水牛Y-SNPs篩選及多拷貝基因鑒定
發(fā)布時(shí)間:2021-10-12 19:06
水牛既是我國(guó)南方水稻種植區(qū)的重要役畜,也是人們的重要食物來源。根據(jù)表型和習(xí)性可將家養(yǎng)水牛分為兩類:沼澤型水牛(2n=48)和河流型水牛(2n=50)。我國(guó)的地方水牛為沼澤型水牛。目前,對(duì)于水牛起源進(jìn)化的研究在考古學(xué)、形態(tài)學(xué)與分子遺傳學(xué)方面均有涉及,大量線粒體DNA的研究雖能提供水牛母系起源的證據(jù),但仍需Y染色體分子遺傳多樣性方面的研究來提供水牛父系起源的遺傳學(xué)證據(jù)。本研究以14個(gè)中國(guó)地方水牛類群的229頭水牛為研究對(duì)象,以5頭河流型公水牛樣本為對(duì)照,利用已發(fā)表的水牛Y-SNP多態(tài)位點(diǎn)和GenBank上公布的家牛Y染色體序列信息,選擇位于MSY區(qū)的SRY、ZFY、USP9Y、DBY、UTY、OFD1Y、AMGY、AMELY、TSPY及RPS4Y1共10個(gè)基因,新設(shè)計(jì)50對(duì)水牛Y-SNP特異性引物,采用混合DNA池、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物直接測(cè)序等方法,篩選水牛Y-SNP多態(tài)標(biāo)記;利用TA克隆及測(cè)序的方法對(duì)水牛Y染色體多拷貝基因進(jìn)行鑒定,得到以下結(jié)果:1、水牛Y-SNPs篩選(1)通過對(duì)位于MSY區(qū)的10個(gè)基因(SRY、ZFY、USP9Y、DBY(DDX3Y)、UTY、OFD1Y、AMGY、AME...
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
中國(guó)水牛-西林水牛
圖 1-1 中國(guó)水牛-西林水牛 圖 1-2 中國(guó)水牛-涪陵水牛Figure 1-1 Chinese buffalo- Xilin buffalo Figure 1-2 Chinese buffalo-Fuling buffalo河流型水牛則全身黑灰色,頭部較長(zhǎng),牛角向上彎曲成螺旋狀,前額稍微隆起,前胸寬闊,肌肉發(fā)達(dá),身軀較長(zhǎng),后肢發(fā)達(dá),尾巴較長(zhǎng),超過臀部。著名的品種有摩拉水牛和尼里拉菲水牛(圖 1-3,圖 1-4),二者都是優(yōu)良的乳用水牛品種,同時(shí)耐粗飼、抗病能力強(qiáng),都已被我國(guó)大量引入用于品種改良。
圖 1-1 中國(guó)水牛-西林水牛 圖 1-2 中國(guó)水牛-涪陵水牛Figure 1-1 Chinese buffalo- Xilin buffalo Figure 1-2 Chinese buffalo-Fuling buffalo河流型水牛則全身黑灰色,頭部較長(zhǎng),牛角向上彎曲成螺旋狀,前額稍微隆起,前胸寬闊,肌肉發(fā)達(dá),身軀較長(zhǎng),后肢發(fā)達(dá),尾巴較長(zhǎng),超過臀部。著名的品種有摩拉水牛和尼里拉菲水牛(圖 1-3,圖 1-4),二者都是優(yōu)良的乳用水牛品種,同時(shí)耐粗飼、抗病能力強(qiáng),都已被我國(guó)大量引入用于品種改良。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]沼澤型與河流型水牛Y染色體性別決定基因(SRY)編碼區(qū)序列的比較分析[J]. 霍金龍,苗永旺,李大林,袁峰,劉麗仙. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(06)
[2]沼澤型水牛Y染微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選與多態(tài)性檢測(cè)[J]. 張曉明,樂祥鵬,張春梅,藍(lán)賢勇,陳宏,雷初朝. 遺傳. 2010(03)
[3]中國(guó)水牛mtDNA D-loop區(qū)遺傳多樣性與母系起源[J]. 謝文美,蘇銳,張曉明,張?jiān)粕?王小斌,雷初朝. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2009(05)
[4]海子水牛Cyt b基因序列分析[J]. 李世平,常洪,馬國(guó)龍,陳宏宇. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(30)
本文編號(hào):3433139
【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
中國(guó)水牛-西林水牛
圖 1-1 中國(guó)水牛-西林水牛 圖 1-2 中國(guó)水牛-涪陵水牛Figure 1-1 Chinese buffalo- Xilin buffalo Figure 1-2 Chinese buffalo-Fuling buffalo河流型水牛則全身黑灰色,頭部較長(zhǎng),牛角向上彎曲成螺旋狀,前額稍微隆起,前胸寬闊,肌肉發(fā)達(dá),身軀較長(zhǎng),后肢發(fā)達(dá),尾巴較長(zhǎng),超過臀部。著名的品種有摩拉水牛和尼里拉菲水牛(圖 1-3,圖 1-4),二者都是優(yōu)良的乳用水牛品種,同時(shí)耐粗飼、抗病能力強(qiáng),都已被我國(guó)大量引入用于品種改良。
圖 1-1 中國(guó)水牛-西林水牛 圖 1-2 中國(guó)水牛-涪陵水牛Figure 1-1 Chinese buffalo- Xilin buffalo Figure 1-2 Chinese buffalo-Fuling buffalo河流型水牛則全身黑灰色,頭部較長(zhǎng),牛角向上彎曲成螺旋狀,前額稍微隆起,前胸寬闊,肌肉發(fā)達(dá),身軀較長(zhǎng),后肢發(fā)達(dá),尾巴較長(zhǎng),超過臀部。著名的品種有摩拉水牛和尼里拉菲水牛(圖 1-3,圖 1-4),二者都是優(yōu)良的乳用水牛品種,同時(shí)耐粗飼、抗病能力強(qiáng),都已被我國(guó)大量引入用于品種改良。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]沼澤型與河流型水牛Y染色體性別決定基因(SRY)編碼區(qū)序列的比較分析[J]. 霍金龍,苗永旺,李大林,袁峰,劉麗仙. 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2010(06)
[2]沼澤型水牛Y染微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選與多態(tài)性檢測(cè)[J]. 張曉明,樂祥鵬,張春梅,藍(lán)賢勇,陳宏,雷初朝. 遺傳. 2010(03)
[3]中國(guó)水牛mtDNA D-loop區(qū)遺傳多樣性與母系起源[J]. 謝文美,蘇銳,張曉明,張?jiān)粕?王小斌,雷初朝. 中國(guó)牛業(yè)科學(xué). 2009(05)
[4]海子水牛Cyt b基因序列分析[J]. 李世平,常洪,馬國(guó)龍,陳宏宇. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(30)
本文編號(hào):3433139
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