基于睪丸測序的雞精子活力性狀mRNA-miRNA-lncRNA轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究
發(fā)布時間:2022-01-27 09:01
精子活力是評價種公雞繁殖潛力的重要指標(biāo),對家禽生產(chǎn)、制種和育種等多個環(huán)節(jié)都有著至關(guān)重要的影響。調(diào)查顯示,我國地方雞普遍存在精子活力偏低的情況,弱精癥(精子活力低下)個體比例偏高。精子活力性狀遺傳力較高,但目前家禽精子活力的分子調(diào)控機(jī)制仍不清楚。因此,尋找雞精子活力性狀的分子標(biāo)記物,利用分子育種方法剔除弱精個體,對于加快家禽品種繁殖性能選育進(jìn)展,提高地方雞產(chǎn)業(yè)化水平有重要的實踐意義。本研究選擇具有極端精子活力表型的北京油雞公雞作為研究對象,利用高通量測序技術(shù)分析睪丸組織中表達(dá)的mRNA、lncRNA和miRNA,篩選鑒定與雞精子活力相關(guān)的基因和非編碼RNA以及相關(guān)的信號通路,并通過構(gòu)建mRNA-miRNA-lncRNA互作網(wǎng)絡(luò),在轉(zhuǎn)錄水平鑒定參與雞精子活力調(diào)控的分子機(jī)制。主要研究內(nèi)容和結(jié)果如下:通過對200只北京油雞公雞進(jìn)行精液品質(zhì)測定,建立了高、低精子活力公雞樣本組,各20只公雞。比較發(fā)現(xiàn),總體上高精子活力公雞的繁殖指標(biāo)優(yōu)于低精子活力公雞,其中種蛋受精率與精子活力的關(guān)聯(lián)程度最高,睪丸組織切片觀察發(fā)現(xiàn),低精子活力公雞睪丸生精上皮完整性較差。對高、低精子活力公雞睪丸進(jìn)行l(wèi)ncRNA測序,共...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:112 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖3-5?IncRNA和mRNA的外顯子數(shù)目分布??
圖3-4?IncRNA和mRNA的長度分布??Figure?3-4?Length?distribution?of?IncRNAs?and?mRNAs??由圖3-5可以看出,大多數(shù)(78.2%)的IncRNA擁有3個或更少的外顯子,而多數(shù)(76.9%)??mRNA外顯子數(shù)目超過5個。與之前報道的雞骨骼。桑睿悖遥危料啾龋ǎ蹋?etal.2016d),睪丸IncRNA??的長度較短,但外顯子數(shù)目接近。??060?■?IncRNA?"mRNA??;I?I??I?0.30?■??:L?L?■■?■■?■!?I??2?3?4?5?6-10?>10??Exon?number??圖3-5?IncRNA和mRNA的外顯子數(shù)目分布??Figure?3-5?Exon?number?distribution?of?IncRNAs?and?mRNAs??表達(dá)量水平方面,通過Stringtie軟件對IncRNA和mRNA進(jìn)行定量分析,發(fā)現(xiàn)雞華丸??IncRNA的表達(dá)水平顯著低于mRNA?(圖3-6)。??25??
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]硒代蛋氨酸對蛋用種公雞繁殖性能及血液生殖激素的影響[J]. 朱冠宇,李征,張立昌,陳余,齊志國,郭勇,倪和民,楊佐君,盛熙暉,王相國,齊曉龍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(21)
[2]弱精癥相關(guān)基因、蛋白及酶學(xué)研究進(jìn)展[J]. 焦瑞寶,唐吉斌,姚余有. 實驗與檢驗醫(yī)學(xué). 2016(04)
[3]活性氧對精子功能影響研究進(jìn)展[J]. 鄧龍生,盧太坤,陳進(jìn)春,鄒強(qiáng),高亞輝. 中國男科學(xué)雜志. 2016(07)
[4]RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序分析不同季節(jié)對檳榔江水牛精液品質(zhì)的影響[J]. 耿紅紅,張敬旸,李蓮,王根林. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2016(07)
[5]基于RNA-seq技術(shù)對不同品種豬背最長肌差異表達(dá)基因的篩選與注釋[J]. 李小金,錢坤,劉林清,王重龍,周杰. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2016(06)
[6]公雞弱精癥相關(guān)候選基因的表達(dá)分析[J]. 富麗,孫研研,薛夫光,劉冉冉,白皓,常國斌,陳國宏,陳繼蘭. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2015(06)
[7]種公雞弱精子癥形成因素的初步研究[J]. 翟飛,王洪志,徐璐,陳靜,李建超,夏明秀,常國斌,陳國宏. 中國畜牧雜志. 2014(17)
[8]Transcriptome profiling of the developing postnatal mouse testis using next-generation sequencing[J]. GONG Wei,PAN LinLin,LIN Qiang,ZHOU YuanYuan,XIN ChengQi,YU XiaoMin,CUI Peng,HU SongNian,YU Jun. Science China(Life Sciences). 2013(01)
[9]SPAG6基因多態(tài)性對種公雞精液品質(zhì)和性發(fā)育相關(guān)性狀的影響[J]. 畢瑜林,陳繼蘭,劉冉冉,鄭麥青,朱靜,常國斌,趙桂蘋,文杰,陳國宏. 中國畜牧雜志. 2012(11)
[10]日糧能量、蛋白質(zhì)水平對種公雞繁殖性能的影響[J]. 王竹偉,陳繼蘭,胡娟,文杰,趙桂蘋,鄭麥青,劉冉冉,李新,劉國芳,趙麗紅,郭艷麗,史兆國. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2011(05)
博士論文
[1]多種抗氧化劑對動物精子品質(zhì)影響的研究[D]. 趙憲林.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
碩士論文
[1]利用iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選與種公雞繁殖力相關(guān)的候選蛋白[D]. 薛夫光.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]犏牛精子發(fā)生阻滯的比較轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 曾賢彬.西南民族大學(xué) 2014
[3]不同LED光色下繁育的二代種用與肉用三黃雞生產(chǎn)性能比較[D]. 王小雙.浙江大學(xué) 2014
本文編號:3612181
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市211工程院校985工程院校教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:112 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
圖3-5?IncRNA和mRNA的外顯子數(shù)目分布??
圖3-4?IncRNA和mRNA的長度分布??Figure?3-4?Length?distribution?of?IncRNAs?and?mRNAs??由圖3-5可以看出,大多數(shù)(78.2%)的IncRNA擁有3個或更少的外顯子,而多數(shù)(76.9%)??mRNA外顯子數(shù)目超過5個。與之前報道的雞骨骼。桑睿悖遥危料啾龋ǎ蹋?etal.2016d),睪丸IncRNA??的長度較短,但外顯子數(shù)目接近。??060?■?IncRNA?"mRNA??;I?I??I?0.30?■??:L?L?■■?■■?■!?I??2?3?4?5?6-10?>10??Exon?number??圖3-5?IncRNA和mRNA的外顯子數(shù)目分布??Figure?3-5?Exon?number?distribution?of?IncRNAs?and?mRNAs??表達(dá)量水平方面,通過Stringtie軟件對IncRNA和mRNA進(jìn)行定量分析,發(fā)現(xiàn)雞華丸??IncRNA的表達(dá)水平顯著低于mRNA?(圖3-6)。??25??
??圖3-6?IncRNA的表達(dá)特征??Figure?3-6?Expression?feature?of?IncRNAs?and?mRNAs.??經(jīng)過與己報道的人和小鼠IncRNA進(jìn)行比對,僅有9條雞IncRNA與29條人IncRNA存在序??列同源,9條與14條小鼠IncRNA序列同源。其中,5條雞睪丸IncRNA能夠同時比對上人和小??鼠IncRNA數(shù)據(jù)庫。此外,本研究還發(fā)現(xiàn)了雞睪丸IncRNA主要集中在1號和Z染色體上(圖3-??7),分別有433?(16.7%)和404?(15.6%)條IncRNA位于這兩條染色體。??500?-I??450?-??400???■??350?-??,?300-??〇?250?-?I??I?1??g?200?-?I??Z?150?-?III??llllllllllllllll????/?^?^?^?^vvvvvvv^vvv??v??■?li
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]硒代蛋氨酸對蛋用種公雞繁殖性能及血液生殖激素的影響[J]. 朱冠宇,李征,張立昌,陳余,齊志國,郭勇,倪和民,楊佐君,盛熙暉,王相國,齊曉龍. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(21)
[2]弱精癥相關(guān)基因、蛋白及酶學(xué)研究進(jìn)展[J]. 焦瑞寶,唐吉斌,姚余有. 實驗與檢驗醫(yī)學(xué). 2016(04)
[3]活性氧對精子功能影響研究進(jìn)展[J]. 鄧龍生,盧太坤,陳進(jìn)春,鄒強(qiáng),高亞輝. 中國男科學(xué)雜志. 2016(07)
[4]RNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序分析不同季節(jié)對檳榔江水牛精液品質(zhì)的影響[J]. 耿紅紅,張敬旸,李蓮,王根林. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2016(07)
[5]基于RNA-seq技術(shù)對不同品種豬背最長肌差異表達(dá)基因的篩選與注釋[J]. 李小金,錢坤,劉林清,王重龍,周杰. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2016(06)
[6]公雞弱精癥相關(guān)候選基因的表達(dá)分析[J]. 富麗,孫研研,薛夫光,劉冉冉,白皓,常國斌,陳國宏,陳繼蘭. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2015(06)
[7]種公雞弱精子癥形成因素的初步研究[J]. 翟飛,王洪志,徐璐,陳靜,李建超,夏明秀,常國斌,陳國宏. 中國畜牧雜志. 2014(17)
[8]Transcriptome profiling of the developing postnatal mouse testis using next-generation sequencing[J]. GONG Wei,PAN LinLin,LIN Qiang,ZHOU YuanYuan,XIN ChengQi,YU XiaoMin,CUI Peng,HU SongNian,YU Jun. Science China(Life Sciences). 2013(01)
[9]SPAG6基因多態(tài)性對種公雞精液品質(zhì)和性發(fā)育相關(guān)性狀的影響[J]. 畢瑜林,陳繼蘭,劉冉冉,鄭麥青,朱靜,常國斌,趙桂蘋,文杰,陳國宏. 中國畜牧雜志. 2012(11)
[10]日糧能量、蛋白質(zhì)水平對種公雞繁殖性能的影響[J]. 王竹偉,陳繼蘭,胡娟,文杰,趙桂蘋,鄭麥青,劉冉冉,李新,劉國芳,趙麗紅,郭艷麗,史兆國. 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2011(05)
博士論文
[1]多種抗氧化劑對動物精子品質(zhì)影響的研究[D]. 趙憲林.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
碩士論文
[1]利用iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選與種公雞繁殖力相關(guān)的候選蛋白[D]. 薛夫光.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2015
[2]犏牛精子發(fā)生阻滯的比較轉(zhuǎn)錄組研究[D]. 曾賢彬.西南民族大學(xué) 2014
[3]不同LED光色下繁育的二代種用與肉用三黃雞生產(chǎn)性能比較[D]. 王小雙.浙江大學(xué) 2014
本文編號:3612181
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