SH2B1和TBC1D1基因多態(tài)性與家兔生長性狀以及部分屠宰和肉質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析
發(fā)布時間:2021-10-08 01:53
SH2B1和TBC1D1是胰島素信號通路上具有生物學(xué)作用的信號因子,在胰島素信號通路調(diào)節(jié)葡萄糖攝取的過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用。本試驗(yàn)通過直接測序技術(shù)檢測SH2B1部分mRNA序列和TBC1D1基因編碼區(qū)序列的SNPs位點(diǎn),采用HRM技術(shù)、RFLP技術(shù)和生物質(zhì)譜技術(shù)對5個家兔品種共722個樣本的候選SNPs位點(diǎn)進(jìn)行基因分型;應(yīng)用最小二乘法對SH2B1和TBC1D1基因SNPs位點(diǎn)與家兔多個生產(chǎn)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析;采用實(shí)時熒光定量技術(shù)檢測35日齡,56日齡,70日齡肝臟組織中SH2B1基因mRNA相對表達(dá)量,分析不同發(fā)育階段以及不同基因型mRNA相對表達(dá)量的關(guān)聯(lián)性。試驗(yàn)結(jié)果如下:(1)SH2B1基因mRNA的3’UTR區(qū)檢測到2個SNPs位點(diǎn),分別為r.*464T>C和r.*749 G>A; TBC1D1基因檢測到12個SNPs位點(diǎn),其中7個同義突變SNPs位于TBC1D1的TBC結(jié)構(gòu)域(c.2451G>A, c.2514A>G, c.2535G>A, c.2589G>A, c.2763T>C, c.2844T>C, c.2937G>T),4個...
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 胰島素信號通路研究進(jìn)展
1.1.1 胰島素通路刺激的葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)
1.1.2 胰島素信號通路
1.2 SH2B1研究進(jìn)展
1.2.1 SH2B1基因結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能
1.2.2 SH2B1基因SNPs位點(diǎn)的相關(guān)研究進(jìn)展
1.3 TBC1D1研究進(jìn)展
1.3.1 TBC1D1基因結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能
1.3.2 TBC1D1基因SNPs位點(diǎn)的相關(guān)研究進(jìn)展
1.4 研究的意義及主要內(nèi)容
1.4.1 研究的意義
1.4.2 研究內(nèi)容
2 試驗(yàn)材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動物與樣本采集
2.1.2 屠宰指標(biāo)性狀測定
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.1.4 試驗(yàn)主要試劑及配置
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 全基因組DNA提取
2.2.2 全基因組DNA檢測
2.2.3 肝臟組織總RNA的提取
2.2.4 肝臟組織總RNA檢測
2.2.5 cDNA的合成
2.2.6 目的基因擴(kuò)增
2.2.7 SH2B1和TBC1D1基因SNPs位點(diǎn)分型
2.2.8 實(shí)時熒光定量PCR
2.2.9 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 SH2B1和TBC1D1基因SNPs篩選
3.1.1 全基因組DNA和肝臟組織總RNA提取結(jié)果
3.1.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.1.3 SNPs測序結(jié)果
3.1.4 SNP對應(yīng)蛋白質(zhì)位置預(yù)測分析
3.1.5 SNPs篩選
3.2 SH2B1和TBC1D1基因分型結(jié)果
3.2.1 SH2B1基因酶切結(jié)果
3.2.2 TBC1D1基因HRM分型結(jié)果
3.2.3 SH2B1基因和TBC1D1基因質(zhì)譜分型結(jié)果
3.3 SH2B1和TBC1D1基因遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
C位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果"> 3.3.1 SH2B1基因r.~*464 T>C位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
A位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果"> 3.3.2 TBC1D1基因c.214G>A位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
3.4 SH2B1和TBC1D1基因與家兔生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
C位點(diǎn)與家兔生長性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果"> 3.4.1 SH2B1基因r.~*464 T>C位點(diǎn)與家兔生長性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
C位點(diǎn)與家兔部分屠宰和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果"> 3.4.2 SH2B1基因r.~*464 T>C位點(diǎn)與家兔部分屠宰和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
A位點(diǎn)與家兔生長性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果"> 3.4.3 TBC1D1基因c.214G>A位點(diǎn)與家兔生長性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
A位點(diǎn)與伊拉兔生長性狀,部分屠宰和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分"> 3.4.4 TBC1D1基因c.214G>A位點(diǎn)與伊拉兔生長性狀,部分屠宰和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分
3.5 SH2B1基因mRNA相對表達(dá)量結(jié)果分析
3.5.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
3.5.2 實(shí)時熒光定量PCR表達(dá)結(jié)果
3.5.3 SH2B1基因mRNA在不同日齡的相對表達(dá)量
3.5.4 SH2B1基因mRNA不同基因型的相對表達(dá)量
4 討論
4.1 SH2B1和TBC1D1基因SNPs位點(diǎn)分析
4.2 HRM分型
4.3 SH2B1和TBC1D1基因與家兔生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.3.1 SH2B1基因與家兔生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.3.2 TBC1D1基因與家兔生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.4 SH2B1基因mRNA相對表達(dá)量分析
4.4.1 SH2B1基因mRNA在不同日齡相對表達(dá)量分析
4.4.2 SH2B1基因mRNA不同基因型相對表達(dá)量分析
5 結(jié)論
展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]胰島素信號傳導(dǎo)及其調(diào)節(jié)機(jī)制[J]. 唐偉,朱劍,武曉泓,劉超. 實(shí)用糖尿病雜志. 2005(03)
本文編號:3423199
【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 文獻(xiàn)綜述
1.1 胰島素信號通路研究進(jìn)展
1.1.1 胰島素通路刺激的葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)
1.1.2 胰島素信號通路
1.2 SH2B1研究進(jìn)展
1.2.1 SH2B1基因結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能
1.2.2 SH2B1基因SNPs位點(diǎn)的相關(guān)研究進(jìn)展
1.3 TBC1D1研究進(jìn)展
1.3.1 TBC1D1基因結(jié)構(gòu)及生物學(xué)功能
1.3.2 TBC1D1基因SNPs位點(diǎn)的相關(guān)研究進(jìn)展
1.4 研究的意義及主要內(nèi)容
1.4.1 研究的意義
1.4.2 研究內(nèi)容
2 試驗(yàn)材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動物與樣本采集
2.1.2 屠宰指標(biāo)性狀測定
2.1.3 主要儀器設(shè)備
2.1.4 試驗(yàn)主要試劑及配置
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 全基因組DNA提取
2.2.2 全基因組DNA檢測
2.2.3 肝臟組織總RNA的提取
2.2.4 肝臟組織總RNA檢測
2.2.5 cDNA的合成
2.2.6 目的基因擴(kuò)增
2.2.7 SH2B1和TBC1D1基因SNPs位點(diǎn)分型
2.2.8 實(shí)時熒光定量PCR
2.2.9 數(shù)據(jù)分析
3 結(jié)果與分析
3.1 SH2B1和TBC1D1基因SNPs篩選
3.1.1 全基因組DNA和肝臟組織總RNA提取結(jié)果
3.1.2 PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.1.3 SNPs測序結(jié)果
3.1.4 SNP對應(yīng)蛋白質(zhì)位置預(yù)測分析
3.1.5 SNPs篩選
3.2 SH2B1和TBC1D1基因分型結(jié)果
3.2.1 SH2B1基因酶切結(jié)果
3.2.2 TBC1D1基因HRM分型結(jié)果
3.2.3 SH2B1基因和TBC1D1基因質(zhì)譜分型結(jié)果
3.3 SH2B1和TBC1D1基因遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
C位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果"> 3.3.1 SH2B1基因r.~*464 T>C位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
A位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果"> 3.3.2 TBC1D1基因c.214G>A位點(diǎn)遺傳結(jié)構(gòu)分析結(jié)果
3.4 SH2B1和TBC1D1基因與家兔生產(chǎn)性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
C位點(diǎn)與家兔生長性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果"> 3.4.1 SH2B1基因r.~*464 T>C位點(diǎn)與家兔生長性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
C位點(diǎn)與家兔部分屠宰和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果"> 3.4.2 SH2B1基因r.~*464 T>C位點(diǎn)與家兔部分屠宰和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
A位點(diǎn)與家兔生長性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果"> 3.4.3 TBC1D1基因c.214G>A位點(diǎn)與家兔生長性狀關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
A位點(diǎn)與伊拉兔生長性狀,部分屠宰和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分"> 3.4.4 TBC1D1基因c.214G>A位點(diǎn)與伊拉兔生長性狀,部分屠宰和肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)分
3.5 SH2B1基因mRNA相對表達(dá)量結(jié)果分析
3.5.1 標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
3.5.2 實(shí)時熒光定量PCR表達(dá)結(jié)果
3.5.3 SH2B1基因mRNA在不同日齡的相對表達(dá)量
3.5.4 SH2B1基因mRNA不同基因型的相對表達(dá)量
4 討論
4.1 SH2B1和TBC1D1基因SNPs位點(diǎn)分析
4.2 HRM分型
4.3 SH2B1和TBC1D1基因與家兔生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.3.1 SH2B1基因與家兔生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.3.2 TBC1D1基因與家兔生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析
4.4 SH2B1基因mRNA相對表達(dá)量分析
4.4.1 SH2B1基因mRNA在不同日齡相對表達(dá)量分析
4.4.2 SH2B1基因mRNA不同基因型相對表達(dá)量分析
5 結(jié)論
展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]胰島素信號傳導(dǎo)及其調(diào)節(jié)機(jī)制[J]. 唐偉,朱劍,武曉泓,劉超. 實(shí)用糖尿病雜志. 2005(03)
本文編號:3423199
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