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水牛Y-SNPs篩選及多拷貝基因鑒定

發(fā)布時間:2021-10-12 19:06
  水牛既是我國南方水稻種植區(qū)的重要役畜,也是人們的重要食物來源。根據(jù)表型和習性可將家養(yǎng)水牛分為兩類:沼澤型水牛(2n=48)和河流型水牛(2n=50)。我國的地方水牛為沼澤型水牛。目前,對于水牛起源進化的研究在考古學、形態(tài)學與分子遺傳學方面均有涉及,大量線粒體DNA的研究雖能提供水牛母系起源的證據(jù),但仍需Y染色體分子遺傳多樣性方面的研究來提供水牛父系起源的遺傳學證據(jù)。本研究以14個中國地方水牛類群的229頭水牛為研究對象,以5頭河流型公水牛樣本為對照,利用已發(fā)表的水牛Y-SNP多態(tài)位點和GenBank上公布的家牛Y染色體序列信息,選擇位于MSY區(qū)的SRY、ZFY、USP9Y、DBY、UTY、OFD1Y、AMGY、AMELY、TSPY及RPS4Y1共10個基因,新設(shè)計50對水牛Y-SNP特異性引物,采用混合DNA池、PCR擴增產(chǎn)物直接測序等方法,篩選水牛Y-SNP多態(tài)標記;利用TA克隆及測序的方法對水牛Y染色體多拷貝基因進行鑒定,得到以下結(jié)果:1、水牛Y-SNPs篩選(1)通過對位于MSY區(qū)的10個基因(SRY、ZFY、USP9Y、DBY(DDX3Y)、UTY、OFD1Y、AMGY、AME... 

【文章來源】:西北農(nóng)林科技大學陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:56 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

水牛Y-SNPs篩選及多拷貝基因鑒定


中國水牛-西林水牛

中國水牛,水牛


圖 1-1 中國水牛-西林水牛 圖 1-2 中國水牛-涪陵水牛Figure 1-1 Chinese buffalo- Xilin buffalo Figure 1-2 Chinese buffalo-Fuling buffalo河流型水牛則全身黑灰色,頭部較長,牛角向上彎曲成螺旋狀,前額稍微隆起,前胸寬闊,肌肉發(fā)達,身軀較長,后肢發(fā)達,尾巴較長,超過臀部。著名的品種有摩拉水牛和尼里拉菲水牛(圖 1-3,圖 1-4),二者都是優(yōu)良的乳用水牛品種,同時耐粗飼、抗病能力強,都已被我國大量引入用于品種改良。

水牛,河流,中國水牛


圖 1-1 中國水牛-西林水牛 圖 1-2 中國水牛-涪陵水牛Figure 1-1 Chinese buffalo- Xilin buffalo Figure 1-2 Chinese buffalo-Fuling buffalo河流型水牛則全身黑灰色,頭部較長,牛角向上彎曲成螺旋狀,前額稍微隆起,前胸寬闊,肌肉發(fā)達,身軀較長,后肢發(fā)達,尾巴較長,超過臀部。著名的品種有摩拉水牛和尼里拉菲水牛(圖 1-3,圖 1-4),二者都是優(yōu)良的乳用水牛品種,同時耐粗飼、抗病能力強,都已被我國大量引入用于品種改良。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]沼澤型與河流型水牛Y染色體性別決定基因(SRY)編碼區(qū)序列的比較分析[J]. 霍金龍,苗永旺,李大林,袁峰,劉麗仙.  云南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2010(06)
[2]沼澤型水牛Y染微衛(wèi)星標記的篩選與多態(tài)性檢測[J]. 張曉明,樂祥鵬,張春梅,藍賢勇,陳宏,雷初朝.  遺傳. 2010(03)
[3]中國水牛mtDNA D-loop區(qū)遺傳多樣性與母系起源[J]. 謝文美,蘇銳,張曉明,張云生,王小斌,雷初朝.  中國牛業(yè)科學. 2009(05)
[4]海子水牛Cyt b基因序列分析[J]. 李世平,常洪,馬國龍,陳宏宇.  安徽農(nóng)業(yè)科學. 2007(30)



本文編號:3433139

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