山西省雞源新城疫病毒基因特性分析
發(fā)布時間:2021-10-14 13:49
為調(diào)查山西省雞源新城疫病毒(NDV)的流行現(xiàn)狀,本研究于2011-2012年從山西省部分地區(qū)的發(fā)病雞群分離、鑒定出5株NDV,參考GenBank中已發(fā)表的NDV F基因序列(FJ969394),設(shè)計了用于擴增F基因的特異引物,應(yīng)用RT-PCR技術(shù)擴增5株分離株的F基因片段。將擴增、純化的目的片段DNA與PMD19simple-T載體連接,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞,運用菌落PCR法鑒定,將鑒定為含有陽性質(zhì)粒的重組菌進行基因測序。利用DNAStar7.1軟件對5株NDV的分子生物學特性進行了研究,包括繪制系統(tǒng)發(fā)育進化樹、確定基因型,并與參考毒株的核苷酸及相應(yīng)氨基酸序列進行比較。對分離株F基因序列的分析結(jié)果表明:其中的4株病毒在基因型分類上屬于基因II亞型,并與標準弱毒疫苗LaSota株高度同源,核苷酸序列同源性為99.2%-99.4%,氨基酸序列同源性為100%,且裂解位點氨基酸序列為:112G-R-Q-G-R-L117,符合弱毒株裂解位點特征。另1分離毒株在基因型分類上與JS/5/01/Go同屬基因Ⅶd亞型,兩者核苷酸序列同源性為95.6%,氨基酸序列同源性為97.5%,其裂解位點氨基酸序列為:1...
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學山西省
【文章頁數(shù)】:28 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
符號說明
前言
1 文獻綜述
1.1 新城疫發(fā)病特點
1.2 新城疫病原學
1.3 NDV的分子生物學特性
1.4 我國NDV分子生物學及其疫苗的研究進展
1.4.1 我國NDV分子生物學研究進展
1.4.2 新城疫疫苗研究現(xiàn)狀
1.5 本研究的內(nèi)容、目的及意義
2 NDV的分離鑒定及F基因片段的擴增
2.1 NDV的分離鑒定
2.1.1 材料與方法
2.1.2 結(jié)果與分析
2.1.3 討論
2.2 NDV F基因可變區(qū)部分序列的擴增與分析
2.2.1 材料與方法
2.2.2 結(jié)果與分析
2.2.3 討論
2.3 結(jié)論
參考文獻
Abstract
致謝
本文編號:3436282
【文章來源】:山西農(nóng)業(yè)大學山西省
【文章頁數(shù)】:28 頁
【學位級別】:碩士
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摘要
符號說明
前言
1 文獻綜述
1.1 新城疫發(fā)病特點
1.2 新城疫病原學
1.3 NDV的分子生物學特性
1.4 我國NDV分子生物學及其疫苗的研究進展
1.4.1 我國NDV分子生物學研究進展
1.4.2 新城疫疫苗研究現(xiàn)狀
1.5 本研究的內(nèi)容、目的及意義
2 NDV的分離鑒定及F基因片段的擴增
2.1 NDV的分離鑒定
2.1.1 材料與方法
2.1.2 結(jié)果與分析
2.1.3 討論
2.2 NDV F基因可變區(qū)部分序列的擴增與分析
2.2.1 材料與方法
2.2.2 結(jié)果與分析
2.2.3 討論
2.3 結(jié)論
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致謝
本文編號:3436282
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