基于線粒體NAD1和COX1基因的大熊貓西氏貝蛔蟲種群遺傳結(jié)構(gòu)研究
發(fā)布時間:2021-11-14 16:00
大熊貓(Ailuropoda melanoleuca)是世界公認的最為瀕危物種之一。在歷史進化過程中受氣候變化、人類活動及其自身的生理局限等因素影響,大熊貓經(jīng)兩次顯著地種群擴張和收縮后逐漸分化為了秦嶺、岷山和邛崍·相嶺·涼山三個遺傳種群。宿主種群的擴張、收縮和遷移決定了寄生蟲種群結(jié)構(gòu)和遺傳分化。西氏貝蛔蟲(Baylisascaris schroederi)是大熊貓體內(nèi)最常見且危害最為嚴重的寄生蟲。在隨大熊貓協(xié)同進化的過程中,西氏貝蛔蟲種群的遺傳結(jié)構(gòu)是否發(fā)生分化目前尚未得知。為了給西氏貝蛔蟲的流行病學、進化生物學和抗藥機制提供一些基礎(chǔ)資料,本研究分別使用線粒體NAD1和COXl基因作為分子標記,對來自秦嶺、岷山和邛崍地理種群的西氏貝蛔蟲進行了種群遺傳結(jié)構(gòu)研究。本論文主要的研究工作如下:1.基于線粒體NAD1基因?qū)ξ魇县惢紫x的種群遺傳結(jié)構(gòu)研究為了探究中國不同山系大熊貓西氏貝蛔蟲種群遺傳結(jié)構(gòu),本實驗利用PCR技術(shù)擴增了三個地理種群的共計47個樣本(岷山13個,邛崍26個,秦嶺8個)的線粒體NAD1(873bp)基因全序列,并進行了種群遺傳結(jié)構(gòu)分析。三個地理種群的47個樣本共分出了15個單倍型...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一部分 文獻綜述
一、種群遺傳學
1. 種群遺傳學的概念
2. 影響種群遺傳結(jié)構(gòu)的因素
3. 種群遺傳學的應用
二、線蟲的種群遺傳學研究
1. 基于SSCP技術(shù)對線蟲群體遺傳結(jié)構(gòu)進行分析
2. 基于RFLP,AFLP和RAPD方法對線蟲群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究
3. 基因序列分析、等位酶標記和微衛(wèi)星標記應用于寄生線蟲遺傳結(jié)構(gòu)分析
三、寄生蟲與宿主間的相互種群影響
1. 協(xié)同進化
2. 寄生蟲與宿主種群的相互調(diào)節(jié)
四、展望
五、本研究的目的及意義
第二部分 研究內(nèi)容
第一章 基于線粒體NAD1基因?qū)ξ魇县惢紫x種群遺傳多態(tài)性的研究
摘要
引言
1 試劑與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 實驗結(jié)果
2.1 序列特征
2.2 遺傳多樣性
2.3 系統(tǒng)發(fā)育樹和單倍型網(wǎng)絡圖
2.4 群體歷史動態(tài)
2.5 種群遺傳分化
3 討論
3.1 序列特征分析
3.2 遺傳多樣性分析
3.3 種群中性檢驗及歷史動態(tài)
3.4 遺傳分化分析
第二章 基于線粒體COX1基因?qū)ξ魇县惢紫x種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究
摘要
引言
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 實驗結(jié)果
2.1 序列特征
2.2 遺傳多樣性
2.3 單倍型系統(tǒng)進化樹和網(wǎng)絡圖
2.4 群體歷史動態(tài)
2.5 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3. 討論
3.1 遺傳多樣性
3.2 種群中性檢驗及歷史動態(tài)
3.3 遺傳分化
第三部分 結(jié)論和創(chuàng)新點
1. 結(jié)論
2. 創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于線粒體CO2和ND4基因?qū)λ拇ㄊ《範顜Ы{蟲種群遺傳多樣性的分析[J]. 楊德英,任永軍,聶華明,付彥,謝躍,陳林,農(nóng)向,巖寧,古小彬,王淑賢,楊光友. 中國獸醫(yī)學報. 2013(01)
[2]大熊貓等8種野生哺乳動物蛔蟲的線粒體COXⅠ和COXⅡ基因的親緣關(guān)系分析[J]. 牛李麗,陳世界,汪濤,古小彬,嚴玉寶,余華,鄧家波,嚴慧娟,余星明,陳維剛,王淑賢,楊光友. 畜牧獸醫(yī)學報. 2012(10)
[3]基于cytb基因?qū)Υ笮茇埖攘N珍稀野生動物感染蛔蟲的種系發(fā)育分析[J]. 牛李麗,李巖,古小彬,余華,鄧家波,嚴慧娟,余星明,陳維剛,王淑賢,楊光友. 中國獸醫(yī)科學. 2012(09)
[4]基于線粒體12S基因?qū)η嗪5貐^(qū)細粒棘球蚴種群遺傳多態(tài)性研究[J]. 延寧,聶華明,蔣忠榮,鄧世金,余華,嚴玉寶,達瓦次仁,謝躍,付彥,楊德英,郝桂英,古小彬,楊光友. 畜牧獸醫(yī)學報. 2012(06)
[5]基于線粒體細胞色素b基因的細頸囊尾蚴種群遺傳多樣性研究[J]. 郝桂英,楊光友,古小彬,陽愛國,楊應東,王淑賢. 畜牧獸醫(yī)學報. 2012(01)
[6]線蟲線粒體基因組全序列分析研究進展[J]. 賈萬忠,閆鴻斌,倪興維,曹平,婁忠子,付寶權(quán),史萬貴. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2011(06)
[7]中國近海小黃魚遺傳變異的細胞色素b序列分析[J]. 彭博,章群,趙爽,樂小亮. 廣東農(nóng)業(yè)科學. 2010(02)
[8]基于ND4基因部分片段探討中國4個家驢品種的母系構(gòu)成[J]. 陳建興,孫玉江,沈偉,潘慶杰,閔令江. 青島農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2009(04)
[9]大熊貓等八種野生珍稀動物蛔蟲ITS-2基因的序列分析[J]. 何光志,牛李麗,楊光友,鄧家波,王帥,余星明,汪濤,古小彬,陳維剛. 中國獸醫(yī)科學. 2008(11)
[10]大熊貓西氏貝蛔蟲與黑熊橫走貝蛔蟲成蟲體內(nèi)8種無機元素的分析[J]. 彭雪蓉,楊光友. 西華師范大學學報(自然科學版). 2007(03)
博士論文
[1]三種海洋魚類分子系統(tǒng)地理學研究[D]. 韓志強.中國海洋大學 2008
碩士論文
[1]基于線粒體COI基因和微衛(wèi)星標記對細鱗鲴種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 張勇.上海海洋大學 2011
本文編號:3494931
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一部分 文獻綜述
一、種群遺傳學
1. 種群遺傳學的概念
2. 影響種群遺傳結(jié)構(gòu)的因素
3. 種群遺傳學的應用
二、線蟲的種群遺傳學研究
1. 基于SSCP技術(shù)對線蟲群體遺傳結(jié)構(gòu)進行分析
2. 基于RFLP,AFLP和RAPD方法對線蟲群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究
3. 基因序列分析、等位酶標記和微衛(wèi)星標記應用于寄生線蟲遺傳結(jié)構(gòu)分析
三、寄生蟲與宿主間的相互種群影響
1. 協(xié)同進化
2. 寄生蟲與宿主種群的相互調(diào)節(jié)
四、展望
五、本研究的目的及意義
第二部分 研究內(nèi)容
第一章 基于線粒體NAD1基因?qū)ξ魇县惢紫x種群遺傳多態(tài)性的研究
摘要
引言
1 試劑與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 實驗結(jié)果
2.1 序列特征
2.2 遺傳多樣性
2.3 系統(tǒng)發(fā)育樹和單倍型網(wǎng)絡圖
2.4 群體歷史動態(tài)
2.5 種群遺傳分化
3 討論
3.1 序列特征分析
3.2 遺傳多樣性分析
3.3 種群中性檢驗及歷史動態(tài)
3.4 遺傳分化分析
第二章 基于線粒體COX1基因?qū)ξ魇县惢紫x種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究
摘要
引言
1 材料與方法
1.1 試驗材料
1.2 試驗方法
2 實驗結(jié)果
2.1 序列特征
2.2 遺傳多樣性
2.3 單倍型系統(tǒng)進化樹和網(wǎng)絡圖
2.4 群體歷史動態(tài)
2.5 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3. 討論
3.1 遺傳多樣性
3.2 種群中性檢驗及歷史動態(tài)
3.3 遺傳分化
第三部分 結(jié)論和創(chuàng)新點
1. 結(jié)論
2. 創(chuàng)新點
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于線粒體CO2和ND4基因?qū)λ拇ㄊ《範顜Ы{蟲種群遺傳多樣性的分析[J]. 楊德英,任永軍,聶華明,付彥,謝躍,陳林,農(nóng)向,巖寧,古小彬,王淑賢,楊光友. 中國獸醫(yī)學報. 2013(01)
[2]大熊貓等8種野生哺乳動物蛔蟲的線粒體COXⅠ和COXⅡ基因的親緣關(guān)系分析[J]. 牛李麗,陳世界,汪濤,古小彬,嚴玉寶,余華,鄧家波,嚴慧娟,余星明,陳維剛,王淑賢,楊光友. 畜牧獸醫(yī)學報. 2012(10)
[3]基于cytb基因?qū)Υ笮茇埖攘N珍稀野生動物感染蛔蟲的種系發(fā)育分析[J]. 牛李麗,李巖,古小彬,余華,鄧家波,嚴慧娟,余星明,陳維剛,王淑賢,楊光友. 中國獸醫(yī)科學. 2012(09)
[4]基于線粒體12S基因?qū)η嗪5貐^(qū)細粒棘球蚴種群遺傳多態(tài)性研究[J]. 延寧,聶華明,蔣忠榮,鄧世金,余華,嚴玉寶,達瓦次仁,謝躍,付彥,楊德英,郝桂英,古小彬,楊光友. 畜牧獸醫(yī)學報. 2012(06)
[5]基于線粒體細胞色素b基因的細頸囊尾蚴種群遺傳多樣性研究[J]. 郝桂英,楊光友,古小彬,陽愛國,楊應東,王淑賢. 畜牧獸醫(yī)學報. 2012(01)
[6]線蟲線粒體基因組全序列分析研究進展[J]. 賈萬忠,閆鴻斌,倪興維,曹平,婁忠子,付寶權(quán),史萬貴. 中國農(nóng)業(yè)科學. 2011(06)
[7]中國近海小黃魚遺傳變異的細胞色素b序列分析[J]. 彭博,章群,趙爽,樂小亮. 廣東農(nóng)業(yè)科學. 2010(02)
[8]基于ND4基因部分片段探討中國4個家驢品種的母系構(gòu)成[J]. 陳建興,孫玉江,沈偉,潘慶杰,閔令江. 青島農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2009(04)
[9]大熊貓等八種野生珍稀動物蛔蟲ITS-2基因的序列分析[J]. 何光志,牛李麗,楊光友,鄧家波,王帥,余星明,汪濤,古小彬,陳維剛. 中國獸醫(yī)科學. 2008(11)
[10]大熊貓西氏貝蛔蟲與黑熊橫走貝蛔蟲成蟲體內(nèi)8種無機元素的分析[J]. 彭雪蓉,楊光友. 西華師范大學學報(自然科學版). 2007(03)
博士論文
[1]三種海洋魚類分子系統(tǒng)地理學研究[D]. 韓志強.中國海洋大學 2008
碩士論文
[1]基于線粒體COI基因和微衛(wèi)星標記對細鱗鲴種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 張勇.上海海洋大學 2011
本文編號:3494931
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