基于線粒體NAD1和COX1基因的大熊貓西氏貝蛔蟲種群遺傳結(jié)構(gòu)研究
發(fā)布時間:2021-11-14 16:00
大熊貓(Ailuropoda melanoleuca)是世界公認(rèn)的最為瀕危物種之一。在歷史進(jìn)化過程中受氣候變化、人類活動及其自身的生理局限等因素影響,大熊貓經(jīng)兩次顯著地種群擴(kuò)張和收縮后逐漸分化為了秦嶺、岷山和邛崍·相嶺·涼山三個遺傳種群。宿主種群的擴(kuò)張、收縮和遷移決定了寄生蟲種群結(jié)構(gòu)和遺傳分化。西氏貝蛔蟲(Baylisascaris schroederi)是大熊貓體內(nèi)最常見且危害最為嚴(yán)重的寄生蟲。在隨大熊貓協(xié)同進(jìn)化的過程中,西氏貝蛔蟲種群的遺傳結(jié)構(gòu)是否發(fā)生分化目前尚未得知。為了給西氏貝蛔蟲的流行病學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)和抗藥機(jī)制提供一些基礎(chǔ)資料,本研究分別使用線粒體NAD1和COXl基因作為分子標(biāo)記,對來自秦嶺、岷山和邛崍地理種群的西氏貝蛔蟲進(jìn)行了種群遺傳結(jié)構(gòu)研究。本論文主要的研究工作如下:1.基于線粒體NAD1基因?qū)ξ魇县惢紫x的種群遺傳結(jié)構(gòu)研究為了探究中國不同山系大熊貓西氏貝蛔蟲種群遺傳結(jié)構(gòu),本實(shí)驗(yàn)利用PCR技術(shù)擴(kuò)增了三個地理種群的共計(jì)47個樣本(岷山13個,邛崍26個,秦嶺8個)的線粒體NAD1(873bp)基因全序列,并進(jìn)行了種群遺傳結(jié)構(gòu)分析。三個地理種群的47個樣本共分出了15個單倍型...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一部分 文獻(xiàn)綜述
一、種群遺傳學(xué)
1. 種群遺傳學(xué)的概念
2. 影響種群遺傳結(jié)構(gòu)的因素
3. 種群遺傳學(xué)的應(yīng)用
二、線蟲的種群遺傳學(xué)研究
1. 基于SSCP技術(shù)對線蟲群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析
2. 基于RFLP,AFLP和RAPD方法對線蟲群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究
3. 基因序列分析、等位酶標(biāo)記和微衛(wèi)星標(biāo)記應(yīng)用于寄生線蟲遺傳結(jié)構(gòu)分析
三、寄生蟲與宿主間的相互種群影響
1. 協(xié)同進(jìn)化
2. 寄生蟲與宿主種群的相互調(diào)節(jié)
四、展望
五、本研究的目的及意義
第二部分 研究內(nèi)容
第一章 基于線粒體NAD1基因?qū)ξ魇县惢紫x種群遺傳多態(tài)性的研究
摘要
引言
1 試劑與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 序列特征
2.2 遺傳多樣性
2.3 系統(tǒng)發(fā)育樹和單倍型網(wǎng)絡(luò)圖
2.4 群體歷史動態(tài)
2.5 種群遺傳分化
3 討論
3.1 序列特征分析
3.2 遺傳多樣性分析
3.3 種群中性檢驗(yàn)及歷史動態(tài)
3.4 遺傳分化分析
第二章 基于線粒體COX1基因?qū)ξ魇县惢紫x種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究
摘要
引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 序列特征
2.2 遺傳多樣性
2.3 單倍型系統(tǒng)進(jìn)化樹和網(wǎng)絡(luò)圖
2.4 群體歷史動態(tài)
2.5 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3. 討論
3.1 遺傳多樣性
3.2 種群中性檢驗(yàn)及歷史動態(tài)
3.3 遺傳分化
第三部分 結(jié)論和創(chuàng)新點(diǎn)
1. 結(jié)論
2. 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于線粒體CO2和ND4基因?qū)λ拇ㄊ《範(fàn)顜Ы{蟲種群遺傳多樣性的分析[J]. 楊德英,任永軍,聶華明,付彥,謝躍,陳林,農(nóng)向,巖寧,古小彬,王淑賢,楊光友. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2013(01)
[2]大熊貓等8種野生哺乳動物蛔蟲的線粒體COXⅠ和COXⅡ基因的親緣關(guān)系分析[J]. 牛李麗,陳世界,汪濤,古小彬,嚴(yán)玉寶,余華,鄧家波,嚴(yán)慧娟,余星明,陳維剛,王淑賢,楊光友. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(10)
[3]基于cytb基因?qū)Υ笮茇埖攘N珍稀野生動物感染蛔蟲的種系發(fā)育分析[J]. 牛李麗,李巖,古小彬,余華,鄧家波,嚴(yán)慧娟,余星明,陳維剛,王淑賢,楊光友. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2012(09)
[4]基于線粒體12S基因?qū)η嗪5貐^(qū)細(xì)粒棘球蚴種群遺傳多態(tài)性研究[J]. 延寧,聶華明,蔣忠榮,鄧世金,余華,嚴(yán)玉寶,達(dá)瓦次仁,謝躍,付彥,楊德英,郝桂英,古小彬,楊光友. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(06)
[5]基于線粒體細(xì)胞色素b基因的細(xì)頸囊尾蚴種群遺傳多樣性研究[J]. 郝桂英,楊光友,古小彬,陽愛國,楊應(yīng)東,王淑賢. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(01)
[6]線蟲線粒體基因組全序列分析研究進(jìn)展[J]. 賈萬忠,閆鴻斌,倪興維,曹平,婁忠子,付寶權(quán),史萬貴. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(06)
[7]中國近海小黃魚遺傳變異的細(xì)胞色素b序列分析[J]. 彭博,章群,趙爽,樂小亮. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(02)
[8]基于ND4基因部分片段探討中國4個家驢品種的母系構(gòu)成[J]. 陳建興,孫玉江,沈偉,潘慶杰,閔令江. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2009(04)
[9]大熊貓等八種野生珍稀動物蛔蟲ITS-2基因的序列分析[J]. 何光志,牛李麗,楊光友,鄧家波,王帥,余星明,汪濤,古小彬,陳維剛. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2008(11)
[10]大熊貓西氏貝蛔蟲與黑熊橫走貝蛔蟲成蟲體內(nèi)8種無機(jī)元素的分析[J]. 彭雪蓉,楊光友. 西華師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2007(03)
博士論文
[1]三種海洋魚類分子系統(tǒng)地理學(xué)研究[D]. 韓志強(qiáng).中國海洋大學(xué) 2008
碩士論文
[1]基于線粒體COI基因和微衛(wèi)星標(biāo)記對細(xì)鱗鲴種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 張勇.上海海洋大學(xué) 2011
本文編號:3494931
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:47 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
ABSTRACT
第一部分 文獻(xiàn)綜述
一、種群遺傳學(xué)
1. 種群遺傳學(xué)的概念
2. 影響種群遺傳結(jié)構(gòu)的因素
3. 種群遺傳學(xué)的應(yīng)用
二、線蟲的種群遺傳學(xué)研究
1. 基于SSCP技術(shù)對線蟲群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析
2. 基于RFLP,AFLP和RAPD方法對線蟲群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究
3. 基因序列分析、等位酶標(biāo)記和微衛(wèi)星標(biāo)記應(yīng)用于寄生線蟲遺傳結(jié)構(gòu)分析
三、寄生蟲與宿主間的相互種群影響
1. 協(xié)同進(jìn)化
2. 寄生蟲與宿主種群的相互調(diào)節(jié)
四、展望
五、本研究的目的及意義
第二部分 研究內(nèi)容
第一章 基于線粒體NAD1基因?qū)ξ魇县惢紫x種群遺傳多態(tài)性的研究
摘要
引言
1 試劑與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 序列特征
2.2 遺傳多樣性
2.3 系統(tǒng)發(fā)育樹和單倍型網(wǎng)絡(luò)圖
2.4 群體歷史動態(tài)
2.5 種群遺傳分化
3 討論
3.1 序列特征分析
3.2 遺傳多樣性分析
3.3 種群中性檢驗(yàn)及歷史動態(tài)
3.4 遺傳分化分析
第二章 基于線粒體COX1基因?qū)ξ魇县惢紫x種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究
摘要
引言
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 序列特征
2.2 遺傳多樣性
2.3 單倍型系統(tǒng)進(jìn)化樹和網(wǎng)絡(luò)圖
2.4 群體歷史動態(tài)
2.5 群體遺傳結(jié)構(gòu)
3. 討論
3.1 遺傳多樣性
3.2 種群中性檢驗(yàn)及歷史動態(tài)
3.3 遺傳分化
第三部分 結(jié)論和創(chuàng)新點(diǎn)
1. 結(jié)論
2. 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于線粒體CO2和ND4基因?qū)λ拇ㄊ《範(fàn)顜Ы{蟲種群遺傳多樣性的分析[J]. 楊德英,任永軍,聶華明,付彥,謝躍,陳林,農(nóng)向,巖寧,古小彬,王淑賢,楊光友. 中國獸醫(yī)學(xué)報. 2013(01)
[2]大熊貓等8種野生哺乳動物蛔蟲的線粒體COXⅠ和COXⅡ基因的親緣關(guān)系分析[J]. 牛李麗,陳世界,汪濤,古小彬,嚴(yán)玉寶,余華,鄧家波,嚴(yán)慧娟,余星明,陳維剛,王淑賢,楊光友. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(10)
[3]基于cytb基因?qū)Υ笮茇埖攘N珍稀野生動物感染蛔蟲的種系發(fā)育分析[J]. 牛李麗,李巖,古小彬,余華,鄧家波,嚴(yán)慧娟,余星明,陳維剛,王淑賢,楊光友. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2012(09)
[4]基于線粒體12S基因?qū)η嗪5貐^(qū)細(xì)粒棘球蚴種群遺傳多態(tài)性研究[J]. 延寧,聶華明,蔣忠榮,鄧世金,余華,嚴(yán)玉寶,達(dá)瓦次仁,謝躍,付彥,楊德英,郝桂英,古小彬,楊光友. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(06)
[5]基于線粒體細(xì)胞色素b基因的細(xì)頸囊尾蚴種群遺傳多樣性研究[J]. 郝桂英,楊光友,古小彬,陽愛國,楊應(yīng)東,王淑賢. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2012(01)
[6]線蟲線粒體基因組全序列分析研究進(jìn)展[J]. 賈萬忠,閆鴻斌,倪興維,曹平,婁忠子,付寶權(quán),史萬貴. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(06)
[7]中國近海小黃魚遺傳變異的細(xì)胞色素b序列分析[J]. 彭博,章群,趙爽,樂小亮. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(02)
[8]基于ND4基因部分片段探討中國4個家驢品種的母系構(gòu)成[J]. 陳建興,孫玉江,沈偉,潘慶杰,閔令江. 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2009(04)
[9]大熊貓等八種野生珍稀動物蛔蟲ITS-2基因的序列分析[J]. 何光志,牛李麗,楊光友,鄧家波,王帥,余星明,汪濤,古小彬,陳維剛. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2008(11)
[10]大熊貓西氏貝蛔蟲與黑熊橫走貝蛔蟲成蟲體內(nèi)8種無機(jī)元素的分析[J]. 彭雪蓉,楊光友. 西華師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2007(03)
博士論文
[1]三種海洋魚類分子系統(tǒng)地理學(xué)研究[D]. 韓志強(qiáng).中國海洋大學(xué) 2008
碩士論文
[1]基于線粒體COI基因和微衛(wèi)星標(biāo)記對細(xì)鱗鲴種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究[D]. 張勇.上海海洋大學(xué) 2011
本文編號:3494931
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