lncRNA THOR敲除小鼠和家兔模型的構(gòu)建及其對(duì)細(xì)胞增殖影響的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-10-24 23:15
lncRNA THOR被證實(shí)在多種癌癥及哺乳動(dòng)物睪丸中表達(dá),又被稱為癌/睪丸(Cancer/testis)lncRNA。THOR基因位于染色體2q14.2處,有三個(gè)外顯子,總長(zhǎng)度為3.465 kb。研究表明,THOR基因在雄性生殖中有重要的作用,但目前尚缺少哺乳動(dòng)物模型支持該理論研究。關(guān)于THOR在雄性生育力中的作用機(jī)制需要進(jìn)一步闡明。此外,已有研究表明lncRNA上的m6A甲基化修飾在腫瘤進(jìn)程中發(fā)揮重要作用,并且THOR的互作蛋白IGF2BP1是m6A識(shí)別蛋白IGF2BPs中的一員。但THOR的致癌作用是否與m6A相關(guān)尚無(wú)研究報(bào)道。因此,本論文通過(guò)構(gòu)建lncRNA THOR基因敲除小鼠、家兔模型,探討其對(duì)哺乳動(dòng)物生殖能力影響的分子機(jī)理。并通過(guò)構(gòu)建lncRNA THOR和METTL3基因敲除的H1299細(xì)胞系,闡述m6A甲基化修飾對(duì)lncRNA THOR促進(jìn)細(xì)胞增殖的調(diào)節(jié)作用。首先,利用CRISPR/Cas9技術(shù),成功構(gòu)建THOR基因敲除小鼠和家兔模型。經(jīng)PCR擴(kuò)增、Sanger測(cè)序、qRT-PCR結(jié)果顯示,THOR基因敲除小鼠和家兔模型均為全長(zhǎng)缺失個(gè)體。同時(shí)Sanger測(cè)序及T7EI...
【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:155 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
CRISPR/Cas系統(tǒng)的簡(jiǎn)史[2]
第一篇綜述第1章CRISPR/Cas系統(tǒng)所介導(dǎo)的基因編輯技術(shù)的研究進(jìn)展5Ⅲ的作用下加工成成熟的CRISPRRNA(crRNA),每個(gè)都包含間隔子序列和側(cè)翼重復(fù)的部分。在切割(或者效應(yīng))區(qū)域中參與靶標(biāo)識(shí)別和核酸切割,在此過(guò)程中Cas蛋白和成熟的crRNA核糖核蛋白復(fù)合物(Ribonucleoproteincomplex,RNP)該復(fù)合物通過(guò)crRNA和靶核酸的堿基配對(duì)識(shí)別并切割入侵的外源DNA(或RNA)。圖1.2CRISPR/Cas系統(tǒng)的適應(yīng)性免疫系統(tǒng)[3]Figure1.2OverviewofadaptiveimmunitybyCRISPR/Cassystems[3]1.3CRISPR/Cas系統(tǒng)的組成和分類隨著研究的深入,近年來(lái)越來(lái)越多的CRISPR/Cas系統(tǒng)和Cas蛋白被發(fā)現(xiàn),根據(jù)針對(duì)CRISPR/Cas類型和亞型的特征基因鑒定,基因庫(kù)和基因組基因座組織
吉林大學(xué)博士學(xué)位論文6的比較,以及基于序列相似性的聚類和對(duì)CRISPR/Cas系統(tǒng)不同亞型中保守的基因的系統(tǒng)發(fā)育分析等方法對(duì)CRISPR/Cas系統(tǒng)進(jìn)行分類。因此,得到了兩大類CRISPR/Cas系統(tǒng)(Class1和Class2)(圖1.3)[1]。圖1.31類和2類CRISPR/Cas基因座的通用結(jié)構(gòu)[1]Figure1.3ThetwoclassesofCRISPR/Cassystems[1]1.3.1Class1-CRISPR/Cas系統(tǒng)在1類CRISPR/Cas系統(tǒng)中,主要包括Ⅰ、Ⅲ和Ⅳ型CRISPR/Cas系統(tǒng)(圖1.4)[1]。1.3.1.1Ⅰ型Ⅰ型CRISPR/Cas系統(tǒng)中,采用的是稱為CRISPR相關(guān)復(fù)合物的多亞基核糖核蛋白復(fù)合物進(jìn)行抗病毒防御(級(jí)聯(lián)式),以進(jìn)行目標(biāo)DNA識(shí)別和切割[4],根據(jù)其效應(yīng)復(fù)合體的主要成分區(qū)別,將其分為ⅠA到E和ⅠF1到3以及ⅠG共十種亞型,其中ⅠA亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas11(csa5)、cas7、cas5和cas8a1組成;ⅠB亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8b1、cas7和cas5;ⅠC亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas5、cas8c和cas7;ⅠG亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8u2、cas7和GSU0054(cas5和cas6);ⅠD亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas3’’-cas10d、cas7(cas2)、cas5和cas6;ⅠE亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8e(cas1)、cas11(cse2)、cas7、cas5和cas6;ⅠF1亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8f1(csy1)、cas5f1(csy2)、cas7f1(csy3)和cas6f;ⅠF2亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas7f2(PBPRB1993)、cas5f2(PBPRB1992)和cas6f;ⅠF3亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8f3/cas5f3、cas7f3和cas6f。1.3.1.2Ⅲ型Ⅲ型CRISPR/Cas系統(tǒng)中,較為不同的是環(huán)狀寡核苷酸(cOA)信號(hào)通路協(xié)同其效應(yīng)復(fù)合體和CARF(CRISPR-associatedRossmannfold)域核糖核酸酶(Csm6/Csx1家族)來(lái)發(fā)揮作用[5-9],根據(jù)其效應(yīng)復(fù)合體的主要成分區(qū)別,將其分為ⅢA、D、E、F、C和B三種亞型,其中ⅢA亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas10、
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]N6 -methyl-adenosine (m6 A) in RNA: An Old Modification with A Novel Epigenetic Function[J]. Yamei Niu,Xu Zhao,Yong-Sheng Wu,Ming-Ming Li,Xiu-Jie Wang,Yun-Gui Yang. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 2013(01)
本文編號(hào):3456178
【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
CRISPR/Cas系統(tǒng)的簡(jiǎn)史[2]
第一篇綜述第1章CRISPR/Cas系統(tǒng)所介導(dǎo)的基因編輯技術(shù)的研究進(jìn)展5Ⅲ的作用下加工成成熟的CRISPRRNA(crRNA),每個(gè)都包含間隔子序列和側(cè)翼重復(fù)的部分。在切割(或者效應(yīng))區(qū)域中參與靶標(biāo)識(shí)別和核酸切割,在此過(guò)程中Cas蛋白和成熟的crRNA核糖核蛋白復(fù)合物(Ribonucleoproteincomplex,RNP)該復(fù)合物通過(guò)crRNA和靶核酸的堿基配對(duì)識(shí)別并切割入侵的外源DNA(或RNA)。圖1.2CRISPR/Cas系統(tǒng)的適應(yīng)性免疫系統(tǒng)[3]Figure1.2OverviewofadaptiveimmunitybyCRISPR/Cassystems[3]1.3CRISPR/Cas系統(tǒng)的組成和分類隨著研究的深入,近年來(lái)越來(lái)越多的CRISPR/Cas系統(tǒng)和Cas蛋白被發(fā)現(xiàn),根據(jù)針對(duì)CRISPR/Cas類型和亞型的特征基因鑒定,基因庫(kù)和基因組基因座組織
吉林大學(xué)博士學(xué)位論文6的比較,以及基于序列相似性的聚類和對(duì)CRISPR/Cas系統(tǒng)不同亞型中保守的基因的系統(tǒng)發(fā)育分析等方法對(duì)CRISPR/Cas系統(tǒng)進(jìn)行分類。因此,得到了兩大類CRISPR/Cas系統(tǒng)(Class1和Class2)(圖1.3)[1]。圖1.31類和2類CRISPR/Cas基因座的通用結(jié)構(gòu)[1]Figure1.3ThetwoclassesofCRISPR/Cassystems[1]1.3.1Class1-CRISPR/Cas系統(tǒng)在1類CRISPR/Cas系統(tǒng)中,主要包括Ⅰ、Ⅲ和Ⅳ型CRISPR/Cas系統(tǒng)(圖1.4)[1]。1.3.1.1Ⅰ型Ⅰ型CRISPR/Cas系統(tǒng)中,采用的是稱為CRISPR相關(guān)復(fù)合物的多亞基核糖核蛋白復(fù)合物進(jìn)行抗病毒防御(級(jí)聯(lián)式),以進(jìn)行目標(biāo)DNA識(shí)別和切割[4],根據(jù)其效應(yīng)復(fù)合體的主要成分區(qū)別,將其分為ⅠA到E和ⅠF1到3以及ⅠG共十種亞型,其中ⅠA亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas11(csa5)、cas7、cas5和cas8a1組成;ⅠB亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8b1、cas7和cas5;ⅠC亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas5、cas8c和cas7;ⅠG亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8u2、cas7和GSU0054(cas5和cas6);ⅠD亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas3’’-cas10d、cas7(cas2)、cas5和cas6;ⅠE亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8e(cas1)、cas11(cse2)、cas7、cas5和cas6;ⅠF1亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8f1(csy1)、cas5f1(csy2)、cas7f1(csy3)和cas6f;ⅠF2亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas7f2(PBPRB1993)、cas5f2(PBPRB1992)和cas6f;ⅠF3亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas8f3/cas5f3、cas7f3和cas6f。1.3.1.2Ⅲ型Ⅲ型CRISPR/Cas系統(tǒng)中,較為不同的是環(huán)狀寡核苷酸(cOA)信號(hào)通路協(xié)同其效應(yīng)復(fù)合體和CARF(CRISPR-associatedRossmannfold)域核糖核酸酶(Csm6/Csx1家族)來(lái)發(fā)揮作用[5-9],根據(jù)其效應(yīng)復(fù)合體的主要成分區(qū)別,將其分為ⅢA、D、E、F、C和B三種亞型,其中ⅢA亞型的效應(yīng)復(fù)合體主要由cas10、
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]N6 -methyl-adenosine (m6 A) in RNA: An Old Modification with A Novel Epigenetic Function[J]. Yamei Niu,Xu Zhao,Yong-Sheng Wu,Ming-Ming Li,Xiu-Jie Wang,Yun-Gui Yang. Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 2013(01)
本文編號(hào):3456178
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