在雞遺傳研究和綠殼蛋雞產(chǎn)業(yè)中,尤其是在雞綠殼致因突變發(fā)現(xiàn)后,綠殼性狀是一個(gè)有趣的研究對(duì)象。在中國(guó),已經(jīng)選育出東鄉(xiāng)綠殼蛋雞,且該群體中綠殼蛋的致因基因SLCO1B3的顯性純合子已經(jīng)被固定。盡管被固定的綠殼蛋雞都產(chǎn)綠殼蛋,但蛋殼的綠色程度卻深淺不一。在本研究中我們對(duì)蛋殼顏色相關(guān)的色素膽綠素與原卟啉進(jìn)行了基本分析,以此獲得表型性狀:膽綠素含量（QB）,原卟啉含量（QP）及總色素含量（QT）,然后我們測(cè)定了與血紅素通路相關(guān)的三個(gè)潛在調(diào)控基因（SLCO1B3,H01,BLVRA）的mRNA表達(dá)水平,以評(píng)估這些候選基因與蛋殼顏色強(qiáng)度性狀的相關(guān)性。我們的研究結(jié)果顯示,這些基因與該性狀沒有顯著的關(guān)聯(lián)。在前期工作中,通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析,我們鑒定了一些與蛋殼顏色深淺有關(guān)的18個(gè)SNP位點(diǎn),為了驗(yàn)證全基因組關(guān)聯(lián)分析的結(jié)果,我們?cè)趦蓚�(gè)獨(dú)立的中國(guó)東鄉(xiāng)綠殼蛋雞群體中對(duì)鑒定到的18個(gè)SNP進(jìn)行了進(jìn)一步的驗(yàn)證工作,這18個(gè)SNP均勻分布在GGA21與蛋殼色素顯著相關(guān)的區(qū)域內(nèi)。驗(yàn)證群體包括來(lái)自于用于GWAS研究群體產(chǎn)生的第二個(gè)世代,包含146個(gè)個(gè)體（N146）,和另外一個(gè)來(lái)自江西東鄉(xiāng)綠殼蛋雞保種場(chǎng)的獨(dú)立群體,包含28... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：126 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
Abbreviations
Chapter 1:Literature Review
    1.1 Poultry production in China
    1.2 Indigenous Blue-shelled chicken breeds in China
    1.3 Egg consumption in the world and China
    1.4 The color of eggshell and consumer preferences
    1.5 Blue eggshell pigmentation
    1.6 Genes associated with blue eggshell pigmentation
    1.7 SLCO1B3 gene and EAV-HP insertion in blue-shelled chickens
    1.8 Genome-wide association and the follow-up replication studies
    1.9 Overview of Transcriptome-RNA-Seq studies
    1.10 Introduction to RNA-Seq Technology
    1.11 Application of RNA-Seq in livestock
    1.12 Aim and significance of the study
    1.13 Schematic representation of the workflow
CHAPTER 2:Analysis On Eggshell Pigments and Detection of mRNA Expression Levelsfor Some Related Major Genes
    2.1 Introduction
    2.2 Materials and methods
    2.3 Results
    2.4 Discussion
CHAPTER 3:A Post-GWAS Replication Studies Revealed A Promising Genomic Regionand Candidate Genes for Chicken Eggshell Blueness
    3.1 Introduction
    3.2 Materials and Methods
    3.3 Results
    3.4 Discussion
CHAPTER 4 Transcriptomic Profile of Eggshell Gland from Dark and Light Blue Eggshell
    4.1 Introduction
    4.2 Materials and methods
    4.3 Results
    4.4 Discussion
CHAPTER 5: Conclusions
    5.1 Standard pigment and expression analysis
    5.2 Replication association study
    5.3 Transcriptome analysis
References
Acknowledgments
Appendices


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選與鴨青殼性狀形成相關(guān)的基因[J]. 陳黎,黃學(xué)濤,田勇,陶爭(zhēng)榮,盧立志.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2016(07)
[2]雞血紅素加氧酶-1（HO-1）和膽綠素還原酶A（BLVRA）基因表達(dá)量對(duì)蛋殼顏色的影響[J]. 王曉慶,徐廷生,雷雪芹,高靈照,肖贊奇.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2014(35)



本文編號(hào)：3542048