為探討MEISETZ基因與犏牛雄性不育可能性關(guān)系,克隆測(cè)序牦牛、犏牛MEISETZ基因CDS區(qū),運(yùn)用生物信息學(xué)軟件對(duì)其編碼區(qū)作序列分析、蛋白結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測(cè)。結(jié)果表明,牦牛、犏牛MEISETZ基因CDS區(qū)長度均為688 bp,編碼222個(gè)氨基酸殘基;牦牛、犏牛MEISETZ蛋白均為偏堿性蛋白,不穩(wěn)定指數(shù)高于閾值,蛋白結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定,均無跨膜結(jié)構(gòu)域,無信號(hào)肽,屬非分泌型蛋白,二三級(jí)結(jié)構(gòu)均以無規(guī)卷曲為主,均含有SET超家族結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,犏牛與牦牛聚為一類,親緣關(guān)系最密切,序列高度保守。牦牛與犏牛核苷酸序列相比,共有4處發(fā)生堿基變異,相似性為99.4%;牦牛MEISETZ蛋白氨基酸序列與犏牛相比,144位（A→G）、204位（P→Q）2個(gè)位點(diǎn)發(fā)生變異,同源性為99.1%,研究為牦牛、犏牛MEISETZ基因結(jié)構(gòu)與功能特別是犏牛雄性不育后續(xù)研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。 

【文章來源】：東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,51(07)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

重組子鑒定結(jié)果

將提取的重組質(zhì)粒pGEM-T Vector-MEISETZ用限制性內(nèi)切酶Eco RⅠ、HindⅢ酶切消化，消化產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖2B所示，得到2 692 bp載體序列和目的片段，說明目的片段正向插入p GEM-T載體，成功構(gòu)建重組質(zhì)粒。圖2 重組子鑒定結(jié)果

使用軟件ExPASy-ProtParam預(yù)測(cè)牦牛、犏牛MEISETZ蛋白理化性質(zhì)。牦牛和犏牛MEISETZ基因分子質(zhì)量分別為25.081和25.098 ku；蛋白等電點(diǎn)均為5.66，為偏酸性蛋白；帶負(fù)電荷氨基酸殘基（Asp+Glu）均為30個(gè)，正電荷氨基酸殘基（Arg+Lys）均為24個(gè)，其中絲氨酸（Ser）數(shù)量最多，均為23個(gè)，占比10.4%，甲硫氨酸（Met）含量最少，均為1個(gè)，且除丙氨酸（Ala）、甘氨酸（Gly）、谷氨酰胺（Gln）、脯氨酸（Pro）含量有差別外，其余氨基酸含量均相同；不穩(wěn)定指數(shù)分別為48.21、47.68，高于閾值40，表明牦牛和犏牛MEISETZ蛋白結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定；脂肪系數(shù)分別為65.9、65.45，說明牦牛、犏牛該蛋白流動(dòng)性好；總平均親水系數(shù)（GRAVY）為-0.829、-0.848，結(jié)合ExPASy-ProtScale預(yù)測(cè)結(jié)果，牦牛、犏牛MEISETZ蛋白中大多數(shù)氨基酸為親水性，屬于親水性蛋白。圖4 MEISETZ基因系統(tǒng)進(jìn)化樹

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]甘氨酸對(duì)仔豬生長及腸道功能影響的研究[D]. 王薇薇.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3459045