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豬流行性腹瀉病毒河南株生物學特性研究及FQ-PCR檢測方法的建立

發(fā)布時間:2022-01-12 03:34
  豬流行性腹瀉(porcineepidemic diarrhea,PED)是由尼多目(Nidovirales)冠狀病毒科(Coronaviridae family)冠狀病毒屬(Coronaviridae genus)α-冠狀病毒中的豬流行性腹瀉病毒(PEDV)引起的豬的一種急性、高度傳染性腸道疾病。自2010年冬季以來,由PEDV引起的豬流行性腹瀉疫病在全國大部分養(yǎng)豬省份暴發(fā)和流行,給我國養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大經(jīng)濟損失。有研究表明PED流行毒株是不同與以往經(jīng)典毒株的變異株,但對于其抗原性、致病性及對該病的快速鑒別診斷方法等方面還未見相關(guān)全面系統(tǒng)的研究。為了研究河南省PEDV的分子變異情況、細胞培養(yǎng)特性及特異、快速的鑒別診斷方法,該研究選擇本實驗室已建立的RT-PCR方法檢測出的具有代表性的PEDV陽性樣品,對其S1基因進行序列測定和遺傳進化分析;利用細胞培養(yǎng)技術(shù)在Vero細胞、ST細胞和PK-15細胞中摸索PEDV培養(yǎng)條件,分別在這3種細胞中進行了PEDV細胞增殖所需的胰酶濃度、接種時間及接種劑量的試驗,篩選出最適宜PEDV細胞增殖的條件;大量比對GenBank中PEDV M基因序列,選取高度... 

【文章來源】:河南農(nóng)業(yè)大學河南省

【文章頁數(shù)】:68 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

豬流行性腹瀉病毒河南株生物學特性研究及FQ-PCR檢測方法的建立


圖AS1-1基因序列的擴增結(jié)果;圖BS1-2基因序列的擴增結(jié)果

鑒定結(jié)果,擴增片段,瓊脂糖凝膠電泳,特異性


2.2 S1 基因酶切鑒定結(jié)果PEDV重組質(zhì)粒EcoR I單酶切,瓊脂糖凝膠電泳后特異性條帶大小約為1 400 bp、1 066bp,與預(yù)期擴增片段相符,圖1-2。圖 A 圖 B 圖 C 2 結(jié)果與分析2.1 S1 基因的 RT-PCR 擴增結(jié)果

核苷酸序列,同源性比較,氨基酸序列,氨基酸同源性


97.9%~99.8%,氨基酸同源性為97.0%~99.6%。2012年10株分毒株相互之間核苷酸同源性為97.9%~99.8%,氨基酸同源性為97.0%~99.6%;2013年6株分毒株相互之間核苷酸同源性為98.5%~99.7%,氨基酸同源性為98.0%~99.5%。結(jié)果表明河南省2012年的PEDV的S1基因與2013年的S1基因相比同源率較高,沒有發(fā)生大的變異,見圖1-3、1-4、1-5。圖1-3 16株P(guān)EDV S1基因推導(dǎo)核苷酸序列之間的同源性比較Fig. 1-3 homology comparison is derive from 16 strains of PEDV S1 gene between the nucleotide sequence

【參考文獻】:
期刊論文
[1]2012年河南省豬流行性腹瀉病毒分離株S1基因遺傳變異分析[J]. 陳慧娟,吳志明,閆若潛,趙雪麗,趙明軍,周兵強,孔剛銳,閆志玲,程俊貞,靳利粉.  中國畜牧獸醫(yī). 2014(03)
[2]2010~2012年華中地區(qū)豬流行性腹瀉病毒分子特征和遺傳進化分析[J]. 鄭逢梅,霍金耀,趙軍,常洪濤,王曉夢,陳陸,王川慶.  病毒學報. 2013(02)
[3]豬病毒性腹瀉分子流行病學調(diào)查[J]. 劉云波,趙洪翠,王志成,武剛,何啟蓋.  中國畜牧獸醫(yī). 2013(02)
[4]2011年豬流行性腹瀉病毒的遺傳變異分析[J]. 劉孝珍,陳建飛,時洪艷,張鑫,石達,劉勝旺,馮力.  中國預(yù)防獸醫(yī)學報. 2012(03)
[5]豬流行性腹瀉病毒引起疾病的診斷與防治研究進展[J]. 王娟,呂茂杰,郁宏偉,楊保收.  畜禽業(yè). 2011(09)
[6]豬流行性腹瀉綜合防治[J]. 李家艷.  四川畜牧獸醫(yī). 2011(08)
[7]豬流行性腹瀉的流行特點及其防治措施[J]. 林忠武.  福建畜牧獸醫(yī). 2011(04)
[8]豬流行性腹瀉流行規(guī)律及防治對策[J]. 洪云華.  安徽農(nóng)學通報(上半月刊). 2011(01)
[9]豬腹瀉的病因分析與防治原則[J]. 陳志新.  畜牧與飼料科學. 2010(08)
[10]豬流行性腹瀉的防控[J]. 榮海宇,王紅利.  畜牧與飼料科學. 2010(08)

碩士論文
[1]豬流行性腹瀉病毒地方株LJB/03株分離鑒定[D]. 張桂紅.東北農(nóng)業(yè)大學 2008



本文編號:3584021

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