為了解布魯菌Rev.1疫苗株基因組的基本信息,本研究利用PacBio平臺對布魯菌Rev.1疫苗株進行測序分析,結(jié)果表明,其基因組全長約3,299,187bp,GC含量約57.23%,其中染色體1的基因組全長約2,121,370,GC含量約57.15%;染色體2的基因組全長約1,177,817,GC含量約57.34%。預(yù)測編碼基因個數(shù)為3,318個,總長度為2,857,932bp,平均長度861bp,GC含量約58.34%,占基因組全長的86.63%,共預(yù)測37個散在重復(fù)序列、89個串聯(lián)重復(fù)序列、71個小衛(wèi)星DNA、54個tRNA、9個rRNA、2個sRNA及10個基因島序列。布魯菌Rev.1疫苗株預(yù)測基因與各功能數(shù)據(jù)庫比對結(jié)果顯示,GO數(shù)據(jù)庫注釋基因數(shù)量為2,148個,KEGG數(shù)據(jù)庫3,253個,COG數(shù)據(jù)庫2,703個,NR數(shù)據(jù)庫3,274個,TCDB數(shù)據(jù)庫390個,PHI數(shù)據(jù)庫223個,VFDB數(shù)據(jù)庫228個,ARDB數(shù)據(jù)庫1個,CARD數(shù)據(jù)庫21個,共預(yù)測分泌蛋白158個,T3SS效應(yīng)蛋白78個。將布魯菌 Rev.1 疫苗株的 BLS、gmd、L7/L12、OMP25、OMP28... 

【文章來源】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)內(nèi)蒙古自治區(qū)

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２?Ｒｅｖ．?１疫苗株基因組測序讀長分布

圖３?Ｒｅｖ．?１疫苗株基因組測序質(zhì)量分布??

Rev.1痊苗株染色體，全基因組圖譜

【參考文獻】：
期刊論文
[1]2011—2017年天祝縣人間布魯氏菌病流行病學(xué)特征分析[J]. 許玲,滿世軍,李斌.  疾病預(yù)防控制通報. 2019(01)
[2]石家莊市鹿泉區(qū)2005-2016年人間布魯氏菌病疫情分析[J]. 武艷芬,張海紅,李衛(wèi)紅,張世勇.  醫(yī)學(xué)動物防制. 2019(05)
[3]布魯氏菌LS蛋白（BLS）研究進展[J]. 孫佳麗,彭小薇,孫石靜,袁維峰,丁家波.  微生物學(xué)通報. 2019(05)
[4]畢赤酵母糖基化對布魯菌P39抗原誘導(dǎo)巨噬細胞吞噬的影響[J]. 劉思陽,王巖,付玉芹,胡祥坤,王茗宇,盧天成,王秀然.  生物技術(shù)通報. 2018(09)
[5]羊種布魯氏菌疫苗株P(guān)CR-RFLP鑒定方法的建立[J]. 馬曉菁,鐘旗,葉鋒,谷文喜,劉麗婭,馬俊杰,薛晶,易新萍.  中國動物檢疫. 2018(07)
[6]家畜布魯氏菌疫苗的研究進展[J]. 李琳.  中國畜牧獸醫(yī)文摘. 2018(05)
[7]布魯氏菌GMD重組蛋白表達及對昆明系小鼠的免疫效果研究[J]. 徐錦鳳,王震,易德武,易繼海,馬旭升,姬祥,張輝,陳創(chuàng)夫.  新疆農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(12)
[8]晉北地區(qū)奶牛布氏桿菌病發(fā)病情況調(diào)查及防控建議[J]. 王樹華,韓一超,陳劍波.  山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(07)
[9]羊用布魯菌病疫苗研究進展[J]. 付湘云,馬小菁,易新萍,葉鋒,谷文喜,鐘旗.  動物醫(yī)學(xué)進展. 2015(05)
[10]59例慢性布魯氏菌病患者的中醫(yī)辨證論治效果觀察[J]. 陳利華.  醫(yī)學(xué)動物防制. 2014(10)

博士論文
[1]布魯氏菌S2疫苗株全基因組測序分析及診斷方法研究[D]. 紅梅.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016

碩士論文
[1]犬種布魯氏菌GB1株全基因組測序及其單克隆抗體制備和初步應(yīng)用[D]. 程汝佳.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]成都地區(qū)犬布氏桿菌病血清學(xué)調(diào)查及Real-time PCR檢測方法的研究[D]. 張沁涯.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]布魯氏菌A19疫苗株全基因組測序與比較基因組學(xué)分析[D]. 彭佳.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]布魯氏菌核糖體蛋白L7/L12與BLS蛋白的融合表達及免疫原性研究[D]. 吳亞坤.內(nèi)蒙古科技大學(xué) 2014
[5]布魯菌OMP28蛋白iELISA檢測方法的建立與試劑盒的研制[D]. 張小娟.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]布魯氏菌RB51全基因組序列的初步分析[D]. 馬臥龍.石河子大學(xué) 2014
[7]WboA基因在布魯菌S2株誘導(dǎo)機體免疫應(yīng)答中的作用[D]. 戎瑞雪.河北大學(xué) 2014
[8]奶牛布魯氏菌病流行病學(xué)調(diào)查及風(fēng)險評估模型構(gòu)建及應(yīng)用[D]. 王亭.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[9]人和動物布氏桿菌病疫情時空趨勢分析及其相關(guān)性研究[D]. 朱素萍.西北民族大學(xué) 2013
[10]犬布氏桿菌分離鑒定及omp25基因分析[D]. 狄棟棟.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011



本文編號：3419615