2.1 blastn序列比對
        2.2.2 共線性分析
        2.2.3 基因注釋
        2.2.4 繪制系統(tǒng)進化樹
    2.3 實驗結果
        2.3.1 blastn序列對比及拼接
        2.3.2 共線性分析
        2.3.3 BLAT分析
        2.3.4 基因注釋
    2.4 討論與小結
3 阿拉善雙峰駝陰道微生態(tài)菌群多樣性分析
    3.1 實驗材料
        3.1.1 實驗動物
        3.1.2 主要試劑與材料
    3.2 實驗方法
        3.2.1 樣品采集
        3.2.2 微生物組總DNA提取
        3.2.3 目標片段PCR擴增
        3.2.4 擴增產物回收純化
        3.2.5 擴增產物熒光定量
        3.2.6 測序文庫制備
        3.2.7 高通量測序
        3.2.8 原始數(shù)據(jù)處理與樣品序列數(shù)目統(tǒng)計
        3.2.9 OTU劃分和分類地位鑒定
        3.2.10 Alpha多樣性分析
        3.2.11 Beta多樣性分析
        3.2.12 群落結構分析
    3.3 實驗結果
        3.3.1 pH檢測結果
        3.3.2 高通量測序數(shù)據(jù)分析處理結果
        3.3.3 OTU劃分和分類地位鑒定結果
        3.3.4 Alpha多樣性結果
        3.3.5 Beta多樣性分析結果
        3.3.6 群落結構分析結果
    3.4 討論與小結
4 雙峰駝陰道分泌物樣品質譜分析
    4.1 實驗材料與方法
        4.1.1 實驗動物
        4.1.2 主要試劑與材料
        4.1.3 主要儀器
        4.1.4 實驗方法
    4.2 實驗結果
        4.2.1 UPLC-QTof/MS BPI總離子色譜圖
        4.2.2 主要成分結構確定
        4.2.3 多變量統(tǒng)計分析-PCA分析
    4.3 討論與小結
5 雌性黑須污蠅對寄主信息素類揮發(fā)性化合物的趨向性研究
    5.1 實驗材料與方法
        5.1.1 實驗動物
        5.1.2 主要試劑與耗材
    5.2 實驗方法
    5.3 實驗結果
    5.4 討論與小結
6 結論
致謝
參考文獻
作者簡介


【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于比較基因組學分析的方法定位及注釋雙峰駝MHC基因[J]. 支立康,額爾敦木圖,安希文,王超,王瑞,包花爾,王秀珍.  中國農業(yè)科學. 2018(18)
[2]內蒙古地區(qū)健康及患陰道蠅蛆病雙峰駝的主要血液指標比較分析[J]. 姜建強,戴欽,那仁巴圖,哈斯楚魯,白龍,寶山,額爾德木圖,額爾敦木圖.  畜牧與飼料科學. 2016(04)
[3]桔小實蠅雌雄蟲對18種寄主揮發(fā)物的觸角電位差異比較[J]. 譚靜,陳玲,李紅亮,王強,商晗武.  浙江農業(yè)科學. 2016(05)
[4]嗜酸性粒細胞與寄生蟲感染免疫的相關性[J]. 姜建強,額爾敦木圖,包花爾,亢孝珍,巴根那,敖特根巴雅爾.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(03)
[5]中國雙峰駝種質資源保護調查研究[J]. 薩仁圖婭,斯仁達來,付龍霞,劉強德,吉日木圖.  中國草食動物科學. 2015(06)
[6]黏膜免疫系統(tǒng)研究進展[J]. 張欣悅,高永翔,謝怡敏.  中藥與臨床. 2015(05)
[7]MHC基因結構及其功能的研究進展[J]. 李文娟,李巖,李美玉,牟愷,劉思思,潘慶杰.  青島農業(yè)大學學報(自然科學版). 2014(03)
[8]畜禽寄生蟲病的危害及防治[J]. 夏洪偉.  養(yǎng)殖技術顧問. 2014(06)
[9]女性生殖道局部黏膜免疫微環(huán)境[J]. 常凱凱,姚曉英,李大金.  中國免疫學雜志. 2012(12)
[10]阿拉善雙峰駱駝陰道蠅蛆病的發(fā)病調查[J]. 額爾敦木圖,達能太,達能太,王立華,胡畢斯哈拉圖,趙偉.  中國獸醫(yī)雜志. 2012(03)

博士論文
[1]中國主要雙峰駝群體遺傳多樣性、系統(tǒng)進化及mtDNA異質性研究[D]. 何曉紅.中國農業(yè)科學院 2011

碩士論文
[1]黑須污蠅及其幼蟲的形態(tài)學與生活習性研究[D]. 安希文.內蒙古農業(yè)大學 2018
[2]腸道菌群與腸黏膜免疫及相關疾病的研究進展[D]. 王麗娜.重慶醫(yī)科大學 2017
[3]阿拉善雙峰駝人工感染陰道蠅蛆病的細胞因子研究及陰道組織形態(tài)學觀察[D]. 姜建強.內蒙古農業(yè)大學 2016
[4]雙峰駝MHC-DRB基因exon2克隆序列分析及遺傳多樣性研究[D]. 亢孝珍.內蒙古農業(yè)大學 2015



本文編號：3663569