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基于Y染色體遺傳標(biāo)記分析建昌馬的遺傳多樣性

發(fā)布時間:2021-10-23 05:22
  為了分析建昌馬的Y染色體遺傳多樣性和父系起源進(jìn)化,試驗從建昌馬公馬(n=21)血液樣本中提取基因組DNA,對馬Y染色體上4個遺傳標(biāo)記位點(Y-25 345、Y-45 288、Y-45 701/977、Y-50 869)進(jìn)行PCR擴(kuò)增后直接測序,分析測序結(jié)果并定義馬Y染色體單倍型。結(jié)果表明:在建昌馬的1個遺傳標(biāo)記位點發(fā)現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性(Y-50 869,T/A),共鑒定出2種單倍型,即CHT1和CHT2,其中CHT1單倍型占絕對優(yōu)勢,單倍型多樣性為0.095±0.084,核苷酸多樣性為0.000 36±0.000 32,Y染色體遺傳多樣性低。說明建昌馬可能有2個父系起源。 

【文章來源】:黑龍江畜牧獸醫(yī). 2020,(18)北大核心

【文章頁數(shù)】:3 頁

【部分圖文】:

基于Y染色體遺傳標(biāo)記分析建昌馬的遺傳多樣性


馬Y染色體4個位點PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果

建昌,位點,單倍型


PCR產(chǎn)物測序結(jié)果顯示,21匹建昌馬公馬中Y-25 345、Y-45 288和Y-45 701/997位點均沒有發(fā)現(xiàn)SNP,但1匹建昌馬的Y-50 869位點存在T/A顛換突變,見圖2。根據(jù)Y-50 869位點的1個SNP,將21匹建昌馬分為2種單倍型,分別為CHT1和CHT2單倍型,個體數(shù)比例分別為95.24%、4.76%,見表2。通過DnaSPv 5.10.01軟件計算得到單倍型多樣性為0.095±0.084,核苷酸多樣性為0.000 36±0.000 32。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]建昌馬的數(shù)量分布及其影響因素[J]. 楊世忠,林代俊,王毅.  草業(yè)與畜牧. 2012(01)
[2]關(guān)中馬mtDNA D-loop區(qū)遺傳多態(tài)性分析[J]. 蘇銳,謝文美,張云生,王小斌,張春梅,王美菊,陳宏,雷初朝.  西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2008(06)
[3]Y染色體的多態(tài)性遺傳標(biāo)記及其法醫(yī)學(xué)應(yīng)用[J]. 張健,侯一平,唐劍頻.  中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志. 2002(05)



本文編號:3452552

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