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豬流行性腹瀉病毒jiaozuo1012/2019株的分離鑒定及遺傳進(jìn)化分析

發(fā)布時間:2021-11-28 13:27
  為確定2019年河南焦作某豬場哺乳仔豬發(fā)生腹瀉的病因,本研究采用RT-PCR方法對該發(fā)病豬場送檢的5份仔豬腸內(nèi)容物樣品進(jìn)行仔豬腹瀉相關(guān)病毒檢測,對檢測的豬流行性腹瀉病毒(PEDV)陽性樣品進(jìn)行病毒分離,對分離的PEDV S基因和ORF3基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并分析這兩個基因與GenBank中的PEDV參考株相應(yīng)基因的同源性及遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示,送檢的5份豬腸道內(nèi)容物樣品PEDV檢測結(jié)果均為陽性,而豬傳染性胃腸炎病毒(TGEV)和豬輪狀病毒(PoRV)的檢測結(jié)果均為陰性;將隨機(jī)選取的1份PEDV陽性樣品接種Vero細(xì)胞并經(jīng)傳代培養(yǎng),對培養(yǎng)5代的病毒經(jīng)PCR檢測表明分離到一株P(guān)EDV,并將其命名為jiaozuo1012/2019株;基于S基因同源性分析結(jié)果顯示,該分離株與河南分離的PEDV CH/HNLH/2015株同源性最高,為99.3%,與近期河南分離株的同源性為96.4%~99.0%,與經(jīng)典PEDV CV777株的同源性較低為93.4%。分離株S基因編碼的氨基酸在aa59~aa62位存在4個氨基酸(59QGVN62)的插入,在aa140和... 

【文章來源】:中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2020,42(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

豬流行性腹瀉病毒jiaozuo1012/2019株的分離鑒定及遺傳進(jìn)化分析


圖1 分離病毒的IFA鑒定結(jié)果

基因,病毒


利用1.2中引物對分離的PEDV進(jìn)行S基因和ORF3基因的PCR擴(kuò)增。結(jié)果顯示,分別擴(kuò)增出大小約4 000 bp、600 bp的目的基因,均與預(yù)期的S基因和ORF3基因大小一致(圖2);測序結(jié)果顯示,分離的PEDV S基因全長為4 161 bp,ORF3基因全長為675 bp。表明,正確克隆了PEDV分離株的S基因和ORF3基因。2.4分離病毒S基因和ORF基因同源性及其遺傳進(jìn)化分析結(jié)果

基因,進(jìn)化樹,河南,仔豬腹瀉


本研究鑒定了2019年河南某豬場發(fā)生仔豬腹瀉疫情的病原為PEDV,并利用Vero細(xì)胞分離獲得了PEDV自然感染株(jiaozuo1012/2019)。分離株經(jīng)S基因和ORF3基因的克隆、測序及分析,進(jìn)一步證實(shí)該株P(guān)EDV與近年來河南地區(qū)PEDV流行株突變特征一致,為PEDV新的流行株[13]。本研究結(jié)果為深入探究PEDV新流行株的致病性和致病機(jī)理奠定了基礎(chǔ)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[3]豬流行性腹瀉病毒HeB10/2014株的分離與鑒定[J]. 王康,王鑫,楊德強(qiáng),侯怡軒,謝春,虞凌雪,姜一峰,楊莘,高飛,李麗薇,黃勤峰,童光志,周艷君.  中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報. 2016(04)
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本文編號:3524509

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