貴州地方雞種隱性白羽與慢羽分子標(biāo)記研究與應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2022-02-16 17:29
為了準(zhǔn)確鑒定興義矮腳雞白羽系的白羽性狀,本文根據(jù)TYR基因序列和PMEL17序列各分別設(shè)計(jì)了特異性引物各1對(duì),采用PCR直接測(cè)序法鑒定興義矮腳雞白羽系(以下簡(jiǎn)稱XB)和羅曼蛋雞(以下簡(jiǎn)稱LB)的羽色控制基因,建立了地方雞種顯性白羽和隱性白羽分子鑒定方法,開(kāi)展了羅曼蛋雞與興義矮腳白羽系雜交后代中隱性白羽純合子(以下簡(jiǎn)稱YXB)的鑒定和挑選工作。為了鑒定貴州黃雞慢羽系、瑤山雞慢羽系的慢羽性狀,根據(jù)控制慢羽性狀的基因序列,設(shè)計(jì)特異性引物1對(duì),采用PCR直接測(cè)序法對(duì)表型鑒別的貴州黃雞慢羽系(以下簡(jiǎn)稱GHS)和瑤山雞慢羽系(以下簡(jiǎn)稱YSS)個(gè)體進(jìn)行了分子鑒定,同時(shí)設(shè)計(jì)引物鑒定了慢羽公雞純合子,建立了兩個(gè)雞種慢羽性狀分子標(biāo)記鑒定方法;統(tǒng)計(jì)了貴州黃雞、瑤山雞不同世代慢羽羽型的變化規(guī)律,探討了不同羽型對(duì)羽毛和體重的影響。結(jié)果如下:(1)經(jīng)分子鑒定,檢測(cè)到興義矮腳雞白羽系中TYR基因196bp的插入片段,測(cè)序后比對(duì)與原序列一致,未檢測(cè)到PMEL17基因的160bp插入片段,判定興義矮腳雞白羽系為T(mén)YR基因控制的隱性白羽雞,基因型為iicc;檢測(cè)到羅曼蛋雞PMEL17基因160bp的插入片段,測(cè)序后比對(duì)與...
【文章來(lái)源】:貴州大學(xué)貴州省211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Summary
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 前言
1.2 白羽雞的研究現(xiàn)狀與應(yīng)用
1.2.1 羽色性狀的研究
1.2.2 隱性白羽雞的現(xiàn)狀
1.2.3 隱性白羽雞在育種中的應(yīng)用
1.3 快慢羽雞的研究現(xiàn)狀與應(yīng)用
1.3.1 快慢羽性狀的研究
1.3.2 快慢羽的現(xiàn)狀
1.3.3 快慢羽雞在育種中的應(yīng)用
1.4 試驗(yàn)雞品種介紹
1.4.1 貴州興義矮腳雞白羽系
1.4.2 貴州黃雞
1.4.3 瑤山雞
1.5 遺傳標(biāo)記概述
1.5.1 分子標(biāo)記
1.5.2 分子標(biāo)記在動(dòng)物育種中的應(yīng)用
1.6 研究的目的意義與技術(shù)路線
1.6.1 目的意義
1.6.2 技術(shù)路線
第二章 興義矮腳雞白羽系TYR、PMEL17 基因檢測(cè)與應(yīng)用
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 樣本的采集
2.1.2 試驗(yàn)主要的儀器設(shè)備
2.1.3 試驗(yàn)主要的試劑及溶液
2.1.4 主要數(shù)據(jù)分析軟件及在線網(wǎng)站
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 種蛋的收集與孵化
2.2.2 試驗(yàn)動(dòng)物基因組DNA提取
2.2.3 基因組DNA檢測(cè)
2.2.4 基因組DNA濃度與純度的檢測(cè)
2.3 PMEL17、TYR基因PCR反應(yīng)
2.3.1 引物設(shè)計(jì)
2.3.2 引物溶解與稀釋
2.3.3 PCR反應(yīng)的體系
2.3.4 基因型鑒定
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 基因組DNA提取結(jié)果
2.4.2 PMEL17 位點(diǎn)基因型分析
2.4.3 PMEL17 位點(diǎn)PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果
2.4.4 TYR位點(diǎn)基因型分析
2.4.5 TYR位點(diǎn)PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果
2.4.6 興義矮腳雞白羽系個(gè)體隱性基因鑒定
2.4.7 白羽雞在育種中的應(yīng)用
2.5 討論
2.5.1 興義矮腳雞白羽系在地方雞配套生產(chǎn)中的應(yīng)用前景
2.5.2 興義矮腳雞白羽系隱性基因檢測(cè)
2.6 小結(jié)
第三章 貴州黃雞、瑤山雞快慢羽基因的檢測(cè)與應(yīng)用
3.1 試驗(yàn)材料
3.1.1 樣本的采集
3.1.2 試驗(yàn)主要的儀器
3.1.3 試驗(yàn)主要的試劑及溶液
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 種蛋的選取與孵化
3.2.2 試驗(yàn)動(dòng)物基因組DNA提取
3.2.3 基因組DNA檢測(cè)
3.2.4 基因組DNA濃度與純度的檢測(cè)
3.2.5 主要數(shù)據(jù)分析軟件及在線網(wǎng)站
3.2.6 快慢羽表型鑒定
3.2.7 羽毛長(zhǎng)度測(cè)定
3.2.8 體重測(cè)定
3.3 快慢羽基因PCR反應(yīng)
3.3.1 引物設(shè)計(jì)
3.3.2 引物溶解與稀釋
3.3.3 PCR反應(yīng)的體系
3.4 結(jié)果與分析
3.4.1 基因組DNA提取結(jié)果
3.4.2 羽速類(lèi)型的分子鑒定結(jié)果分析
3.4.3 慢羽公雞分型檢測(cè)結(jié)果分析
3.4.4 慢羽公雞分型基因SNP
3.4.5 貴州黃雞、瑤山雞慢羽系分子鑒定
3.4.6 貴州黃雞、瑤山雞快慢羽系自別雌雄配套雜交效果
3.4.7 不同世代貴州黃雞、瑤山雞慢羽羽型變化
3.4.8 不同羽型對(duì)羽毛生長(zhǎng)和體重的影響
3.5 討論
3.5.1 貴州黃雞、瑤山雞慢羽性狀分子鑒定
3.5.2 不同羽型對(duì)雞羽毛生長(zhǎng)的影響
3.6 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
論文使用的符號(hào)和縮寫(xiě)詞(Abbreviations)
致謝
附錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]四川山地烏骨雞黃羽系快、慢羽群體羽毛和體重的早期發(fā)育分析及基因型鑒定[J]. 鐘成麟,王麗云,張小敏,朱慶,王彥,尹華東,舒剛,歐達(dá)亮,趙小玲. 中國(guó)家禽. 2018(22)
[2]DNA分子標(biāo)記技術(shù)的研究與應(yīng)用[J]. 陳星,高子厚. 分子植物育種. 2019(06)
[3]瑤山雞慢羽系羽型與出殼體重相關(guān)性研究[J]. 林家棟,張福平,龔俞,李雪松,張游宇,任麗群,李洪林,祖盤(pán)玉,吳立鑫,李維. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(15)
[4]羽速基因?qū)︺宕豕呛陔u膚色性狀和體重的影響[J]. 喻世剛,王鋼,廖娟,曾昌巧. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(10)
[5]雞快慢羽性狀遺傳學(xué)基礎(chǔ)分析綜合實(shí)驗(yàn)探索與實(shí)踐[J]. 張麗,徐海冬,冷奇穎,劉艷芬,趙志輝,效梅,吳江,張權(quán),安立龍. 遺傳. 2018(03)
[6]盔頂珍珠雞快慢羽基因分型及早期性別鑒定[J]. 王章,袁泳蘭,包志江,李婷,董晶,安立龍,效梅,杜炳旺,張麗. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(05)
[7]雞內(nèi)源白血病病毒ev21與慢羽非連鎖分析和LTR區(qū)啟動(dòng)子活性分析[J]. 王麒,王晗,張秀玲,劉春楊,張樂(lè)超,李蘭會(huì),李祥龍. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(05)
[8]慢羽系麒麟公雞純合個(gè)體分子檢測(cè)方法的建立[J]. 李珊珊,李東華,呂福琨,董晶,李艷青,杜炳旺. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(07)
[9]壩上長(zhǎng)尾雞快、慢羽系繁育及配套應(yīng)用技術(shù)方案初探[J]. 吳占福,劉立文,劉海斌,張立永,董衛(wèi)英. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(08)
[10]他留烏骨雞TYR基因多態(tài)性與色素性狀相關(guān)性分析[J]. 陸曉屏,滕召純,李慶華,孫利民,王玉祥,張斌,史憲偉. 中國(guó)家禽. 2015(17)
博士論文
[1]REV感染對(duì)SPF雛雞miRNA及其靶基因mRNA表達(dá)的影響[D]. 于志強(qiáng).東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]輪作條件下長(zhǎng)期施肥對(duì)棕壤微生物群落的影響[D]. 羅培宇.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]牦牛絨毛和免疫性狀相關(guān)基因研究[D]. 沙日耐.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[4]小麥抗條銹病遺傳資源評(píng)價(jià)及抗性新基因發(fā)掘[D]. 蒲宗君.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]我國(guó)北方羊種布魯氏菌流行株的遺傳多態(tài)性分析[D]. 王勛.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]口蝦蛄不同地理群體線粒體DNA控制區(qū)和轉(zhuǎn)錄組變異研究[D]. 張陽(yáng).浙江海洋大學(xué) 2018
[3]小麥RIL群體遺傳圖譜的構(gòu)建及粒長(zhǎng)、粒寬和千粒重的QTL定位分析[D]. 張心如.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]內(nèi)蒙古沙蔥螢葉甲種群的遺傳多樣性和遺傳分化[D]. 張鵬飛.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]雞快慢羽候選基因的篩選[D]. 趙計(jì)昌.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[6]紅腹錦雞胚胎羽毛毛囊發(fā)育及β-catenin在胚胎皮膚中的表達(dá)[D]. 郝玉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[7]布氏田鼠封閉群遺傳學(xué)檢測(cè)及社會(huì)行為學(xué)研究[D]. 張曼.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
[8]核輻射對(duì)實(shí)驗(yàn)紅鯽損傷的毒理學(xué)及AFLP分子標(biāo)記的研究[D]. 廖小立.南華大學(xué) 2015
[9]家蠶新突變體紫色類(lèi)鶉斑q-lp的定位分析[D]. 王平陽(yáng).江蘇科技大學(xué) 2015
[10]條石鯛微衛(wèi)星性別特異標(biāo)記篩選及子代家系的遺傳分析[D]. 孫鑫序.浙江海洋學(xué)院 2014
本文編號(hào):3628364
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【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Summary
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 前言
1.2 白羽雞的研究現(xiàn)狀與應(yīng)用
1.2.1 羽色性狀的研究
1.2.2 隱性白羽雞的現(xiàn)狀
1.2.3 隱性白羽雞在育種中的應(yīng)用
1.3 快慢羽雞的研究現(xiàn)狀與應(yīng)用
1.3.1 快慢羽性狀的研究
1.3.2 快慢羽的現(xiàn)狀
1.3.3 快慢羽雞在育種中的應(yīng)用
1.4 試驗(yàn)雞品種介紹
1.4.1 貴州興義矮腳雞白羽系
1.4.2 貴州黃雞
1.4.3 瑤山雞
1.5 遺傳標(biāo)記概述
1.5.1 分子標(biāo)記
1.5.2 分子標(biāo)記在動(dòng)物育種中的應(yīng)用
1.6 研究的目的意義與技術(shù)路線
1.6.1 目的意義
1.6.2 技術(shù)路線
第二章 興義矮腳雞白羽系TYR、PMEL17 基因檢測(cè)與應(yīng)用
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 樣本的采集
2.1.2 試驗(yàn)主要的儀器設(shè)備
2.1.3 試驗(yàn)主要的試劑及溶液
2.1.4 主要數(shù)據(jù)分析軟件及在線網(wǎng)站
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 種蛋的收集與孵化
2.2.2 試驗(yàn)動(dòng)物基因組DNA提取
2.2.3 基因組DNA檢測(cè)
2.2.4 基因組DNA濃度與純度的檢測(cè)
2.3 PMEL17、TYR基因PCR反應(yīng)
2.3.1 引物設(shè)計(jì)
2.3.2 引物溶解與稀釋
2.3.3 PCR反應(yīng)的體系
2.3.4 基因型鑒定
2.4 結(jié)果與分析
2.4.1 基因組DNA提取結(jié)果
2.4.2 PMEL17 位點(diǎn)基因型分析
2.4.3 PMEL17 位點(diǎn)PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果
2.4.4 TYR位點(diǎn)基因型分析
2.4.5 TYR位點(diǎn)PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果
2.4.6 興義矮腳雞白羽系個(gè)體隱性基因鑒定
2.4.7 白羽雞在育種中的應(yīng)用
2.5 討論
2.5.1 興義矮腳雞白羽系在地方雞配套生產(chǎn)中的應(yīng)用前景
2.5.2 興義矮腳雞白羽系隱性基因檢測(cè)
2.6 小結(jié)
第三章 貴州黃雞、瑤山雞快慢羽基因的檢測(cè)與應(yīng)用
3.1 試驗(yàn)材料
3.1.1 樣本的采集
3.1.2 試驗(yàn)主要的儀器
3.1.3 試驗(yàn)主要的試劑及溶液
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 種蛋的選取與孵化
3.2.2 試驗(yàn)動(dòng)物基因組DNA提取
3.2.3 基因組DNA檢測(cè)
3.2.4 基因組DNA濃度與純度的檢測(cè)
3.2.5 主要數(shù)據(jù)分析軟件及在線網(wǎng)站
3.2.6 快慢羽表型鑒定
3.2.7 羽毛長(zhǎng)度測(cè)定
3.2.8 體重測(cè)定
3.3 快慢羽基因PCR反應(yīng)
3.3.1 引物設(shè)計(jì)
3.3.2 引物溶解與稀釋
3.3.3 PCR反應(yīng)的體系
3.4 結(jié)果與分析
3.4.1 基因組DNA提取結(jié)果
3.4.2 羽速類(lèi)型的分子鑒定結(jié)果分析
3.4.3 慢羽公雞分型檢測(cè)結(jié)果分析
3.4.4 慢羽公雞分型基因SNP
3.4.5 貴州黃雞、瑤山雞慢羽系分子鑒定
3.4.6 貴州黃雞、瑤山雞快慢羽系自別雌雄配套雜交效果
3.4.7 不同世代貴州黃雞、瑤山雞慢羽羽型變化
3.4.8 不同羽型對(duì)羽毛生長(zhǎng)和體重的影響
3.5 討論
3.5.1 貴州黃雞、瑤山雞慢羽性狀分子鑒定
3.5.2 不同羽型對(duì)雞羽毛生長(zhǎng)的影響
3.6 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
論文使用的符號(hào)和縮寫(xiě)詞(Abbreviations)
致謝
附錄
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]四川山地烏骨雞黃羽系快、慢羽群體羽毛和體重的早期發(fā)育分析及基因型鑒定[J]. 鐘成麟,王麗云,張小敏,朱慶,王彥,尹華東,舒剛,歐達(dá)亮,趙小玲. 中國(guó)家禽. 2018(22)
[2]DNA分子標(biāo)記技術(shù)的研究與應(yīng)用[J]. 陳星,高子厚. 分子植物育種. 2019(06)
[3]瑤山雞慢羽系羽型與出殼體重相關(guān)性研究[J]. 林家棟,張福平,龔俞,李雪松,張游宇,任麗群,李洪林,祖盤(pán)玉,吳立鑫,李維. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(15)
[4]羽速基因?qū)︺宕豕呛陔u膚色性狀和體重的影響[J]. 喻世剛,王鋼,廖娟,曾昌巧. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(10)
[5]雞快慢羽性狀遺傳學(xué)基礎(chǔ)分析綜合實(shí)驗(yàn)探索與實(shí)踐[J]. 張麗,徐海冬,冷奇穎,劉艷芬,趙志輝,效梅,吳江,張權(quán),安立龍. 遺傳. 2018(03)
[6]盔頂珍珠雞快慢羽基因分型及早期性別鑒定[J]. 王章,袁泳蘭,包志江,李婷,董晶,安立龍,效梅,杜炳旺,張麗. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(05)
[7]雞內(nèi)源白血病病毒ev21與慢羽非連鎖分析和LTR區(qū)啟動(dòng)子活性分析[J]. 王麒,王晗,張秀玲,劉春楊,張樂(lè)超,李蘭會(huì),李祥龍. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(05)
[8]慢羽系麒麟公雞純合個(gè)體分子檢測(cè)方法的建立[J]. 李珊珊,李東華,呂福琨,董晶,李艷青,杜炳旺. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(07)
[9]壩上長(zhǎng)尾雞快、慢羽系繁育及配套應(yīng)用技術(shù)方案初探[J]. 吳占福,劉立文,劉海斌,張立永,董衛(wèi)英. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2016(08)
[10]他留烏骨雞TYR基因多態(tài)性與色素性狀相關(guān)性分析[J]. 陸曉屏,滕召純,李慶華,孫利民,王玉祥,張斌,史憲偉. 中國(guó)家禽. 2015(17)
博士論文
[1]REV感染對(duì)SPF雛雞miRNA及其靶基因mRNA表達(dá)的影響[D]. 于志強(qiáng).東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]輪作條件下長(zhǎng)期施肥對(duì)棕壤微生物群落的影響[D]. 羅培宇.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[3]牦牛絨毛和免疫性狀相關(guān)基因研究[D]. 沙日耐.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[4]小麥抗條銹病遺傳資源評(píng)價(jià)及抗性新基因發(fā)掘[D]. 蒲宗君.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
碩士論文
[1]我國(guó)北方羊種布魯氏菌流行株的遺傳多態(tài)性分析[D]. 王勛.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]口蝦蛄不同地理群體線粒體DNA控制區(qū)和轉(zhuǎn)錄組變異研究[D]. 張陽(yáng).浙江海洋大學(xué) 2018
[3]小麥RIL群體遺傳圖譜的構(gòu)建及粒長(zhǎng)、粒寬和千粒重的QTL定位分析[D]. 張心如.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]內(nèi)蒙古沙蔥螢葉甲種群的遺傳多樣性和遺傳分化[D]. 張鵬飛.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[5]雞快慢羽候選基因的篩選[D]. 趙計(jì)昌.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[6]紅腹錦雞胚胎羽毛毛囊發(fā)育及β-catenin在胚胎皮膚中的表達(dá)[D]. 郝玉.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[7]布氏田鼠封閉群遺傳學(xué)檢測(cè)及社會(huì)行為學(xué)研究[D]. 張曼.北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院 2015
[8]核輻射對(duì)實(shí)驗(yàn)紅鯽損傷的毒理學(xué)及AFLP分子標(biāo)記的研究[D]. 廖小立.南華大學(xué) 2015
[9]家蠶新突變體紫色類(lèi)鶉斑q-lp的定位分析[D]. 王平陽(yáng).江蘇科技大學(xué) 2015
[10]條石鯛微衛(wèi)星性別特異標(biāo)記篩選及子代家系的遺傳分析[D]. 孫鑫序.浙江海洋學(xué)院 2014
本文編號(hào):3628364
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