藏仔豬糞便真菌菌群多樣性分析
發(fā)布時間:2021-11-08 04:14
為探究西藏地區(qū)藏仔豬糞便中真菌菌群結(jié)構(gòu),本研究采用ITS1序列分析新生藏仔豬和斷奶藏仔豬新鮮糞便中真菌的多樣性。結(jié)果表明:從5頭新生藏仔豬新鮮糞便中,共鑒定出5個門、13個綱、25個目、33個科和38個屬的真菌;從5頭斷奶藏仔豬新鮮糞便中,共鑒定出5個門、12個綱、20個目、24個科和28個屬的真菌。子囊菌門和擔(dān)子菌門為優(yōu)勢門,占門級分類的86.35%;布勒擔(dān)菌科、蟲草科、叢赤殼科、曲霉科、絲孢酵母菌科、肉杯菌科、酵母菌科和畢赤酵母菌科為優(yōu)勢科,占科級分類的54.38%。隨著藏仔豬的生長,其糞便中真菌菌群的數(shù)量和優(yōu)勢真菌的相對豐度均發(fā)生變化,這說明不同生長發(fā)育階段會影響藏仔豬糞便中真菌的多樣性。
【文章來源】:菌物學(xué)報(bào). 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
各試驗(yàn)組樣品稀疏曲線圖A:新生藏仔豬;B:斷奶藏仔豬.下同
對獲得的序列按97%的相似度進(jìn)行歸并和OTU劃分,在門、綱、目、科、屬5個分類水平下所獲得的OTU數(shù)見圖2。A組中共鑒定出5個門、13個綱、25個目、33個科和38個屬;B組中共鑒定出5個門、12個綱、20個目、24個科和28個屬。由各分類水平的微生物類群數(shù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果可知,隨著藏仔豬逐漸生長,其糞便真菌在各分類水平的類群統(tǒng)計(jì)數(shù)均減少。由藏仔豬糞便中真菌菌落的Venn圖可知,共計(jì)獲得627個OTUs,A組共有342個OTUs、B組共有488個OTUs,A組和B組的共有OTUs為203個,占總OTUs的32.37%,由此推斷,A組和B組中藏仔豬糞便真菌菌群結(jié)構(gòu)的差異性較大(圖3)。圖3 不同試驗(yàn)組藏仔豬糞便中真菌菌落在屬水平下的Venn圖
不同試驗(yàn)組藏仔豬糞便中真菌菌落在屬水平下的Venn圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]分子系統(tǒng)學(xué)在真菌分類命名中的應(yīng)用與進(jìn)展[J]. 柳朔怡,吳尚為. 微生物學(xué)免疫學(xué)進(jìn)展. 2015(01)
[2]淺析犬貓的真菌病[J]. 王衛(wèi)青,鞠超,高輝,姜淑榮. 湖北畜牧獸醫(yī). 2011(08)
[3]人工飼養(yǎng)大熊貓消化道正常菌群分離與鑒定研究[J]. 馬清義,任建設(shè),史懷平. 北京農(nóng)業(yè). 2009(21)
[4]真菌的分類與命名[J]. 徐德強(qiáng),肖義平. 中國真菌學(xué)雜志. 2006(01)
[5]我國動物真菌病研究進(jìn)展[J]. 李國勤,趙寶玉. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 1997(03)
本文編號:3482983
【文章來源】:菌物學(xué)報(bào). 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
各試驗(yàn)組樣品稀疏曲線圖A:新生藏仔豬;B:斷奶藏仔豬.下同
對獲得的序列按97%的相似度進(jìn)行歸并和OTU劃分,在門、綱、目、科、屬5個分類水平下所獲得的OTU數(shù)見圖2。A組中共鑒定出5個門、13個綱、25個目、33個科和38個屬;B組中共鑒定出5個門、12個綱、20個目、24個科和28個屬。由各分類水平的微生物類群數(shù)統(tǒng)計(jì)結(jié)果可知,隨著藏仔豬逐漸生長,其糞便真菌在各分類水平的類群統(tǒng)計(jì)數(shù)均減少。由藏仔豬糞便中真菌菌落的Venn圖可知,共計(jì)獲得627個OTUs,A組共有342個OTUs、B組共有488個OTUs,A組和B組的共有OTUs為203個,占總OTUs的32.37%,由此推斷,A組和B組中藏仔豬糞便真菌菌群結(jié)構(gòu)的差異性較大(圖3)。圖3 不同試驗(yàn)組藏仔豬糞便中真菌菌落在屬水平下的Venn圖
不同試驗(yàn)組藏仔豬糞便中真菌菌落在屬水平下的Venn圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]分子系統(tǒng)學(xué)在真菌分類命名中的應(yīng)用與進(jìn)展[J]. 柳朔怡,吳尚為. 微生物學(xué)免疫學(xué)進(jìn)展. 2015(01)
[2]淺析犬貓的真菌病[J]. 王衛(wèi)青,鞠超,高輝,姜淑榮. 湖北畜牧獸醫(yī). 2011(08)
[3]人工飼養(yǎng)大熊貓消化道正常菌群分離與鑒定研究[J]. 馬清義,任建設(shè),史懷平. 北京農(nóng)業(yè). 2009(21)
[4]真菌的分類與命名[J]. 徐德強(qiáng),肖義平. 中國真菌學(xué)雜志. 2006(01)
[5]我國動物真菌病研究進(jìn)展[J]. 李國勤,趙寶玉. 動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 1997(03)
本文編號:3482983
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