陰道蠅蛆病是目前己知對阿拉善雙峰駝危害性最嚴(yán)重的一種寄生蟲病。流行病學(xué)調(diào)查顯示,即使同一群落阿拉善雙峰駝對陰道蠅蛆病表現(xiàn)出的易感性不同。圍繞這種現(xiàn)象本試驗(yàn)對阿拉善雙峰駝MHC基因的定位注釋與其陰道微生態(tài)進(jìn)行了相關(guān)的研究。首先采用比較基因組學(xué)方法完成了與阿拉善雙峰駝陰道蠅蛆病的易感性和抗性相關(guān)的MHC基因的定位及注釋。然后采用高通量測序技術(shù)對阿拉善雙峰駝陰道黏膜免疫重要組成部分—陰道微生態(tài)菌群進(jìn)行了分析,比較了陰道蠅蛆病易感駝與非易感駝陰道菌群的結(jié)構(gòu)和多樣性差異。接著利用ACQUITY UPLC H-Class超高效液相色譜儀對陰道蠅蛆病易感駝與非易感駝陰道分泌物進(jìn)行了代謝組學(xué)分析。最后選擇代謝組學(xué)分析中匹配到的3種化合物進(jìn)行雌性黑須污蠅對寄主信息素類揮發(fā)性化合物的趨向性研究。結(jié)果表明:找到并注釋了存在于阿拉善雙峰駝基因組中的24個MHC基因;發(fā)現(xiàn)阿拉善雙峰駝陰道優(yōu)勢菌群結(jié)構(gòu)有較強(qiáng)的穩(wěn)定性,但患病組雙峰駝因陰道菌群中產(chǎn)酸菌屬顯著增多而陰道pH顯著降低,同時在樣本組間門水平和屬水平分別鑒定到差異顯著的分類單元4個和51個,這些菌群的變化可能在阿拉善雙峰駝患陰道蠅蛆病的整個病理周期中多數(shù)與免... 

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
縮略語表
1 引言
    1.1 阿拉善雙峰駝概述
    1.2 阿拉善雙峰駝陰道蠅蛆病概述
        1.2.1 陰道蠅蛆病
        1.2.2 陰道蠅蛆病病原——黑須污蠅幼蟲
        1.2.3 阿拉善雙峰駝陰道蠅蛆病治療現(xiàn)狀
    1.3 陰道黏膜免疫概述
        1.3.1 陰道黏膜免疫系統(tǒng)
        1.3.2 陰道微生態(tài)
        1.3.3 MHC基因
    1.4 昆蟲對寄主揮發(fā)性化合物的趨向性
    1.5 研究目的與意義
2 阿拉善雙峰駝MHC基因的定位及注釋
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 blastn序列比對
        2.2.2 共線性分析
        2.2.3 基因注釋
        2.2.4 繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹
    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.3.1 blastn序列對比及拼接
        2.3.2 共線性分析
        2.3.3 BLAT分析
        2.3.4 基因注釋
    2.4 討論與小結(jié)
3 阿拉善雙峰駝陰道微生態(tài)菌群多樣性分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
        3.1.2 主要試劑與材料
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 樣品采集
        3.2.2 微生物組總DNA提取
        3.2.3 目標(biāo)片段PCR擴(kuò)增
        3.2.4 擴(kuò)增產(chǎn)物回收純化
        3.2.5 擴(kuò)增產(chǎn)物熒光定量
        3.2.6 測序文庫制備
        3.2.7 高通量測序
        3.2.8 原始數(shù)據(jù)處理與樣品序列數(shù)目統(tǒng)計(jì)
        3.2.9 OTU劃分和分類地位鑒定
        3.2.10 Alpha多樣性分析
        3.2.11 Beta多樣性分析
        3.2.12 群落結(jié)構(gòu)分析
    3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.3.1 pH檢測結(jié)果
        3.3.2 高通量測序數(shù)據(jù)分析處理結(jié)果
        3.3.3 OTU劃分和分類地位鑒定結(jié)果
        3.3.4 Alpha多樣性結(jié)果
        3.3.5 Beta多樣性分析結(jié)果
        3.3.6 群落結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
    3.4 討論與小結(jié)
4 雙峰駝陰道分泌物樣品質(zhì)譜分析
    4.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
        4.1.2 主要試劑與材料
        4.1.3 主要儀器
        4.1.4 實(shí)驗(yàn)方法
    4.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        4.2.1 UPLC-QTof/MS BPI總離子色譜圖
        4.2.2 主要成分結(jié)構(gòu)確定
        4.2.3 多變量統(tǒng)計(jì)分析-PCA分析
    4.3 討論與小結(jié)
5 雌性黑須污蠅對寄主信息素類揮發(fā)性化合物的趨向性研究
    5.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)動物
        5.1.2 主要試劑與耗材
    5.2 實(shí)驗(yàn)方法
    5.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    5.4 討論與小結(jié)
6 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
作者簡介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[3]桔小實(shí)蠅雌雄蟲對18種寄主揮發(fā)物的觸角電位差異比較[J]. 譚靜,陳玲,李紅亮,王強(qiáng),商晗武.  浙江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(05)
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博士論文
[1]中國主要雙峰駝群體遺傳多樣性、系統(tǒng)進(jìn)化及mtDNA異質(zhì)性研究[D]. 何曉紅.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011

碩士論文
[1]黑須污蠅及其幼蟲的形態(tài)學(xué)與生活習(xí)性研究[D]. 安希文.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]腸道菌群與腸黏膜免疫及相關(guān)疾病的研究進(jìn)展[D]. 王麗娜.重慶醫(yī)科大學(xué) 2017
[3]阿拉善雙峰駝人工感染陰道蠅蛆病的細(xì)胞因子研究及陰道組織形態(tài)學(xué)觀察[D]. 姜建強(qiáng).內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]雙峰駝MHC-DRB基因exon2克隆序列分析及遺傳多樣性研究[D]. 亢孝珍.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015



本文編號：3663569