脂蛋白脂酶（Lipoprotein lipase, LPL）基因是一種在脂肪代謝過程中起關鍵作用的蛋白水解酶。LPL基因已被看做是影響IMF的候選基因。提高山羊脂肪沉積能力,有利于獲得與山羊肌肉脂肪性狀相關的標記位點。本研究選用安徽白山羊、波爾山羊、馬頭山羊、濟寧青山羊、岷山黑裘皮羊、臨朐奶山羊等6種山羊群體為試驗動物,采用PCR-SSCP分析方法研究LPL基因的多態(tài)型,并運用GLM模型,對檢測出來的的SNP及其與羊IMF的關聯(lián)分析。1.根據(jù)GenBank上公開發(fā)表的相關山羊LPL基因,設計引物P1-P1o,應用PCR-SSCP分析方法在LPL基因上發(fā)現(xiàn)P1-SSCP多態(tài)位點,該位點上具有五種基因型AA、BB、AB、AC 和 BC。序列測定結果表明,P1-SSCP的變異是由堿基G→287A的替換造成的。在P6-SSCP多態(tài)位點上發(fā)現(xiàn)三種基因型AA、BB、 AB。序列測定結果表明,P6-SSCP變異是由堿基G→16997A的替換造成,Gln→Ser。 在?P7-SSCP多態(tài)位點上發(fā)現(xiàn)三種基因型AA、 BB、 AB。序列測定結果表明,P7-SSCP變異是由堿基A→18313C替換造成,導致... 

【文章頁數(shù)】：57 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
前言
    1 脂蛋白脂酶基因(LPL)的研究進展
        1.1 LPL基因的定位及序列分析
        1.2 人類LPL的研究進展及其在疾病上的研究
        1.3 豬的LPL基因研究進展
        1.4 牛的LPL研究進展
        1.5 禽類的LPL研究進展
    2 SNP研究與PCR-SSCP方法
        2.1 SNP及其研究方法
        2.2 SSCP技術的建立、原理及其特點
        2.3 PCR-SSCP方法與肌內(nèi)脂肪性狀的研究進展
    3 研究目的與意義
第二章 材料與方法
    1 試驗群體
    2 試驗器材及試劑、軟件
        2.1 主要儀器設備
        2.2 主要藥品和試劑
        2.3 軟件工具
    3 主要試劑的配置方法
        3.1 溶液配制
    4 試驗方法
        4.1 肌內(nèi)脂肪含量(IMF)測定
        4.2 血液DNA的提取
    5 試驗引物設計與篩選
    6 PCR擴增與產(chǎn)物檢測
        6.1 引物的稀釋分裝
        6.2 PCR反應體系及反應程序的建立
        6.3 10%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳
        6.4 多態(tài)片段的回收純化與測序
    7 統(tǒng)計分析方法
        7.1 基因頻率和基因型頻率的計算
        7.2 不同位點遺傳多態(tài)性分析
        7.3 基因型效應與肌內(nèi)脂肪含量的關聯(lián)分析
三.結果與分析
    1 山羊血液中DNA基因組提取結果
    2 山羊LPL第1外顯子克隆及序列分析
        2.1 PCR擴增結果
        2.2 山羊LPL第1外顯子PCR-SSCP結果
        2.3 山羊LPL基因第1外顯子G-287A多態(tài)位點的遺傳分析結果
    3 山羊LPL第6外顯子克隆及序列分
        3.1 PCR擴增結果
        3.2 山羊LPL第6外顯子PCR-SSCP結果
        3.3 山羊LPL基因第6外顯子G-16997A多態(tài)位點的遺傳分析結果
    4 山羊LPL第7外顯子克隆及序列分析
        4.1 PCR擴增結果
        4.2 山羊LPL基因第7外顯子多態(tài)位點的遺傳分析結果
        4.3 山羊LPL基因第7外顯子A-18313C多態(tài)位點的遺傳分析結果
    5 群體動力學分析
        5.1 群體間SNP分布
        5.2 LPL三處突變位點基因型與品種的關系
        5.3 不同基因型與脂肪沉積的相關性
        5.4 LPL-P1、P6、P7位點多態(tài)性與脂肪沉積的相關性
        5.5 6個山羊群體間的遺傳距離分析
        5.6 6個山羊群體的系統(tǒng)發(fā)育分析
第四章 討論
    1 血液樣品的采集
    2 影響PCR擴增的因素
    3 PCR-SSCP技術的主要影響因素
    4 山羊LPL基因多態(tài)性及其與脂肪沉積關聯(lián)分析
第五章 結論
參考文獻
致謝
個人簡介


【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[3]牦牛LPL和H-FABP基因多態(tài)與生長發(fā)育性狀相關性研究[D]. 邢成鋒.中國農(nóng)業(yè)科學院 2009
[4]灘羊H-FABP基因和ADD1基因遺傳多態(tài)性及其與肌內(nèi)脂肪含量的關聯(lián)分析[D]. 喬海云.中國農(nóng)業(yè)科學院 2009
[5]雞H-FABP基因PCR-SSCP分析及其與脂肪性狀的相關研究[D]. 王彥.四川農(nóng)業(yè)大學 2006
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本文編號：3655552