DDX18負(fù)調(diào)控IFN-β產(chǎn)生的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間：2022-02-09 22:06
轉(zhuǎn)錄因子IRF3（Interferon regulation factor 3）在I型干擾素（Interferon,IFN）產(chǎn)生途徑中發(fā)揮非常重要的作用,模式識別受體TLRs（Toll-like receptors）和RLRs（RIG-I-like receptors）介導(dǎo)的I型干擾素產(chǎn)生都通過激活I(lǐng)RF3,使IRF3入核并結(jié)合到I型干擾素啟動子上的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),誘導(dǎo)I型干擾素產(chǎn)生。干擾素產(chǎn)生途徑是被精細(xì)調(diào)控的,宿主體內(nèi)存在多種分子調(diào)控I型干擾素產(chǎn)生。以前,關(guān)于宿主因子或病原編碼蛋白如何調(diào)控IRF3的激活已經(jīng)有大量的報(bào)道,但大部分研究都集中在對細(xì)胞質(zhì)中IRF3激活的調(diào)控,對于細(xì)胞核中的分子如何調(diào)控IRF3,尤其是負(fù)調(diào)控IRF3的研究報(bào)道很少。為了探討細(xì)胞核中的分子調(diào)控IRF3的機(jī)制,本課題從篩選與IRF3相互作用的細(xì)胞核蛋白著手,證實(shí)DEAD-box RNA解旋酶家族成員DDX18與IRF3存在相互作用并負(fù)調(diào)控IRF3介導(dǎo)的IFN-β啟動子激活,在此基礎(chǔ)上,對DDX18如何負(fù)調(diào)控IRF3誘導(dǎo)IFN-β產(chǎn)生的機(jī)制進(jìn)行了深入研究。主要研究內(nèi)容與結(jié)果如下:1.細(xì)胞核內(nèi)IRF3的互作組學(xué)研...
【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：73 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
RNA解旋酶發(fā)揮的生物功能（Cordinetal.,2006）
圖 1-3 DEAD box RNA 解旋酶核心區(qū)域晶體結(jié)構(gòu)（Bleichert et al., 2007）Fig.1-3 Crystal Structures of the DEAD Box RNAHelicase Cores.2 DEAD-box RNA 解旋酶與病毒的關(guān)系病毒需要宿主細(xì)胞的成分（如酶、脂類），包括解旋酶，來執(zhí)行其 RNA 加工或復(fù)制過程。由此可知，如果病毒自身不具有解旋酶，它必須利用宿主細(xì)胞自身分來實(shí)現(xiàn)這一功能。然而，除了作為解旋酶的作用外，DEAD-box 蛋白的一些經(jīng)典功能似乎會被病毒利用以完成其復(fù)制。其中被研究較清楚的有 HIV-1 與X1（Fang et al., 2004）、DDX3（Naji et al., 2012）、DDX5、DDX17（Lorgoux et al3）。隨著對病毒復(fù)制相關(guān)宿主因子研究的不斷深入，發(fā)現(xiàn)越來越多的 DEAD-bo酶與病毒復(fù)制有關(guān)。DDX1 與 DEAD-box 家族其它成員有所不同，因?yàn)樗粋�(gè)稱為 SPRY 結(jié)構(gòu) 220 個(gè)氨基酸序列的插入，位于核心區(qū)域內(nèi)的兩個(gè)基序 I（WalkerA）和 Ia 之間odbout et al., 1994; Jankowsky et al., 2007）。它已經(jīng)被證明參與多種細(xì)胞進(jìn)程，包mRNA 或 microRNA 加工（Bleoo et al., 2001; Han et al., 2014），通過 hnRNPK 復(fù)
DDX18 負(fù)調(diào)控 IFN-β 產(chǎn)生的機(jī)制研究。敲低 DDX17 降低 50%的 ZAP 功能（Chen et al., 2008）。DDX17 可降解多種RNA，包括小鼠白血病病毒（Chen et al., 2008; Guo et al., 2007）、埃博拉病毒、病毒（Müller et al., 2007）和 HIV-1（Zhu et al., 2011），但是其前提條件是存P 反應(yīng)元件（Chen et al., 2008）。相反，對于流感病毒，DDX17 則是促進(jìn)其復(fù) A549 細(xì)胞中，用 siRNA 干擾 DDX17、DDX5 和 DDX3X 后，病毒滴度均顯（Bortz et al., 2011）。此外，當(dāng)缺少這些解旋酶時(shí)，病毒聚合酶活性降低，說過直接互作或相關(guān)轉(zhuǎn)錄輔因子對病毒聚合酶產(chǎn)生影響。有趣的是，DDX17 似了 H5N1 人類分離株（pb2 627 K 型）的聚合酶活性，但降低了鳥類突變株（pb2型）的聚合酶活性，這一發(fā)現(xiàn)也在超表達(dá)實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證（Bortz et al., 2011）。纖維細(xì)胞相比，敲低禽 DDX17 再次顯示了 DDX17 對于流感病毒復(fù)制的必要時(shí)也在流感病毒適應(yīng)人類細(xì)胞的過程中發(fā)揮了作用。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Understanding the interaction of hepatitis C virus with host DEAD-box RNA helicases[J]. Megha Haridas Upadya,Jude Juventus Aweya,Yee-Joo Tan. World Journal of Gastroenterology. 2014(11)
本文編號：3617720
【文章來源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：73 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
RNA解旋酶發(fā)揮的生物功能（Cordinetal.,2006）
圖 1-3 DEAD box RNA 解旋酶核心區(qū)域晶體結(jié)構(gòu)（Bleichert et al., 2007）Fig.1-3 Crystal Structures of the DEAD Box RNAHelicase Cores.2 DEAD-box RNA 解旋酶與病毒的關(guān)系病毒需要宿主細(xì)胞的成分（如酶、脂類），包括解旋酶，來執(zhí)行其 RNA 加工或復(fù)制過程。由此可知，如果病毒自身不具有解旋酶，它必須利用宿主細(xì)胞自身分來實(shí)現(xiàn)這一功能。然而，除了作為解旋酶的作用外，DEAD-box 蛋白的一些經(jīng)典功能似乎會被病毒利用以完成其復(fù)制。其中被研究較清楚的有 HIV-1 與X1（Fang et al., 2004）、DDX3（Naji et al., 2012）、DDX5、DDX17（Lorgoux et al3）。隨著對病毒復(fù)制相關(guān)宿主因子研究的不斷深入，發(fā)現(xiàn)越來越多的 DEAD-bo酶與病毒復(fù)制有關(guān)。DDX1 與 DEAD-box 家族其它成員有所不同，因?yàn)樗粋�(gè)稱為 SPRY 結(jié)構(gòu) 220 個(gè)氨基酸序列的插入，位于核心區(qū)域內(nèi)的兩個(gè)基序 I（WalkerA）和 Ia 之間odbout et al., 1994; Jankowsky et al., 2007）。它已經(jīng)被證明參與多種細(xì)胞進(jìn)程，包mRNA 或 microRNA 加工（Bleoo et al., 2001; Han et al., 2014），通過 hnRNPK 復(fù)
DDX18 負(fù)調(diào)控 IFN-β 產(chǎn)生的機(jī)制研究。敲低 DDX17 降低 50%的 ZAP 功能（Chen et al., 2008）。DDX17 可降解多種RNA，包括小鼠白血病病毒（Chen et al., 2008; Guo et al., 2007）、埃博拉病毒、病毒（Müller et al., 2007）和 HIV-1（Zhu et al., 2011），但是其前提條件是存P 反應(yīng)元件（Chen et al., 2008）。相反，對于流感病毒，DDX17 則是促進(jìn)其復(fù) A549 細(xì)胞中，用 siRNA 干擾 DDX17、DDX5 和 DDX3X 后，病毒滴度均顯（Bortz et al., 2011）。此外，當(dāng)缺少這些解旋酶時(shí)，病毒聚合酶活性降低，說過直接互作或相關(guān)轉(zhuǎn)錄輔因子對病毒聚合酶產(chǎn)生影響。有趣的是，DDX17 似了 H5N1 人類分離株（pb2 627 K 型）的聚合酶活性，但降低了鳥類突變株（pb2型）的聚合酶活性，這一發(fā)現(xiàn)也在超表達(dá)實(shí)驗(yàn)中得到驗(yàn)證（Bortz et al., 2011）。纖維細(xì)胞相比，敲低禽 DDX17 再次顯示了 DDX17 對于流感病毒復(fù)制的必要時(shí)也在流感病毒適應(yīng)人類細(xì)胞的過程中發(fā)揮了作用。
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Understanding the interaction of hepatitis C virus with host DEAD-box RNA helicases[J]. Megha Haridas Upadya,Jude Juventus Aweya,Yee-Joo Tan. World Journal of Gastroenterology. 2014(11)
本文編號：3617720
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