杭州地區(qū)貓杯狀病毒的分離鑒定及VP1基因序列分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-24 09:21
貓杯狀病毒(feline calicivims, FCV)是引起貓呼吸道疾病的一種常見病原,呈世界性分布,常在貓群中爆發(fā)流行。為了解我國FCV的流行情況及分子生態(tài)學(xué)特征,本研究對杭州地區(qū)收集的48份疑似FCV感染病料,進(jìn)行了PCR鑒定、病毒分離培養(yǎng),以及基于VP1基因序列的系統(tǒng)發(fā)育樹分析。RT-PCR鑒定的結(jié)果顯示,有32份病料可判為陽性;這32份病料接種的F81細(xì)胞,均出現(xiàn)明顯的細(xì)胞病變。VP1基因序列分析顯示,32株分離毒間的核苷酸同源性為69.2%~99%,氨基酸同源性為82.1%~99.9%。與國外分離株相比,32株分離株同國內(nèi)分離株的同源性更高。系統(tǒng)發(fā)育樹分析顯示,32株分離株有12株與國內(nèi)分離株遺傳關(guān)系較近,15株與英國株遺傳關(guān)系較近,別外4株與多國分離株形成獨(dú)立分支。對VP1 D-E區(qū)的B細(xì)胞線性表位分析發(fā)現(xiàn),D區(qū)和conE區(qū)的2個(gè)表位比較保守,而5′HRV區(qū)的表位存在較大變異。盡管32個(gè)毒株分離于同一地區(qū)和相近的時(shí)間段,主要抗原VP1基因差異仍然較大,多數(shù)達(dá)20%~30%不等。以上結(jié)果表明,FCV在杭州地區(qū)廣泛流行,且呈現(xiàn)明顯的遺傳多樣性,給病毒的分子流行病學(xué)監(jiān)測和疫苗...
【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2020,52(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
部分FCV的RT-PCR鑒定結(jié)果
取分離得到的32株疑似FCV病毒液,提取RNA后反轉(zhuǎn)錄得cDNA,用VP1特異性引物擴(kuò)增,產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳后得到約2 000 bp大小的特異性條帶,與預(yù)期2 007 bp大小相符,部分結(jié)果見圖3。擴(kuò)增產(chǎn)物的測序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫中FCV的VP1基因核苷酸序列相似度為69.2%~82.2%,表明32株分離毒確為FCV病毒,并依次命名為DF001-DF032。圖3 部分FCV VP1基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖
部分FCV VP1基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貓杯狀病毒不同分離株免疫原性的比較[J]. 王一鳴,趙艷麗,趙立峰,應(yīng)瑛,王開,胡桂學(xué),楊松濤. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
[2]貓杯狀病毒基因及其抗原多樣性研究進(jìn)展[J]. 趙艷麗,董宏偉,陳小慶,姜雪,劉秋艷,胡桂學(xué). 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(03)
[3]ICTV第八次報(bào)告的最新病毒分類系統(tǒng)[J]. 洪健,周雪平. Virologica Sinica. 2006(01)
本文編號(hào):3515688
【文章來源】:畜牧與獸醫(yī). 2020,52(04)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
部分FCV的RT-PCR鑒定結(jié)果
取分離得到的32株疑似FCV病毒液,提取RNA后反轉(zhuǎn)錄得cDNA,用VP1特異性引物擴(kuò)增,產(chǎn)物進(jìn)行凝膠電泳后得到約2 000 bp大小的特異性條帶,與預(yù)期2 007 bp大小相符,部分結(jié)果見圖3。擴(kuò)增產(chǎn)物的測序結(jié)果與NCBI數(shù)據(jù)庫中FCV的VP1基因核苷酸序列相似度為69.2%~82.2%,表明32株分離毒確為FCV病毒,并依次命名為DF001-DF032。圖3 部分FCV VP1基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖
部分FCV VP1基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]貓杯狀病毒不同分離株免疫原性的比較[J]. 王一鳴,趙艷麗,趙立峰,應(yīng)瑛,王開,胡桂學(xué),楊松濤. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
[2]貓杯狀病毒基因及其抗原多樣性研究進(jìn)展[J]. 趙艷麗,董宏偉,陳小慶,姜雪,劉秋艷,胡桂學(xué). 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2014(03)
[3]ICTV第八次報(bào)告的最新病毒分類系統(tǒng)[J]. 洪健,周雪平. Virologica Sinica. 2006(01)
本文編號(hào):3515688
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