為了從分子水平對(duì)4株滑液囊支原體（Mycoplasma synoviae,MS）分離株進(jìn)行鑒定,同時(shí)分析其膜蛋白vlhA的基因序列以及蛋白的功能結(jié)構(gòu)域。通過PCR擴(kuò)增其16S rRNA和vlhA基因序列,以16S rRNA序列構(gòu)建分子進(jìn)化樹并分析4株MS分離株和其他支原體參考株的同源性;利用生物信息學(xué)工具對(duì)vlhA基因的核酸序列和蛋白序列進(jìn)行分析,查找其保守結(jié)構(gòu)域,預(yù)測(cè)其可能具有的功能。結(jié)果表明,4株MS分離株在16S rRNA基因序列上與MS不同菌株具有同源性,可以確定為滑液囊支原體;其vlhA基因序列分為保守區(qū)和高變區(qū),保守區(qū)和部分高變區(qū)組成主要膜抗原基因MSPB;vlhA蛋白共含有10個(gè)保守的結(jié)構(gòu)域,7個(gè)保守域位于保守區(qū),8個(gè)保守域位于MSPB區(qū),其中的75 Asp～425 Asn之間的氨基酸殘基預(yù)測(cè)與細(xì)胞黏附有關(guān);75 Asp～126 Val與129 Val～206 Val之間的氨基酸殘基為免疫球蛋白超家族結(jié)構(gòu),與受體/配體功能相關(guān),可能都參與MS感染宿主的過程。 

【文章來源】：中國獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,40(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

16S rRNA基因序列PCR 擴(kuò)增結(jié)果

vlhA基因PCR擴(kuò)增結(jié)果

應(yīng)用 DNAStar 軟件,對(duì) vlhA 蛋白的抗原表位進(jìn)行預(yù)測(cè)(圖9),可看出 vlhA蛋白存在多個(gè)潛在的抗原表位位點(diǎn),可能的蛋白質(zhì)抗原表位區(qū)域:1～11,28～126,142～165,173～202,209～219,223～230,236～252,262～271,275～298,314～319,323～345,375～401,407～414,421～440,452～469,479～501,510～523,530～547,573～591,614～634,654～662,677～698,741～770。圖4 vlhA保守區(qū)和高變區(qū)序列比對(duì)結(jié)果

【參考文獻(xiàn)】：
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