如何有效的考慮多個(gè)性狀之間的相關(guān)關(guān)系，去除其它性狀對(duì)分析性狀的影響，更加準(zhǔn)確的估計(jì)QTL的遺傳效應(yīng)和位置信息一直都是一個(gè)研究熱點(diǎn)問題。本文綜述了QTL定位的背景和發(fā)展歷程，并對(duì)存在的多性狀定位方法做出了簡(jiǎn)要的介紹，最后提出一種基于LASSO的多性狀QTL定位方法。根據(jù)每個(gè)性狀與其他性狀之間的關(guān)系定義了分析性狀的條件性狀，這個(gè)條件性狀考慮了分析性狀與其他性狀的關(guān)系，剔除掉其它性狀對(duì)分析性狀的影響。帶有坐標(biāo)下降的LASSO方法能夠用于同時(shí)估計(jì)稀疏QTL的非零遺傳效應(yīng)。因此，高維的基因型表型數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析被轉(zhuǎn)換成基因型數(shù)據(jù)與單獨(dú)的條件性狀之間的關(guān)聯(lián)分析。為了比較了條件分析方法，聯(lián)合分析方法，和單獨(dú)分析方法的參數(shù)估計(jì)和統(tǒng)計(jì)效率。本研究在回交群體中模擬了2個(gè)群體，每個(gè)群體2個(gè)性狀，在性狀之間設(shè)定不同的相關(guān)。3種方法的共性規(guī)律為：（1）隨著遺傳力的增加QTL檢測(cè)效率和參數(shù)估計(jì)的準(zhǔn)確度也逐漸增加；（2）在相同的定位條件和方法下，遺傳效應(yīng)較高的QTL有較高的統(tǒng)計(jì)效率；（3）大的樣本含量有利于檢測(cè)QTL。3種方法在以下方面存在差異:（1）當(dāng)兩個(gè)性狀之間存在相關(guān)時(shí)，條件定位方法與聯(lián)合分析法有著一致的結(jié)果，定... 

【文章來(lái)源】：上海交通大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

基因表達(dá)YDL154W的相關(guān)的結(jié)構(gòu)和遺傳控制Figure4-2CorrelationarchitectureandgeneticcontrolforgeneexpressionYDL154Winyeast


本文編號(hào)：3472068