利用CRISPR/Cas9和λ-Red級(jí)聯(lián)技術(shù)構(gòu)建產(chǎn)腸毒素大腸桿菌LT敲除菌株
發(fā)布時(shí)間:2021-12-18 20:45
本研究旨在利用CRISPR/Cas9和λ-Red級(jí)聯(lián)的技術(shù)對(duì)產(chǎn)腸毒素大腸桿菌(enterotoxigenic Escherichia coli,ETEC)K88的熱不穩(wěn)定性腸毒素(heat-labile toxin,LT)基因進(jìn)行無(wú)痕敲除并獲得K88 LT-缺陷菌株。通過(guò)序列比對(duì)獲取LT兩端同源序列,并構(gòu)建包含LT邊界、氯霉素篩選標(biāo)記、sgRNA和LT同源臂的供體片段;將供體片段轉(zhuǎn)化至ETEC K88,同時(shí)分別利用λ-Red同源重組系統(tǒng)和CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng),對(duì)LT基因進(jìn)行敲除;通過(guò)PCR驗(yàn)證獲得了K88 LT-缺陷菌株,并通過(guò)試驗(yàn)測(cè)定了敲除菌株的溶血能力和生長(zhǎng)曲線。結(jié)果顯示,λ-Red同源重組系統(tǒng)可成功地將LT基因替換為相應(yīng)的供體片段,CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)可高效地對(duì)篩選標(biāo)記進(jìn)行刪除,最終通過(guò)λ-Red和CRISPR/Cas9結(jié)合的基因編輯系統(tǒng)可成功對(duì)ETEC K88的LT基因進(jìn)行無(wú)痕敲除。體外試驗(yàn)結(jié)果表明,K88 LT-缺陷菌株的溶血能力喪失,并且生長(zhǎng)速度比野生型菌株減緩,LT可能和ETEC...
【文章來(lái)源】:中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(03)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
pCas-Red質(zhì)粒圖譜
通過(guò)引物L(fēng)T-F/LT-R克隆LT基因全長(zhǎng),連接TA-克隆載體,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞。挑選單克隆,將經(jīng)PCR驗(yàn)證篩選的陽(yáng)性克隆測(cè)序,比對(duì)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù),獲得LT基因全長(zhǎng)及其上、下游序列。根據(jù)LT基因及其上、下游序列設(shè)計(jì)其5′端同源臂序列L-arm short和L-arm,3′端同源臂序列R-arm。以DNA片段Cat-chl cassette為L(zhǎng)T的替代基因,合成LT基因的供體LTh donar (L-arm+Cat-chl cassette+L-arm short+R-arm)(圖2)。1.7 LTh donar轉(zhuǎn)化
通過(guò)Red系統(tǒng)介導(dǎo)的HR插入Chl抗性基因CmR,用于篩選陽(yáng)性的毒素基因LT替代克隆(圖3)。制備含pCas-Red質(zhì)粒電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞,接種含pCas-Red質(zhì)粒的ETEC K88陽(yáng)性克隆子至50 mL含Amp和1%甘油的LB液體培養(yǎng)基中,于30 ℃、200 r/min培養(yǎng)2 h后,加入0.1 mmol/L IPTG誘導(dǎo)λ-RED蛋白的表達(dá),30 ℃生長(zhǎng)至D600 nm值為0.6左右,其他步驟同前。取50 μL含pCas-Red質(zhì)粒的感受態(tài)細(xì)胞加入LT donar,轉(zhuǎn)移至電轉(zhuǎn)杯中混勻進(jìn)行電轉(zhuǎn),條件同前。細(xì)胞在30 ℃復(fù)蘇2 h,涂布于含Amp、氯霉素和1%甘油的LB培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)12 h。挑取單克隆,通過(guò)引物L(fēng)Th donor-F/R進(jìn)行PCR驗(yàn)證LTh donar基因的插入。1.8 LT基因敲除菌株的篩選
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]CRISPR-Cas9介導(dǎo)的蒙古牛MSTN基因敲除細(xì)胞系的建立[J]. 郭梓茹,張立,馬云龍,蘇小虎,周歡敏,張焱如,劉曉. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2018(04)
[2]CRISPR-Cas9的原理及其應(yīng)用進(jìn)展[J]. 楊佳儒,郭美華,柳愛(ài)華,寶福凱. 昆明醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(05)
[3]利用CRISPR/Cas 9技術(shù)構(gòu)建大腸桿菌aroA基因的敲除系統(tǒng)及其初步應(yīng)用[J]. 余深翼,趙金榮,鄭玲紅,朱二鵬,周五朵,吳寶成. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(04)
[4]運(yùn)用CRISPR/Cas系統(tǒng)敲除大腸桿菌磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因及其對(duì)脂肪酸代謝的影響[J]. 夏軍,鄭明剛,王玲,孫承君,鄭立,祝建波. 微生物學(xué)通報(bào). 2016(08)
[5]腸毒性大腸桿菌gspD基因敲除以及對(duì)LT毒素分泌的影響[J]. 魯曦,傅恩清,潘蕾,穆德廣,李王平,金發(fā)光. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(12)
[6]應(yīng)用siRNA技術(shù)抑制產(chǎn)腸毒素大腸桿菌LT基因表達(dá)的研究[J]. 付瑞,劉華,段勇,王玉明,單斌. 國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2015(08)
[7]λ-Red重組系統(tǒng)敲除腸出血性大腸桿菌O157:H7細(xì)胞毒素stx2基因[J]. 劉變芳,殷先華,呂欣,魏新元,郭藹光. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(07)
[8]平板免疫溶血法檢測(cè)產(chǎn)毒性大腸桿菌不耐熱腸毒素[J]. 楊正時(shí),鐘熙. 醫(yī)學(xué)研究通訊. 1987(08)
碩士論文
[1]K88ac+大腸桿菌減毒株的構(gòu)建及其在小鼠體內(nèi)的初步應(yīng)用[D]. 余樹(shù)培.揚(yáng)州大學(xué) 2016
本文編號(hào):3543141
【文章來(lái)源】:中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2020,47(03)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
pCas-Red質(zhì)粒圖譜
通過(guò)引物L(fēng)T-F/LT-R克隆LT基因全長(zhǎng),連接TA-克隆載體,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞。挑選單克隆,將經(jīng)PCR驗(yàn)證篩選的陽(yáng)性克隆測(cè)序,比對(duì)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù),獲得LT基因全長(zhǎng)及其上、下游序列。根據(jù)LT基因及其上、下游序列設(shè)計(jì)其5′端同源臂序列L-arm short和L-arm,3′端同源臂序列R-arm。以DNA片段Cat-chl cassette為L(zhǎng)T的替代基因,合成LT基因的供體LTh donar (L-arm+Cat-chl cassette+L-arm short+R-arm)(圖2)。1.7 LTh donar轉(zhuǎn)化
通過(guò)Red系統(tǒng)介導(dǎo)的HR插入Chl抗性基因CmR,用于篩選陽(yáng)性的毒素基因LT替代克隆(圖3)。制備含pCas-Red質(zhì)粒電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞,接種含pCas-Red質(zhì)粒的ETEC K88陽(yáng)性克隆子至50 mL含Amp和1%甘油的LB液體培養(yǎng)基中,于30 ℃、200 r/min培養(yǎng)2 h后,加入0.1 mmol/L IPTG誘導(dǎo)λ-RED蛋白的表達(dá),30 ℃生長(zhǎng)至D600 nm值為0.6左右,其他步驟同前。取50 μL含pCas-Red質(zhì)粒的感受態(tài)細(xì)胞加入LT donar,轉(zhuǎn)移至電轉(zhuǎn)杯中混勻進(jìn)行電轉(zhuǎn),條件同前。細(xì)胞在30 ℃復(fù)蘇2 h,涂布于含Amp、氯霉素和1%甘油的LB培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)12 h。挑取單克隆,通過(guò)引物L(fēng)Th donor-F/R進(jìn)行PCR驗(yàn)證LTh donar基因的插入。1.8 LT基因敲除菌株的篩選
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[4]運(yùn)用CRISPR/Cas系統(tǒng)敲除大腸桿菌磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因及其對(duì)脂肪酸代謝的影響[J]. 夏軍,鄭明剛,王玲,孫承君,鄭立,祝建波. 微生物學(xué)通報(bào). 2016(08)
[5]腸毒性大腸桿菌gspD基因敲除以及對(duì)LT毒素分泌的影響[J]. 魯曦,傅恩清,潘蕾,穆德廣,李王平,金發(fā)光. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2015(12)
[6]應(yīng)用siRNA技術(shù)抑制產(chǎn)腸毒素大腸桿菌LT基因表達(dá)的研究[J]. 付瑞,劉華,段勇,王玉明,單斌. 國(guó)際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志. 2015(08)
[7]λ-Red重組系統(tǒng)敲除腸出血性大腸桿菌O157:H7細(xì)胞毒素stx2基因[J]. 劉變芳,殷先華,呂欣,魏新元,郭藹光. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(07)
[8]平板免疫溶血法檢測(cè)產(chǎn)毒性大腸桿菌不耐熱腸毒素[J]. 楊正時(shí),鐘熙. 醫(yī)學(xué)研究通訊. 1987(08)
碩士論文
[1]K88ac+大腸桿菌減毒株的構(gòu)建及其在小鼠體內(nèi)的初步應(yīng)用[D]. 余樹(shù)培.揚(yáng)州大學(xué) 2016
本文編號(hào):3543141
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