CRISPR/Cas9介導雞細胞PPARγ基因的敲除
發(fā)布時間:2021-11-06 20:48
在哺乳動物中,PPARγ能夠調控許多參與脂肪細胞分化和脂質代謝的基因,并且廣泛參與脂肪的吸收、運輸、生成和分解等,但在雞中關于該基因的研究還不夠深入。CRISPR/Cas9技術通過sgRNA特異性識別含有PAM的靶DNA序列,Cas9蛋白對靶序列進行切割,然后通過細胞DNA修復機制進行修復從而實現(xiàn)基因組的高效編輯。本研究主要利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)對雞DF-1細胞系和原代前脂肪細胞PPARγ基因進行靶向敲除,從而為研究PPARγ基因在雞脂肪細胞分化中的作用和生產轉基因雞奠定基礎。1.為了利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)對雞DF-1細胞系和原代前脂肪細胞PPARγ基因進行靶向敲除,本研究在GenBank查找雞PPARγ的基因組序列后,通過麻省理工學院的http://crispr.Mit.edu軟件設計了1對sgRNA,成功構建了靶向PPARγ基因的pll3.7-U6-sgPPARγ-CMV-spCas9(sgPPARγ-Cas9)表達載體和pB-CMV-DsRed-CAG-PPARγ.200bp repeat.Puro-T2A-GFP(RPG-PPARγ)雙熒光報告載體。2.為了驗證...
【文章來源】:西北農林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.1 PPAR基因研究進展概述
1.1.1 PPAR的類型和組織特異性表達
1.1.2 PPARγ的結構和調控機制
1.1.3 PPARγ在肥胖程度不同的個體中的表達規(guī)律
1.1.4 PPARγ的配體
1.1.5 PPARγ在脂肪形成的作用
1.1.6 雞PPARγ的調控模式
1.2 CRISPR/Cas9技術
1.2.1 CRISPR/Cas的免疫獲得和分類
1.2.2 CRISPR/Cas9的作用機理
1.2.3 CRISPR/Cas9的應用
1.2.4 CRISPR/Cas9的脫靶效應
1.3 電穿孔轉染技術
1.4 SSA-RPG篩選報告系統(tǒng)
1.5 目的與意義
第二章 CRISPR/Cas9系統(tǒng)的建立
2.1 試驗材料
2.1.1 主要儀器設備
2.1.2 主要試劑與試劑配置
2.1.3 菌株和質粒
2.1.4 引物序列
2.2 試驗方法
2.2.1 PPARγ靶位點的選擇
2.2.2 CIRSPR-Cas9表達載體的構建
2.2.3 RPG-PPARγ報告載體的構建
2.3 試驗結果
2.3.1 CIRSPR-Cas9表達載體的構建
2.3.2 RPG報告載體的構建
2.4 討論
2.5 小結
第三章 利用CRIPSR/Cas9系統(tǒng)敲除雞DF1細胞系中PPARγ基因
3.1 試驗材料
3.1.1 主要儀器
3.1.2 主要試劑及試劑配制
3.1.3 菌株,細胞系,質粒
3.2 試驗方法
3.2.1 DF-1 細胞的培養(yǎng)
3.2.2 DF-1 細胞的轉染
3.2.3 DF-1 陽性細胞的篩選與富集
3.2.4 DF-1 細胞基因組水平的檢測
3.2.5 脫靶檢測
3.3 試驗結果
3.3.1 載體水平的檢測
3.3.2 陽性細胞的篩選與富集
3.3.3 基因組水平的檢測
3.3.4 脫靶檢測結果
3.4 討論
3.5 小結
第四章 利用CRIPSR/Cas9系統(tǒng)敲除雞前脂肪細胞中PPARγ基因
4.1 試驗材料
4.1.1 試驗器材
4.1.2 主要試劑及試劑配制
4.2 試驗方法
4.2.1 雞前脂肪細胞的分離和培養(yǎng)
4.2.2 電穿孔法轉染雞前脂肪細胞
4.2.3 前脂肪細胞嘌呤霉素的篩選
4.2.4 前脂肪細胞基因組的檢測
4.3 試驗結果
4.3.1 前脂肪細胞的分離與培養(yǎng)
4.3.2 CRISPR/Cas9在前脂肪細胞中報告載體水平的檢測
4.3.3 陽性前脂肪細胞嘌呤霉素的篩選
4.3.4 基因組水平檢測
4.4 討論
4.4.1 前脂肪細胞的轉染
4.4.2 利用CRIPSR/Cas9系統(tǒng)敲除雞前脂肪細胞中PPARγ基因
4.5 小結
結論和創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
作者簡介
【參考文獻】:
期刊論文
[1]雞PPARγ基因的表達特性及其對脂肪細胞增殖分化的影響[J]. 王麗,那威,王宇祥,王彥博,王寧,王啟貴,李玉茂,李輝. 遺傳. 2012(04)
博士論文
[1]肉牛PPARs家族和PLIN基因遺傳變異及其與秦川牛胴體、肉質性狀相關分析[D]. 樊月圓.西北農林科技大學 2010
本文編號:3480500
【文章來源】:西北農林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
1.1 PPAR基因研究進展概述
1.1.1 PPAR的類型和組織特異性表達
1.1.2 PPARγ的結構和調控機制
1.1.3 PPARγ在肥胖程度不同的個體中的表達規(guī)律
1.1.4 PPARγ的配體
1.1.5 PPARγ在脂肪形成的作用
1.1.6 雞PPARγ的調控模式
1.2 CRISPR/Cas9技術
1.2.1 CRISPR/Cas的免疫獲得和分類
1.2.2 CRISPR/Cas9的作用機理
1.2.3 CRISPR/Cas9的應用
1.2.4 CRISPR/Cas9的脫靶效應
1.3 電穿孔轉染技術
1.4 SSA-RPG篩選報告系統(tǒng)
1.5 目的與意義
第二章 CRISPR/Cas9系統(tǒng)的建立
2.1 試驗材料
2.1.1 主要儀器設備
2.1.2 主要試劑與試劑配置
2.1.3 菌株和質粒
2.1.4 引物序列
2.2 試驗方法
2.2.1 PPARγ靶位點的選擇
2.2.2 CIRSPR-Cas9表達載體的構建
2.2.3 RPG-PPARγ報告載體的構建
2.3 試驗結果
2.3.1 CIRSPR-Cas9表達載體的構建
2.3.2 RPG報告載體的構建
2.4 討論
2.5 小結
第三章 利用CRIPSR/Cas9系統(tǒng)敲除雞DF1細胞系中PPARγ基因
3.1 試驗材料
3.1.1 主要儀器
3.1.2 主要試劑及試劑配制
3.1.3 菌株,細胞系,質粒
3.2 試驗方法
3.2.1 DF-1 細胞的培養(yǎng)
3.2.2 DF-1 細胞的轉染
3.2.3 DF-1 陽性細胞的篩選與富集
3.2.4 DF-1 細胞基因組水平的檢測
3.2.5 脫靶檢測
3.3 試驗結果
3.3.1 載體水平的檢測
3.3.2 陽性細胞的篩選與富集
3.3.3 基因組水平的檢測
3.3.4 脫靶檢測結果
3.4 討論
3.5 小結
第四章 利用CRIPSR/Cas9系統(tǒng)敲除雞前脂肪細胞中PPARγ基因
4.1 試驗材料
4.1.1 試驗器材
4.1.2 主要試劑及試劑配制
4.2 試驗方法
4.2.1 雞前脂肪細胞的分離和培養(yǎng)
4.2.2 電穿孔法轉染雞前脂肪細胞
4.2.3 前脂肪細胞嘌呤霉素的篩選
4.2.4 前脂肪細胞基因組的檢測
4.3 試驗結果
4.3.1 前脂肪細胞的分離與培養(yǎng)
4.3.2 CRISPR/Cas9在前脂肪細胞中報告載體水平的檢測
4.3.3 陽性前脂肪細胞嘌呤霉素的篩選
4.3.4 基因組水平檢測
4.4 討論
4.4.1 前脂肪細胞的轉染
4.4.2 利用CRIPSR/Cas9系統(tǒng)敲除雞前脂肪細胞中PPARγ基因
4.5 小結
結論和創(chuàng)新點
參考文獻
附錄
致謝
作者簡介
【參考文獻】:
期刊論文
[1]雞PPARγ基因的表達特性及其對脂肪細胞增殖分化的影響[J]. 王麗,那威,王宇祥,王彥博,王寧,王啟貴,李玉茂,李輝. 遺傳. 2012(04)
博士論文
[1]肉牛PPARs家族和PLIN基因遺傳變異及其與秦川牛胴體、肉質性狀相關分析[D]. 樊月圓.西北農林科技大學 2010
本文編號:3480500
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