基于線粒體DNA黑龍江野豬進(jìn)化分析
發(fā)布時間:2022-07-08 11:58
野豬是我國重要野生資源,野豬系統(tǒng)進(jìn)化研究對于闡述家豬起源和進(jìn)化歷史具有重要意義。為研究黑龍江野豬系統(tǒng)進(jìn)化,在黑龍江地區(qū)提取23個野豬樣本,對其線粒體細(xì)胞色素b基因和D-loop高變區(qū)150~591 bp開展測序和進(jìn)化分析。結(jié)果表明,黑龍江野豬Cyt b基因序列遺傳多樣性相對較低,不同地區(qū)野豬親緣關(guān)系符合地理分布;線粒體D-loop區(qū)目標(biāo)序列包括27個SNP位點(diǎn)、21個單倍型,形成兩個類群,類群Ⅰ為古老類群,黑龍江野豬有3個單倍型,包括內(nèi)蒙古野豬和吉林野豬所有單倍型,黑龍江地區(qū)可能為野豬分化中心之一,研究為東北亞地區(qū)野豬起源與進(jìn)化提供理論依據(jù)。
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.1.1 供試動物
1.1.2 供試藥劑
1.2 方法
1.2.1 DNA提取
1.2.2 引物設(shè)計與合成
1.2.3 PCR反應(yīng)體系
1.2.4 克隆測序
1.2.5 遺傳多樣性分析
1.2.6 序列比對和系統(tǒng)進(jìn)化分析
2 結(jié)果與分析
2.1 黑龍江野豬Cyt b基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.1.1 PCR擴(kuò)增及克隆測序
2.1.2 黑龍江野豬Cyt b基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2 黑龍江野豬線粒體D-loop區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2.1 PCR擴(kuò)增與測定
2.2東北亞地區(qū)野豬線粒體D-loop區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 野豬線粒體D-loop區(qū)單倍型鑒定
2.4 東北地區(qū)野豬單倍型組成鑒定與進(jìn)化分析
3 討論
3.1 線粒體DNA
3.2 野豬Cyt b基因系統(tǒng)進(jìn)化
3.3 野豬線粒體D-loop區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化
3.4 黑龍江野豬單倍型進(jìn)化分析
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]淮南豬線粒體DNA D-loop遺傳多樣性及母系起源研究[J]. 徐秋良,段廣瑩,張瀟,朱寬佑,李婉濤,黃炎坤. 中國畜牧雜志. 2020(01)
[2]豬的全基因組測序研究進(jìn)展[J]. 肖瑜,馬海明. 中國畜牧雜志. 2019(05)
[3]民豬全基因組序列測定與分析[J]. 張冬杰,何鑫淼,王文濤,汪亮,劉娣. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(11)
[4]基于線粒體DNAD-loop區(qū)全序列分析藏雞遺傳多樣性及其起源進(jìn)化關(guān)系的研究[J]. 賈曉旭,唐修君,陸俊賢,顧榮,葛慶聯(lián),高玉時,蘇一軍. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(02)
[5]黑龍江省野豬線粒體D-Loop區(qū)的生物信息學(xué)分析[J]. 楊國偉. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(02)
[6]野豬的遺傳學(xué)研究與開發(fā)利用進(jìn)展[J]. 李忠秋,馬建章. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(01)
[7]TYR基因外顯子1的序列變異與家豬的起源研究[J]. 韓洪金,吳桂生,史憲偉,張亞平. 遺傳. 2005(05)
[8]東北亞地區(qū)野豬種群mtDNA遺傳結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)地理發(fā)生[J]. 李崇奇,常青,陳建琴,張保衛(wèi),朱立峰,周開亞. 動物學(xué)報. 2005(04)
碩士論文
[1]線粒體從頭組裝揭示歐亞豬遺傳多樣性及分子進(jìn)化[D]. 倪攀.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]東亞及秦嶺野豬種群遺傳結(jié)構(gòu)和歷史動態(tài)[D]. 張怡.南京師范大學(xué) 2018
本文編號:3656986
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.1.1 供試動物
1.1.2 供試藥劑
1.2 方法
1.2.1 DNA提取
1.2.2 引物設(shè)計與合成
1.2.3 PCR反應(yīng)體系
1.2.4 克隆測序
1.2.5 遺傳多樣性分析
1.2.6 序列比對和系統(tǒng)進(jìn)化分析
2 結(jié)果與分析
2.1 黑龍江野豬Cyt b基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.1.1 PCR擴(kuò)增及克隆測序
2.1.2 黑龍江野豬Cyt b基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2 黑龍江野豬線粒體D-loop區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.2.1 PCR擴(kuò)增與測定
2.2東北亞地區(qū)野豬線粒體D-loop區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化分析
2.3 野豬線粒體D-loop區(qū)單倍型鑒定
2.4 東北地區(qū)野豬單倍型組成鑒定與進(jìn)化分析
3 討論
3.1 線粒體DNA
3.2 野豬Cyt b基因系統(tǒng)進(jìn)化
3.3 野豬線粒體D-loop區(qū)系統(tǒng)進(jìn)化
3.4 黑龍江野豬單倍型進(jìn)化分析
4 結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]淮南豬線粒體DNA D-loop遺傳多樣性及母系起源研究[J]. 徐秋良,段廣瑩,張瀟,朱寬佑,李婉濤,黃炎坤. 中國畜牧雜志. 2020(01)
[2]豬的全基因組測序研究進(jìn)展[J]. 肖瑜,馬海明. 中國畜牧雜志. 2019(05)
[3]民豬全基因組序列測定與分析[J]. 張冬杰,何鑫淼,王文濤,汪亮,劉娣. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(11)
[4]基于線粒體DNAD-loop區(qū)全序列分析藏雞遺傳多樣性及其起源進(jìn)化關(guān)系的研究[J]. 賈曉旭,唐修君,陸俊賢,顧榮,葛慶聯(lián),高玉時,蘇一軍. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2015(02)
[5]黑龍江省野豬線粒體D-Loop區(qū)的生物信息學(xué)分析[J]. 楊國偉. 黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(02)
[6]野豬的遺傳學(xué)研究與開發(fā)利用進(jìn)展[J]. 李忠秋,馬建章. 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2010(01)
[7]TYR基因外顯子1的序列變異與家豬的起源研究[J]. 韓洪金,吳桂生,史憲偉,張亞平. 遺傳. 2005(05)
[8]東北亞地區(qū)野豬種群mtDNA遺傳結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)地理發(fā)生[J]. 李崇奇,常青,陳建琴,張保衛(wèi),朱立峰,周開亞. 動物學(xué)報. 2005(04)
碩士論文
[1]線粒體從頭組裝揭示歐亞豬遺傳多樣性及分子進(jìn)化[D]. 倪攀.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]東亞及秦嶺野豬種群遺傳結(jié)構(gòu)和歷史動態(tài)[D]. 張怡.南京師范大學(xué) 2018
本文編號:3656986
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