發(fā)布時間：2022-02-25 05:01

　　為了探究中國荷斯坦牛DQA2基因的遺傳特性,本研究以中國荷斯坦牛作為研究對象,利用混合DNA擴增產(chǎn)物直接測序的方法對DQA2基因的4個外顯子進行SNPs篩選,并利用生物信息學軟件預測各SNPs對DQA2基因mRNA二級結(jié)構(gòu)的影響。通過序列拼接和序列比對,結(jié)果在荷斯坦牛上檢測到6個SNPs,分別為Exon1-T61A、Exon3-C414T、Exon4-C667G、Exon4-C684T、Exon4-C690T和Exon4-C693T。其中Exon1-T61A和Exon4-C667G是錯義突變,分別導致半胱氨酸（Cys）和精氨酸（Arg）轉(zhuǎn)變?yōu)榻z氨酸（Ser）和甘氨酸（Gly）。荷斯坦牛DQA2基因各SNPs的m RNA二級結(jié)構(gòu)預測顯示野生型和Exon4-C684T的m RNA二級結(jié)構(gòu)自由能都為-248.67kcal/mol,對DQA2基因的二級結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性無影響;而Exon3-C414T、Exon4-C667G和Exon4-C690T降低了DQA2基因mRNA二級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,Exon1-T61A和Exon4-C693T增強了DQA2基因m RNA二級結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。研究結(jié)果為DQA2基因... 

【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 荷斯坦牛DQA2基因4個外顯子
    1.2 荷斯坦牛DQA2基因序列測定比對
    1.3 荷斯坦牛DQA2基因SNP位點基因頻率
    1.4 荷斯坦牛DQA2基因m RNA二級結(jié)構(gòu)預測
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗材料
    3.2 引物設(shè)計
    3.3 構(gòu)建基因組DNA混合池及PCR擴增
    3.4 序列測定與分析
    3.5 等位基因頻率估算
    3.6 生物信息學分析
作者貢獻


【參考文獻】：
期刊論文
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