旨在分析細粒棘球絳蟲TSP33基因的結(jié)構(gòu)及其在細粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段的表達情況,預(yù)測其作為細粒棘球絳蟲診斷抗原的潛在價值。從GenBank中獲得Eg-TSP33的cDNA序列并設(shè)計特異性引物,提取原頭蚴總RNA,反轉(zhuǎn)錄cDNA,以cDNA為模板進行PCR擴增,將PCR產(chǎn)物克隆到大腸埃希菌中,測序并進行生物信息學分析。TSP33cDNA全長864bp,編碼277個氨基酸,Eg-TSP33的預(yù)測分子質(zhì)量為32.11ku,預(yù)測等電點為8.62。RT-PCR結(jié)果顯示,Eg-TSP33在細粒棘球絳蟲成蟲、包囊壁及原頭蚴中均有表達,且在包囊壁中表達量較多。結(jié)果說明,Eg-TSP33可能在細粒棘球絳蟲發(fā)育過程中可能具有重要作用,為Eg-TSP33分子的診斷價值研究奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來源】：動物醫(yī)學進展. 2020,41(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

Eg-TSP33基因的PCR擴增

Eg-TSP33全長由864個核苷酸組成，編碼287個氨基酸，分子質(zhì)量為32.1ku，等電點理論值為8.62，含有4537個原子，有23個帶正電荷的氨基酸殘基和17個帶負電荷的氨基酸殘基。該蛋白在液體中的不穩(wěn)定系數(shù)為40.24(>40），為不穩(wěn)定蛋白。Eg-TSP33親水性疏水性平均值為0.665，為疏水蛋白。經(jīng)分析，該蛋白為可溶性蛋白。2.4 Eg-TSP33二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)

使用軟件SOPMA對Eg-TSP33進行二級結(jié)構(gòu)預(yù)測（圖3），結(jié)果顯示，該蛋白α螺旋占56.79%，無規(guī)則卷曲占26.48%，延伸鏈占12.54%，β轉(zhuǎn)角占4.18%。通過SWISS-MODEL軟件對Eg-TSP33的三級結(jié)構(gòu)進行預(yù)測分析，結(jié)果顯示Eg-TSP33的三級結(jié)構(gòu)如圖4所示。圖4 SWISS-MODEL預(yù)測Eg-TSP33三級結(jié)構(gòu)

【參考文獻】：
期刊論文
[1]多房棘球蚴四跨膜蛋白的生物信息學分析[J]. 楊宇,張耀剛,張靈強,任利,樊海寧.  中國病原生物學雜志. 2019(02)
[2]棘球蚴(包蟲)病預(yù)防疫苗的研制與應(yīng)用[J]. 張文寶,張壯志,鄭雪婷,李軍.  中國人獸共患病學報. 2018(09)
[3]四跨膜蛋白超家族Tetraspanins在腫瘤及纖維化疾病中的作用概況[J]. 李春艷,高勝蘭,劉剛.  現(xiàn)代醫(yī)院. 2018(03)
[4]細粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白表達譜分析[J]. 王正榮,薄新文,張艷艷,馬勛,王智欣,盧平萍.  畜牧獸醫(yī)學報. 2017(08)



本文編號：3508252