影響山羊產(chǎn)羔數(shù)lncRNA的篩選及功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-12-09 15:37
旨在分析高、低繁殖力川中黑山羊卵巢組織中長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA)的表達(dá)譜,探討lncRNA與山羊生殖調(diào)控的關(guān)系,為解釋lncRNA在山羊繁殖調(diào)控中的分子機(jī)制提供理論依據(jù)。本研究選擇3胎以上的10頭健康川中母羊(3.5~4.5歲),將其分為高繁組和低繁組。高繁組為每胎產(chǎn)羔數(shù)在2頭以上的母羊(n=6),低繁組為每胎產(chǎn)羔數(shù)為1頭的母羊(n=4)。同期發(fā)情后,采集高繁和低繁山羊的卵巢樣品,并從中提取總RNA構(gòu)建測(cè)序文庫(kù),通過(guò)HigSeq X ten平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,篩選出差異lncRNAs,通過(guò)對(duì)差異顯著的lncRNAs與mRNAs位置關(guān)系以及結(jié)合能的判定預(yù)測(cè)順式作用的靶基因,并對(duì)其進(jìn)行GO和KEGG通路分析。最后,隨機(jī)抽取6個(gè)差異lncRNAs進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量驗(yàn)證。結(jié)果表明,本研究共鑒定出168個(gè)差異表達(dá)lncRNAs,其中,163個(gè)lncRNAs在高繁組卵巢顯著上調(diào),5個(gè)lncRNAs在低繁組卵巢顯著上調(diào)。篩選出的差異表達(dá)lncRNAs可能為調(diào)控山羊繁殖力的候選lncRNAs,包括ENSCHIG00000001479、ENSCHIG000000...
【文章來(lái)源】:畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(08)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:13 頁(yè)
【部分圖文】:
差異表達(dá)lncRNAs的火山圖
差異表達(dá)lncRNAs聚類圖
差異表達(dá)lncRNAs的qRT-PCR驗(yàn)證
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)美利奴羊胚胎骨骼肌發(fā)育的加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析[J]. 石田培,侯浩賓,王欣悅,趙志達(dá),尚明玉,張莉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]卵巢癌中相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA的研究進(jìn)展[J]. 譚芳春,李力. 國(guó)際婦產(chǎn)科學(xué)雜志. 2020(01)
[3]哺乳動(dòng)物卵母細(xì)胞成熟相關(guān)信號(hào)的調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 劉永剛,李文哲,蘇建民. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2019(09)
[4]CADM1在卵巢癌組織中的表達(dá)及其臨床意義[J]. 吳翠霞,李波. 實(shí)用癌癥雜志. 2019(07)
[5]舍飼隴東絨山羊同期發(fā)情及繁殖性狀的研究[J]. 呂永鋒,任茂源,郭彬彬,楊有有,謝文章. 中國(guó)草食動(dòng)物科學(xué). 2018(06)
[6]不同受體羊同期發(fā)情及胚胎移植效果的研究[J]. 王珂,于軒,任茂源,郭彬彬,楊有有,徐建峰,茍想珍,呂永鋒. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2018(06)
[7]同期發(fā)情技術(shù)在綿羊生產(chǎn)上的應(yīng)用[J]. 尹修遠(yuǎn),王建,李擁軍,王強(qiáng),瞿靜雯. 當(dāng)代畜牧. 2018(30)
[8]長(zhǎng)鏈非編碼RNA在畜禽經(jīng)濟(jì)性狀中的研究進(jìn)展[J]. 楊兵,李曉鳳,王昕. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(10)
[9]山羊發(fā)情控制技術(shù)[J]. 譚曉山,王燕,皇甫江云,毛鳳顯. 貴州畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[10]牛體外受精胚胎抗氧化相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜[J]. 郭芹芹,李鳳,孫尉峻,郝海生,劉巖,趙學(xué)明,龐云渭,朱化彬,杜衛(wèi)華. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(07)
博士論文
[1]綿羊卵巢Leptin相關(guān)lncRNA篩選及在季節(jié)性發(fā)情中的分析研究[D]. 李良遠(yuǎn).石河子大學(xué) 2018
[2]母源BTG4在小鼠早期胚胎發(fā)育中的功能和機(jī)制研究[D]. 劉玉勝.中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2017
[3]秦川牛PPARGC1A基因功能驗(yàn)證及遺傳變異研究[D]. 李密杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
碩士論文
[1]Hippo信號(hào)通路有關(guān)卵巢特異性lncRNA的篩選、驗(yàn)證及其與卵巢衰老相關(guān)性初探[D]. 羅瑞晨.南昌大學(xué) 2019
[2]miR-26b-5p調(diào)節(jié)CDH2對(duì)大鼠卵巢顆粒細(xì)胞凋亡作用的研究[D]. 杜波.錦州醫(yī)科大學(xué) 2018
[3]初情期雌性山羊lncRNA的篩選與鑒定[D]. 高霄霄.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]超排卵周期中卵泡不同反應(yīng)組及多囊卵巢綜合征患者中鈣粘素的表達(dá)研究[D]. 張崢程.浙江大學(xué) 2012
本文編號(hào):3530886
【文章來(lái)源】:畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020,51(08)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:13 頁(yè)
【部分圖文】:
差異表達(dá)lncRNAs的火山圖
差異表達(dá)lncRNAs聚類圖
差異表達(dá)lncRNAs的qRT-PCR驗(yàn)證
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中國(guó)美利奴羊胚胎骨骼肌發(fā)育的加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析[J]. 石田培,侯浩賓,王欣悅,趙志達(dá),尚明玉,張莉. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(03)
[2]卵巢癌中相關(guān)長(zhǎng)鏈非編碼RNA的研究進(jìn)展[J]. 譚芳春,李力. 國(guó)際婦產(chǎn)科學(xué)雜志. 2020(01)
[3]哺乳動(dòng)物卵母細(xì)胞成熟相關(guān)信號(hào)的調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 劉永剛,李文哲,蘇建民. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2019(09)
[4]CADM1在卵巢癌組織中的表達(dá)及其臨床意義[J]. 吳翠霞,李波. 實(shí)用癌癥雜志. 2019(07)
[5]舍飼隴東絨山羊同期發(fā)情及繁殖性狀的研究[J]. 呂永鋒,任茂源,郭彬彬,楊有有,謝文章. 中國(guó)草食動(dòng)物科學(xué). 2018(06)
[6]不同受體羊同期發(fā)情及胚胎移植效果的研究[J]. 王珂,于軒,任茂源,郭彬彬,楊有有,徐建峰,茍想珍,呂永鋒. 畜牧獸醫(yī)雜志. 2018(06)
[7]同期發(fā)情技術(shù)在綿羊生產(chǎn)上的應(yīng)用[J]. 尹修遠(yuǎn),王建,李擁軍,王強(qiáng),瞿靜雯. 當(dāng)代畜牧. 2018(30)
[8]長(zhǎng)鏈非編碼RNA在畜禽經(jīng)濟(jì)性狀中的研究進(jìn)展[J]. 楊兵,李曉鳳,王昕. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(10)
[9]山羊發(fā)情控制技術(shù)[J]. 譚曉山,王燕,皇甫江云,毛鳳顯. 貴州畜牧獸醫(yī). 2017(06)
[10]牛體外受精胚胎抗氧化相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜[J]. 郭芹芹,李鳳,孫尉峻,郝海生,劉巖,趙學(xué)明,龐云渭,朱化彬,杜衛(wèi)華. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(07)
博士論文
[1]綿羊卵巢Leptin相關(guān)lncRNA篩選及在季節(jié)性發(fā)情中的分析研究[D]. 李良遠(yuǎn).石河子大學(xué) 2018
[2]母源BTG4在小鼠早期胚胎發(fā)育中的功能和機(jī)制研究[D]. 劉玉勝.中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué) 2017
[3]秦川牛PPARGC1A基因功能驗(yàn)證及遺傳變異研究[D]. 李密杰.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2013
碩士論文
[1]Hippo信號(hào)通路有關(guān)卵巢特異性lncRNA的篩選、驗(yàn)證及其與卵巢衰老相關(guān)性初探[D]. 羅瑞晨.南昌大學(xué) 2019
[2]miR-26b-5p調(diào)節(jié)CDH2對(duì)大鼠卵巢顆粒細(xì)胞凋亡作用的研究[D]. 杜波.錦州醫(yī)科大學(xué) 2018
[3]初情期雌性山羊lncRNA的篩選與鑒定[D]. 高霄霄.安徽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]超排卵周期中卵泡不同反應(yīng)組及多囊卵巢綜合征患者中鈣粘素的表達(dá)研究[D]. 張崢程.浙江大學(xué) 2012
本文編號(hào):3530886
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