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基于睪丸測序的雞精子活力性狀mRNA-miRNA-lncRNA轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究

發(fā)布時間:2022-01-27 09:01
  精子活力是評價種公雞繁殖潛力的重要指標(biāo),對家禽生產(chǎn)、制種和育種等多個環(huán)節(jié)都有著至關(guān)重要的影響。調(diào)查顯示,我國地方雞普遍存在精子活力偏低的情況,弱精癥(精子活力低下)個體比例偏高。精子活力性狀遺傳力較高,但目前家禽精子活力的分子調(diào)控機(jī)制仍不清楚。因此,尋找雞精子活力性狀的分子標(biāo)記物,利用分子育種方法剔除弱精個體,對于加快家禽品種繁殖性能選育進(jìn)展,提高地方雞產(chǎn)業(yè)化水平有重要的實踐意義。本研究選擇具有極端精子活力表型的北京油雞公雞作為研究對象,利用高通量測序技術(shù)分析睪丸組織中表達(dá)的mRNA、lncRNA和miRNA,篩選鑒定與雞精子活力相關(guān)的基因和非編碼RNA以及相關(guān)的信號通路,并通過構(gòu)建mRNA-miRNA-lncRNA互作網(wǎng)絡(luò),在轉(zhuǎn)錄水平鑒定參與雞精子活力調(diào)控的分子機(jī)制。主要研究內(nèi)容和結(jié)果如下:通過對200只北京油雞公雞進(jìn)行精液品質(zhì)測定,建立了高、低精子活力公雞樣本組,各20只公雞。比較發(fā)現(xiàn),總體上高精子活力公雞的繁殖指標(biāo)優(yōu)于低精子活力公雞,其中種蛋受精率與精子活力的關(guān)聯(lián)程度最高,睪丸組織切片觀察發(fā)現(xiàn),低精子活力公雞睪丸生精上皮完整性較差。對高、低精子活力公雞睪丸進(jìn)行l(wèi)ncRNA測序,共... 

【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:112 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

基于睪丸測序的雞精子活力性狀mRNA-miRNA-lncRNA轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究


圖3-5?IncRNA和mRNA的外顯子數(shù)目分布??

長度分布,長度分布,外顯子


圖3-4?IncRNA和mRNA的長度分布??Figure?3-4?Length?distribution?of?IncRNAs?and?mRNAs??由圖3-5可以看出,大多數(shù)(78.2%)的IncRNA擁有3個或更少的外顯子,而多數(shù)(76.9%)??mRNA外顯子數(shù)目超過5個。與之前報道的雞骨骼。桑睿悖遥危料啾龋ǎ蹋?etal.2016d),睪丸IncRNA??的長度較短,但外顯子數(shù)目接近。??060?■?IncRNA?"mRNA??;I?I??I?0.30?■??:L?L?■■?■■?■!?I??2?3?4?5?6-10?>10??Exon?number??圖3-5?IncRNA和mRNA的外顯子數(shù)目分布??Figure?3-5?Exon?number?distribution?of?IncRNAs?and?mRNAs??表達(dá)量水平方面,通過Stringtie軟件對IncRNA和mRNA進(jìn)行定量分析,發(fā)現(xiàn)雞華丸??IncRNA的表達(dá)水平顯著低于mRNA?(圖3-6)。??25??

序列,睪丸,染色體,小鼠


??圖3-6?IncRNA的表達(dá)特征??Figure?3-6?Expression?feature?of?IncRNAs?and?mRNAs.??經(jīng)過與己報道的人和小鼠IncRNA進(jìn)行比對,僅有9條雞IncRNA與29條人IncRNA存在序??列同源,9條與14條小鼠IncRNA序列同源。其中,5條雞睪丸IncRNA能夠同時比對上人和小??鼠IncRNA數(shù)據(jù)庫。此外,本研究還發(fā)現(xiàn)了雞睪丸IncRNA主要集中在1號和Z染色體上(圖3-??7),分別有433?(16.7%)和404?(15.6%)條IncRNA位于這兩條染色體。??500?-I??450?-??400???■??350?-??,?300-??〇?250?-?I??I?1??g?200?-?I??Z?150?-?III??llllllllllllllll????/?^?^?^?^vvvvvvv^vvv??v??■?li

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[3]不同LED光色下繁育的二代種用與肉用三黃雞生產(chǎn)性能比較[D]. 王小雙.浙江大學(xué) 2014



本文編號:3612181

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