脂蛋白脂酶（Lipoprotein lipase, LPL）基因是一種在脂肪代謝過程中起關(guān)鍵作用的蛋白水解酶。LPL基因已被看做是影響IMF的候選基因。提高山羊脂肪沉積能力,有利于獲得與山羊肌肉脂肪性狀相關(guān)的標(biāo)記位點(diǎn)。本研究選用安徽白山羊、波爾山羊、馬頭山羊、濟(jì)寧青山羊、岷山黑裘皮羊、臨朐奶山羊等6種山羊群體為試驗(yàn)動物,采用PCR-SSCP分析方法研究LPL基因的多態(tài)型,并運(yùn)用GLM模型,對檢測出來的的SNP及其與羊IMF的關(guān)聯(lián)分析。1.根據(jù)GenBank上公開發(fā)表的相關(guān)山羊LPL基因,設(shè)計(jì)引物P1-P1o,應(yīng)用PCR-SSCP分析方法在LPL基因上發(fā)現(xiàn)P1-SSCP多態(tài)位點(diǎn),該位點(diǎn)上具有五種基因型AA、BB、AB、AC 和 BC。序列測定結(jié)果表明,P1-SSCP的變異是由堿基G→287A的替換造成的。在P6-SSCP多態(tài)位點(diǎn)上發(fā)現(xiàn)三種基因型AA、BB、 AB。序列測定結(jié)果表明,P6-SSCP變異是由堿基G→16997A的替換造成,Gln→Ser。 在?P7-SSCP多態(tài)位點(diǎn)上發(fā)現(xiàn)三種基因型AA、 BB、 AB。序列測定結(jié)果表明,P7-SSCP變異是由堿基A→18313C替換造成,導(dǎo)致... 

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
前言
    1 脂蛋白脂酶基因(LPL)的研究進(jìn)展
        1.1 LPL基因的定位及序列分析
        1.2 人類LPL的研究進(jìn)展及其在疾病上的研究
        1.3 豬的LPL基因研究進(jìn)展
        1.4 牛的LPL研究進(jìn)展
        1.5 禽類的LPL研究進(jìn)展
    2 SNP研究與PCR-SSCP方法
        2.1 SNP及其研究方法
        2.2 SSCP技術(shù)的建立、原理及其特點(diǎn)
        2.3 PCR-SSCP方法與肌內(nèi)脂肪性狀的研究進(jìn)展
    3 研究目的與意義
第二章 材料與方法
    1 試驗(yàn)群體
    2 試驗(yàn)器材及試劑、軟件
        2.1 主要儀器設(shè)備
        2.2 主要藥品和試劑
        2.3 軟件工具
    3 主要試劑的配置方法
        3.1 溶液配制
    4 試驗(yàn)方法
        4.1 肌內(nèi)脂肪含量(IMF)測定
        4.2 血液DNA的提取
    5 試驗(yàn)引物設(shè)計(jì)與篩選
    6 PCR擴(kuò)增與產(chǎn)物檢測
        6.1 引物的稀釋分裝
        6.2 PCR反應(yīng)體系及反應(yīng)程序的建立
        6.3 10%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳
        6.4 多態(tài)片段的回收純化與測序
    7 統(tǒng)計(jì)分析方法
        7.1 基因頻率和基因型頻率的計(jì)算
        7.2 不同位點(diǎn)遺傳多態(tài)性分析
        7.3 基因型效應(yīng)與肌內(nèi)脂肪含量的關(guān)聯(lián)分析
三.結(jié)果與分析
    1 山羊血液中DNA基因組提取結(jié)果
    2 山羊LPL第1外顯子克隆及序列分析
        2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果
        2.2 山羊LPL第1外顯子PCR-SSCP結(jié)果
        2.3 山羊LPL基因第1外顯子G-287A多態(tài)位點(diǎn)的遺傳分析結(jié)果
    3 山羊LPL第6外顯子克隆及序列分
        3.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果
        3.2 山羊LPL第6外顯子PCR-SSCP結(jié)果
        3.3 山羊LPL基因第6外顯子G-16997A多態(tài)位點(diǎn)的遺傳分析結(jié)果
    4 山羊LPL第7外顯子克隆及序列分析
        4.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果
        4.2 山羊LPL基因第7外顯子多態(tài)位點(diǎn)的遺傳分析結(jié)果
        4.3 山羊LPL基因第7外顯子A-18313C多態(tài)位點(diǎn)的遺傳分析結(jié)果
    5 群體動力學(xué)分析
        5.1 群體間SNP分布
        5.2 LPL三處突變位點(diǎn)基因型與品種的關(guān)系
        5.3 不同基因型與脂肪沉積的相關(guān)性
        5.4 LPL-P1、P6、P7位點(diǎn)多態(tài)性與脂肪沉積的相關(guān)性
        5.5 6個山羊群體間的遺傳距離分析
        5.6 6個山羊群體的系統(tǒng)發(fā)育分析
第四章 討論
    1 血液樣品的采集
    2 影響PCR擴(kuò)增的因素
    3 PCR-SSCP技術(shù)的主要影響因素
    4 山羊LPL基因多態(tài)性及其與脂肪沉積關(guān)聯(lián)分析
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]肌肉生成抑制素基因多態(tài)性與鵝肌內(nèi)脂肪沉積的相關(guān)性分析[J]. 湯青萍,章雙杰,郭軍,鄒劍敏.  現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2011(17)
[2]中國西門塔爾牛MC3R和MC4R基因組織表達(dá)譜及其在脂肪組織中表達(dá)水平與背膘厚度的相關(guān)性研究[J]. 黃萌,許尚忠,李俊雅,高雪,陳金寶.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(04)
[3]豬THRSP基因5′側(cè)翼區(qū)序列轉(zhuǎn)錄調(diào)控活性的鑒定[J]. 陳華,陳宏權(quán),周倩倩,張翼鵬,魏漢卿,李春苗,章孝榮,彭英林.  畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2011(03)
[4]豬甲狀腺激素應(yīng)答Spot14基因編碼區(qū)多態(tài)性與豬產(chǎn)脂能力的關(guān)聯(lián)性[J]. 周倩倩,陳宏權(quán),魏漢卿,秦婕,陳華,張翼鵬.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2011(01)
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博士論文
[1]延邊黃牛肉質(zhì)性狀相關(guān)功能基因研究[D]. 金鑫.延邊大學(xué) 2010
[2]豬脂蛋白脂酶（LPL）和激素敏感脂肪酶（HSL）基因的序列和多態(tài)性分析及體外表達(dá)的研究[D]. 張振波.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005

碩士論文
[1]豬肌內(nèi)脂肪含量候選基因H-FABP研究及預(yù)測模型構(gòu)建[D]. 馬小軍.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[2]昭烏達(dá)羊肉與烏拉特羊肉肉品質(zhì)特性及其PRKAG3、LPL、PPAR基因表達(dá)差異的研究[D]. 陶曉臣.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[3]牦牛LPL和H-FABP基因多態(tài)與生長發(fā)育性狀相關(guān)性研究[D]. 邢成鋒.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
[4]灘羊H-FABP基因和ADD1基因遺傳多態(tài)性及其與肌內(nèi)脂肪含量的關(guān)聯(lián)分析[D]. 喬海云.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2009
[5]雞H-FABP基因PCR-SSCP分析及其與脂肪性狀的相關(guān)研究[D]. 王彥.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
[6]長金豬及其肉質(zhì)性狀候選基因的研究[D]. 孫萬元.浙江大學(xué) 2004



本文編號：3655552