旨在分析細(xì)粒棘球絳蟲TSP33基因的結(jié)構(gòu)及其在細(xì)粒棘球絳蟲不同發(fā)育階段的表達(dá)情況,預(yù)測(cè)其作為細(xì)粒棘球絳蟲診斷抗原的潛在價(jià)值。從GenBank中獲得Eg-TSP33的cDNA序列并設(shè)計(jì)特異性引物,提取原頭蚴總RNA,反轉(zhuǎn)錄cDNA,以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將PCR產(chǎn)物克隆到大腸埃希菌中,測(cè)序并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。TSP33cDNA全長864bp,編碼277個(gè)氨基酸,Eg-TSP33的預(yù)測(cè)分子質(zhì)量為32.11ku,預(yù)測(cè)等電點(diǎn)為8.62。RT-PCR結(jié)果顯示,Eg-TSP33在細(xì)粒棘球絳蟲成蟲、包囊壁及原頭蚴中均有表達(dá),且在包囊壁中表達(dá)量較多。結(jié)果說明,Eg-TSP33可能在細(xì)粒棘球絳蟲發(fā)育過程中可能具有重要作用,為Eg-TSP33分子的診斷價(jià)值研究奠定了基礎(chǔ)。 

【文章來源】：動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2020,41(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

Eg-TSP33基因的PCR擴(kuò)增

Eg-TSP33全長由864個(gè)核苷酸組成，編碼287個(gè)氨基酸，分子質(zhì)量為32.1ku，等電點(diǎn)理論值為8.62，含有4537個(gè)原子，有23個(gè)帶正電荷的氨基酸殘基和17個(gè)帶負(fù)電荷的氨基酸殘基。該蛋白在液體中的不穩(wěn)定系數(shù)為40.24(>40），為不穩(wěn)定蛋白。Eg-TSP33親水性疏水性平均值為0.665，為疏水蛋白。經(jīng)分析，該蛋白為可溶性蛋白。2.4 Eg-TSP33二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)

使用軟件SOPMA對(duì)Eg-TSP33進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)（圖3），結(jié)果顯示，該蛋白α螺旋占56.79%，無規(guī)則卷曲占26.48%，延伸鏈占12.54%，β轉(zhuǎn)角占4.18%。通過SWISS-MODEL軟件對(duì)Eg-TSP33的三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)分析，結(jié)果顯示Eg-TSP33的三級(jí)結(jié)構(gòu)如圖4所示。圖4 SWISS-MODEL預(yù)測(cè)Eg-TSP33三級(jí)結(jié)構(gòu)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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