2010年底,中國(guó)多省市暴發(fā)豬流行性腹瀉,引發(fā)數(shù)以百萬(wàn)計(jì)的仔豬死亡,給中國(guó)乃至世界生豬產(chǎn)業(yè)帶來(lái)了災(zāi)難性損失。同時(shí),臨床流行病學(xué)研究發(fā)現(xiàn),即使在疫苗免疫豬場(chǎng),仍呈現(xiàn)了高水平的感染率和死亡率。為了解現(xiàn)流行PEDV毒株的遺傳變異情況,本研究參考GenBank中PEDV經(jīng)典CV777毒株基因組序列設(shè)計(jì)特異性引物,采用RT-PCR方法對(duì)臨床采集的疑似PEDV樣品進(jìn)行S基因和ORF3基因擴(kuò)增、克隆和測(cè)序,并拼接獲得完整S基因和ORF3基因序列各8條,進(jìn)一步對(duì)本研究毒株進(jìn)行遺傳進(jìn)化及同源性分析。結(jié)果顯示,與經(jīng)典CV777毒株的S基因核苷酸相似性介于93.6%⁹4.1%,ORF3基因核苷酸相似性介于95.7%⁹6.6%。推導(dǎo)的S蛋白氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)顯示,S1區(qū)存在91個(gè)氨基酸突變位點(diǎn),占總數(shù)的61.9%（91/147）,,暗示PEDV的S1區(qū)域比S2區(qū)域易發(fā)生變異S1和S2區(qū)均存在氨基酸插入和缺失現(xiàn)象;ORF3蛋白存在17處氨基酸突變,未見(jiàn)缺失和插入現(xiàn)象。表明目前中國(guó)PEDV流行株已經(jīng)發(fā)生了變異,在一定程度揭示了免疫豬群仍然發(fā)病的原因。有研究表明,S蛋白的... 

【文章來(lái)源】：河南農(nóng)業(yè)大學(xué)河南省

【文章頁(yè)數(shù)】：61 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

PEDV的結(jié)構(gòu)模式圖

圖 2 PEDV 的基因組模式圖Fig.2 Genome model of PEDV.3 PEDV 主要編碼蛋白及功能.3.1 ORF1a/bORF1 基因由 ORF1a（12,354 nt）和 ORF1b（8037 nt）組成，基因全長(zhǎng)約 20,346 nt，二

圖 1-1 檢測(cè) PEDV 的 RT-PCR 擴(kuò)增Fig.1-1 RT-PCR amplification of PEDV detection Marker DL2000; 1-8.陽(yáng)性 PEDV 樣品 RT-PCR 擴(kuò)增結(jié)果rker DL2000; 1-8.PCR product of positive PEDV sample; 9 ORF3 基因擴(kuò)增結(jié)果


本文編號(hào)：3578402