不同雞種TAP1基因SNPs和INDEL比對分析
發(fā)布時間:2022-01-17 18:24
為探究抗原加工相關(guān)轉(zhuǎn)運體1(TAP1)基因在不同雞種中的遺傳多樣性及其進化機制,采用目標序列捕獲測序技術(shù)對29個不同雞種TAP1基因的序列進行比對分析。結(jié)果顯示:在29個雞種中共有270個單核苷酸多態(tài)性(SNPs),其中TAP1基因外顯子中共有116個SNPs,主要發(fā)生在外顯子9和外顯子1上,分別占突變核苷酸總數(shù)的25%和24%;引起非同義突變的SNPs共有82個,突變最多的是A/G,氨基酸同源性高于核苷酸;所有29個雞種中都存在SNPs,快大型青腳麻雞和紅色原雞在外顯子上具有最多的SNPs,發(fā)生堿基缺失的雞種包括固始雞、安卡雞、斗雞羅斯雞雜交品種、綠殼蛋雞、來航雞,其中固始雞缺失片段最長。TAP1基因在不同雞種中存在高度變異性,說明這種多樣性對于雞抗病性具有重要作用,研究結(jié)果也為雞的抗病育種提供了參考。
【文章來源】:中國家禽. 2020,42(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
不同雞種TAP1基因的NJ進化樹
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國地方雞種TAP2基因SNP篩查及遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 王莎莎,劉宗正,張寶珣,劉虎傳,郝小靜,李培培,黃曉,原小雅,常國斌. 畜牧與飼料科學. 2019(12)
[2]蛋雞馬立克氏病的流行病學、臨床特征、病理變化和預防措施[J]. 劉影. 現(xiàn)代畜牧科技. 2019(11)
[3]不同雞種BF1基因SNP和Indel比對分析[J]. 陳博雯,鄭圣晗,張莘,王統(tǒng)苗,王志秀,張揚,陳國宏,常國斌. 江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2018(05)
[4]不同雞種BF2基因序列比較分析[J]. 鄭圣晗,陳穎,孔令琳,吳允,郭其新,陳國宏,常國斌. 吉林農(nóng)業(yè)大學學報. 2018(03)
[5]3個安徽地方豬品種TAP1基因編碼區(qū)遺傳多態(tài)性分析[J]. 薛瑋瑋,王源朗,楊勇,朱衛(wèi)華,孟云,黃龍,張曉東,丁月云,殷宗俊. 安徽農(nóng)業(yè)大學學報. 2014(05)
[6]1型糖尿病TAP基因多態(tài)性的Meta分析[J]. 蔡夢茵,陳圖鋒,鐘文昭,嚴勵. 循證醫(yī)學. 2005(05)
碩士論文
[1]雞TAP1基因多態(tài)性及其在先天免疫中mRNA表達規(guī)律研究[D]. 萬方.揚州大學 2016
[2]雞MHC基因多態(tài)性及其與抗馬立克氏病的相關(guān)性研究[D]. 楊玲.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
[3]利用血液蛋白質(zhì)(酶)多態(tài)性分析我國部分地方雞種的親緣關(guān)系[D]. 劉博.揚州大學 2004
本文編號:3595218
【文章來源】:中國家禽. 2020,42(05)北大核心
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
不同雞種TAP1基因的NJ進化樹
【參考文獻】:
期刊論文
[1]我國地方雞種TAP2基因SNP篩查及遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 王莎莎,劉宗正,張寶珣,劉虎傳,郝小靜,李培培,黃曉,原小雅,常國斌. 畜牧與飼料科學. 2019(12)
[2]蛋雞馬立克氏病的流行病學、臨床特征、病理變化和預防措施[J]. 劉影. 現(xiàn)代畜牧科技. 2019(11)
[3]不同雞種BF1基因SNP和Indel比對分析[J]. 陳博雯,鄭圣晗,張莘,王統(tǒng)苗,王志秀,張揚,陳國宏,常國斌. 江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2018(05)
[4]不同雞種BF2基因序列比較分析[J]. 鄭圣晗,陳穎,孔令琳,吳允,郭其新,陳國宏,常國斌. 吉林農(nóng)業(yè)大學學報. 2018(03)
[5]3個安徽地方豬品種TAP1基因編碼區(qū)遺傳多態(tài)性分析[J]. 薛瑋瑋,王源朗,楊勇,朱衛(wèi)華,孟云,黃龍,張曉東,丁月云,殷宗俊. 安徽農(nóng)業(yè)大學學報. 2014(05)
[6]1型糖尿病TAP基因多態(tài)性的Meta分析[J]. 蔡夢茵,陳圖鋒,鐘文昭,嚴勵. 循證醫(yī)學. 2005(05)
碩士論文
[1]雞TAP1基因多態(tài)性及其在先天免疫中mRNA表達規(guī)律研究[D]. 萬方.揚州大學 2016
[2]雞MHC基因多態(tài)性及其與抗馬立克氏病的相關(guān)性研究[D]. 楊玲.山東農(nóng)業(yè)大學 2014
[3]利用血液蛋白質(zhì)(酶)多態(tài)性分析我國部分地方雞種的親緣關(guān)系[D]. 劉博.揚州大學 2004
本文編號:3595218
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