一株廣西雞源H6亞型禽流感病毒全基因組序列分析及其重要生物學(xué)特性
發(fā)布時(shí)間:2021-10-09 23:17
2017年對(duì)廣西地區(qū)活禽交易市場(chǎng)進(jìn)行低致病性禽流感流行病學(xué)調(diào)查,從采集的雞咽喉和泄殖腔拭子中分離鑒定出一株雞源H6N6亞型禽流感病毒,命名為A/chicken/Guangxi/286C10/2017(H6N6)。應(yīng)用RT-PCR方法分別對(duì)分離毒株的8個(gè)基因片段進(jìn)行擴(kuò)增,同時(shí)將產(chǎn)物進(jìn)行克隆和測(cè)序,然后對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行同源性比對(duì)及遺傳進(jìn)化分析。另外,還通過固相受體結(jié)合試驗(yàn)對(duì)毒株的唾液酸受體進(jìn)行測(cè)定。結(jié)果顯示,該分離株的HA基因與廣東分離株A/chicken/Guangdong/G3249/2014(H6)的核苷酸同源性最高,裂解位點(diǎn)符合低致病性禽流感病毒的分子特征;NA基因與江西分離株A/duck/Ganzhou/GZ148/2016(H6N6)核苷酸同源性最高;內(nèi)部基因中,PB1和NS基因來源于廣東的雞,PB2基因來源于越南的雞,PA、NP和M基因來源于廣西的鵝;同時(shí),研究還發(fā)現(xiàn)該病毒的HA、NA、PA、NP和M基因來源H6亞型AIV,PB2、PB1和NS基因來源H9N2亞型AIV,推測(cè)A/chicken/Guangxi/286C10/2017(H6N6)可能是由不同地區(qū)、不同宿主來源的H...
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(23)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
A/chicken/Guangxi/286C10/2017(H6N6) HA基因遺傳進(jìn)化樹
AIV由于亞型眾多,極易發(fā)生變異和重組,研究表明部分亞型AIV能夠跨越種屬屏障感染直接感染哺乳動(dòng)物和人,不但給全球養(yǎng)禽業(yè)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,而且還會(huì)威脅到人類公共衛(wèi)生安全[18]。高致病性H5和H7亞型AIV及低致病性的H9亞型AIV分別因其對(duì)家禽的高致死率及在家禽中的廣泛流行而受到人們的普遍關(guān)注[19]。低致病性的H6亞型AIV雖然在自然界中普遍存在,但由于其一般不引起宿主產(chǎn)生明顯的臨床癥狀和死亡,因而一直沒有引起人們對(duì)它的重視。2014年5月在我國四川地區(qū)首次出現(xiàn)人感染H5N6亞型 AIV 病例,通過對(duì)毒株基因組分析發(fā)現(xiàn)該病毒的NA基因片段來自禽源H6N6亞型病毒[20]。另外,有報(bào)道利用血清學(xué)調(diào)查的方法在美國和中國的健康人群中發(fā)現(xiàn)了一定比例的H6亞型AIV抗體陽性人員[21]。因此,H6亞型AIV引起的公共衛(wèi)生安全問題已經(jīng)越來越引起人們的重視。廣西地處我國華南地區(qū),同時(shí)又處于全球8大候鳥遷徙路線之一的東亞和澳大利亞線路上,每年都有大量遷徙的候鳥途經(jīng)此地。此外,廣西是全國的養(yǎng)禽大省,與廣東等省份有著頻繁的活禽貿(mào)易往來,還與流感疫情復(fù)雜的越南相鄰,加上廣西地區(qū)人口稠密,活禽市場(chǎng)遍布城鄉(xiāng),水禽養(yǎng)殖規(guī)模大,且有放養(yǎng)畜禽的習(xí)慣,人與家禽、野鳥和候鳥的生活空間高度重疊,密切接觸,這些都為流感病毒變異株或新亞型AIV的產(chǎn)生創(chuàng)造了理想的條件,嚴(yán)重威脅畜牧業(yè)和公共衛(wèi)生的安全。當(dāng)不同亞型和不同宿主來源的AIV在感染同一宿主或細(xì)胞時(shí),病毒可以通過交換某些基因片段發(fā)生基因重排,進(jìn)而產(chǎn)生新的子代重配病毒,研究也表明自然界往往會(huì)發(fā)生多重AIV重組[22-23]。通過對(duì)雞源A/chicken/Guangxi/286C10/2017(H6N6) 病毒的全部基因組序列進(jìn)行分析以及與其他亞型病毒株的比較顯示,該研究中的病毒基因組的序列來源可能各不相同:HA、PB1和NS基因來源于廣東的雞,NA基因來源于江西的鴨,PB2基因來源于越南的雞,PA、NP和M基因來源于廣西的鵝;同時(shí)研究還發(fā)現(xiàn)該病毒的HA、NA、PA、NP和M基因來源H6亞型AIV,PB2、PB1和NS基因基因來源H9N2亞型AIV,推測(cè)A/chicken/Guangxi/286C10/2017(H6N6)可能是由不同地區(qū)不同宿主來源的H6和H9亞型 AIV通過基因重組產(chǎn)生的一株新的重配毒株,由此可見該病毒基因來源的復(fù)雜性。正是因?yàn)閺?fù)雜來源及重配導(dǎo)致目前AIV毒株的生物學(xué)特性也變得日益復(fù)雜化,同時(shí)也給AI 的科學(xué)綜合防控造成新的難題。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]H6N6亞型禽流感病毒進(jìn)化演變及跨種屬傳播研究進(jìn)展[J]. 王熹婧,朱銀川,龐夏鳳,張?jiān)龇? 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2019(06)
[2]2016~2017年防城港市活禽市場(chǎng)低致病性禽流感病毒監(jiān)測(cè)分析[J]. 熊文婕,謝芝勛,曹國敏,覃海,嚴(yán)小東,李孟,凌小英. 中國家禽. 2018(09)
[3]1株H6N6亞型禽流感病毒分子遺傳特性分析[J]. 祁思敏,宋勇春,崔侖標(biāo),焦永軍,祁賢. 微生物與感染. 2017(05)
[4]一株鴨源H6N6亞型禽流感病毒的基因組測(cè)序及遺傳進(jìn)化分析[J]. 葛志闖,孫文強(qiáng),劉東,徐利軍,諸彩蝶,范文青,顧敏,王曉泉,胡嬌,劉曉文,劉秀梵. 中國家禽. 2017(14)
[5]一株H6N6亞型野鳥禽流感病毒全基因組序列分析以及對(duì)小鼠的感染性研究[J]. 陳思,崔鵬飛,關(guān)立崢,谷文麗,施建忠,鄧國華,陳化蘭. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(06)
[6]H6N1亞型禽流感病毒跨種屬傳播研究進(jìn)展[J]. 孫增輝,朱銀川,王熹婧,蒙遠(yuǎn)雁,張?jiān)龇? 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2017(03)
[7]高致病性A(H5N6)亞型禽流感病毒全基因組序列測(cè)定方法的建立[J]. 李曉丹,張燁,鄒淑梅,薄洪,王大燕,舒躍龍. 病毒學(xué)報(bào). 2017(01)
[8]一株鴨源H6N6亞型禽流感病毒的遺傳進(jìn)化及致病性分析[J]. 陳佳琪,嵇辛勤,段志強(qiáng),阮涌,雷云,陳強(qiáng). 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(03)
[9]禽流感病毒跨種傳播的分子機(jī)制[J]. 張蔚,施一. 生命科學(xué). 2015(05)
[10]我國H9N2亞型禽流感病毒的流行和進(jìn)化特點(diǎn)[J]. 顧敏,彭大新,劉秀梵. 生命科學(xué). 2015(05)
博士論文
[1]低致病性禽流感病毒感染人的機(jī)制研究[D]. 王飛.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
碩士論文
[1]雞源禽流感病毒H6N6亞型對(duì)小鼠致病性以及在豬和人呼吸道組織復(fù)制的研究[D]. 王熹婧.廣西醫(yī)科大學(xué) 2019
[2]2株H5N6亞型禽流感病毒的序列分析和致病性研究[D]. 黎玉蓮.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3427176
【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(23)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
A/chicken/Guangxi/286C10/2017(H6N6) HA基因遺傳進(jìn)化樹
AIV由于亞型眾多,極易發(fā)生變異和重組,研究表明部分亞型AIV能夠跨越種屬屏障感染直接感染哺乳動(dòng)物和人,不但給全球養(yǎng)禽業(yè)造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,而且還會(huì)威脅到人類公共衛(wèi)生安全[18]。高致病性H5和H7亞型AIV及低致病性的H9亞型AIV分別因其對(duì)家禽的高致死率及在家禽中的廣泛流行而受到人們的普遍關(guān)注[19]。低致病性的H6亞型AIV雖然在自然界中普遍存在,但由于其一般不引起宿主產(chǎn)生明顯的臨床癥狀和死亡,因而一直沒有引起人們對(duì)它的重視。2014年5月在我國四川地區(qū)首次出現(xiàn)人感染H5N6亞型 AIV 病例,通過對(duì)毒株基因組分析發(fā)現(xiàn)該病毒的NA基因片段來自禽源H6N6亞型病毒[20]。另外,有報(bào)道利用血清學(xué)調(diào)查的方法在美國和中國的健康人群中發(fā)現(xiàn)了一定比例的H6亞型AIV抗體陽性人員[21]。因此,H6亞型AIV引起的公共衛(wèi)生安全問題已經(jīng)越來越引起人們的重視。廣西地處我國華南地區(qū),同時(shí)又處于全球8大候鳥遷徙路線之一的東亞和澳大利亞線路上,每年都有大量遷徙的候鳥途經(jīng)此地。此外,廣西是全國的養(yǎng)禽大省,與廣東等省份有著頻繁的活禽貿(mào)易往來,還與流感疫情復(fù)雜的越南相鄰,加上廣西地區(qū)人口稠密,活禽市場(chǎng)遍布城鄉(xiāng),水禽養(yǎng)殖規(guī)模大,且有放養(yǎng)畜禽的習(xí)慣,人與家禽、野鳥和候鳥的生活空間高度重疊,密切接觸,這些都為流感病毒變異株或新亞型AIV的產(chǎn)生創(chuàng)造了理想的條件,嚴(yán)重威脅畜牧業(yè)和公共衛(wèi)生的安全。當(dāng)不同亞型和不同宿主來源的AIV在感染同一宿主或細(xì)胞時(shí),病毒可以通過交換某些基因片段發(fā)生基因重排,進(jìn)而產(chǎn)生新的子代重配病毒,研究也表明自然界往往會(huì)發(fā)生多重AIV重組[22-23]。通過對(duì)雞源A/chicken/Guangxi/286C10/2017(H6N6) 病毒的全部基因組序列進(jìn)行分析以及與其他亞型病毒株的比較顯示,該研究中的病毒基因組的序列來源可能各不相同:HA、PB1和NS基因來源于廣東的雞,NA基因來源于江西的鴨,PB2基因來源于越南的雞,PA、NP和M基因來源于廣西的鵝;同時(shí)研究還發(fā)現(xiàn)該病毒的HA、NA、PA、NP和M基因來源H6亞型AIV,PB2、PB1和NS基因基因來源H9N2亞型AIV,推測(cè)A/chicken/Guangxi/286C10/2017(H6N6)可能是由不同地區(qū)不同宿主來源的H6和H9亞型 AIV通過基因重組產(chǎn)生的一株新的重配毒株,由此可見該病毒基因來源的復(fù)雜性。正是因?yàn)閺?fù)雜來源及重配導(dǎo)致目前AIV毒株的生物學(xué)特性也變得日益復(fù)雜化,同時(shí)也給AI 的科學(xué)綜合防控造成新的難題。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]H6N6亞型禽流感病毒進(jìn)化演變及跨種屬傳播研究進(jìn)展[J]. 王熹婧,朱銀川,龐夏鳳,張?jiān)龇? 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2019(06)
[2]2016~2017年防城港市活禽市場(chǎng)低致病性禽流感病毒監(jiān)測(cè)分析[J]. 熊文婕,謝芝勛,曹國敏,覃海,嚴(yán)小東,李孟,凌小英. 中國家禽. 2018(09)
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[4]一株鴨源H6N6亞型禽流感病毒的基因組測(cè)序及遺傳進(jìn)化分析[J]. 葛志闖,孫文強(qiáng),劉東,徐利軍,諸彩蝶,范文青,顧敏,王曉泉,胡嬌,劉曉文,劉秀梵. 中國家禽. 2017(14)
[5]一株H6N6亞型野鳥禽流感病毒全基因組序列分析以及對(duì)小鼠的感染性研究[J]. 陳思,崔鵬飛,關(guān)立崢,谷文麗,施建忠,鄧國華,陳化蘭. 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2017(06)
[6]H6N1亞型禽流感病毒跨種屬傳播研究進(jìn)展[J]. 孫增輝,朱銀川,王熹婧,蒙遠(yuǎn)雁,張?jiān)龇? 中國人獸共患病學(xué)報(bào). 2017(03)
[7]高致病性A(H5N6)亞型禽流感病毒全基因組序列測(cè)定方法的建立[J]. 李曉丹,張燁,鄒淑梅,薄洪,王大燕,舒躍龍. 病毒學(xué)報(bào). 2017(01)
[8]一株鴨源H6N6亞型禽流感病毒的遺傳進(jìn)化及致病性分析[J]. 陳佳琪,嵇辛勤,段志強(qiáng),阮涌,雷云,陳強(qiáng). 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(03)
[9]禽流感病毒跨種傳播的分子機(jī)制[J]. 張蔚,施一. 生命科學(xué). 2015(05)
[10]我國H9N2亞型禽流感病毒的流行和進(jìn)化特點(diǎn)[J]. 顧敏,彭大新,劉秀梵. 生命科學(xué). 2015(05)
博士論文
[1]低致病性禽流感病毒感染人的機(jī)制研究[D]. 王飛.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
碩士論文
[1]雞源禽流感病毒H6N6亞型對(duì)小鼠致病性以及在豬和人呼吸道組織復(fù)制的研究[D]. 王熹婧.廣西醫(yī)科大學(xué) 2019
[2]2株H5N6亞型禽流感病毒的序列分析和致病性研究[D]. 黎玉蓮.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
本文編號(hào):3427176
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