TYR、TYRP1基因與朝鮮鵪鶉羽色相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-09-15 12:36
朝鮮鵪鶉廣泛分布于中國(guó),并且具有復(fù)雜的羽色多樣性。羽色作為重要的遺傳標(biāo)記,在確定品種純度和系統(tǒng)發(fā)育中起著至關(guān)重要的作用。而酪氨酸酶(TYR)和酪氨酸酶相關(guān)蛋白1(TYRP1)在鳥類羽色的形成過程中起著關(guān)鍵作用。本研究以朝鮮鵪鶉(栗羽)及其突變系黑羽和白羽為研究對(duì)象,通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)、PCR-SSCP和真核表達(dá)等方法,主要探討了TYR、TYRP1基因與朝鮮鵪鶉羽色的相關(guān)性。研究結(jié)果如下:朝鮮鵪鶉TYR基因全長(zhǎng)編碼區(qū)編碼的蛋白由529個(gè)氨基酸殘基組成,該蛋白被稱為酪氨酸酶。它的分子量為60078.9Da,等電點(diǎn)為5.94。此外,帶負(fù)電荷殘基數(shù)為54,而帶正電荷殘基數(shù)為46。通過計(jì)算得到該蛋白的不穩(wěn)定系數(shù)為58.15,因此被歸類為不穩(wěn)定蛋白。另外,通過氨基酸序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)與朝鮮鵪鶉TYR氨基酸序列相似度從高到低依次為:禽類96%;哺乳類73.9%70.9%;兩棲類67.9%和魚類60.7%。朝鮮鵪鶉TYRP1基因編碼區(qū)編碼的蛋白由391個(gè)氨基酸殘基組成。它的分子量為44727.8Da,等電點(diǎn)為9.22。此外,帶負(fù)電荷殘基數(shù)為20,而帶正電荷殘基數(shù)為32。通過計(jì)...
【文章來源】:河南科技大學(xué)河南省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
符號(hào)表
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 鵪鶉羽色遺傳
1.1.1 種類及分布
1.1.2 形態(tài)特征
1.1.3 經(jīng)濟(jì)價(jià)值
1.1.4 羽色多樣性
1.2 鵪鶉羽色的形成機(jī)理
1.2.1 色素細(xì)胞的起源
1.2.2 色素細(xì)胞的種類
1.2.3 黑色素的種類
1.2.4 黑色素的理化性質(zhì)
1.2.5 黑色素的生物合成過程
1.3 鵪鶉羽色相關(guān)基因的研究進(jìn)展
1.3.1 TRP 基因家族
1.3.2 MC1R 基因
1.3.3 ASIP 基因
1.3.4 MITF 基因
1.3.5 EDNRB 基因
1.3.6 KIT 基因
1.3.7 SLC45A2 基因
1.4 相關(guān)試驗(yàn)技術(shù)
1.4.1 生物信息學(xué)分析
1.4.2 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR
1.4.3 PCR-SSCP
1.5 試驗(yàn)?zāi)康募耙饬x
第2章 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要試驗(yàn)試劑
2.1.3 主要試驗(yàn)設(shè)備
2.1.4 引物的設(shè)計(jì)與合成
2.1.5 分析軟件
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 主要試劑配制
2.2.2 朝鮮鵪鶉基因組 DNA 的提取
2.2.3 朝鮮鵪鶉總 RNA 的提取
2.2.4 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
2.2.5 朝鮮鵪鶉 TYR、TYRP1 基因的擴(kuò)增及測(cè)序
2.2.6 生物信息學(xué)分析
2.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量分析
2.2.8 PCR-SSCP 分析
2.2.9 真核表達(dá)研究
第3章 結(jié)果與分析
3.1 生物信息學(xué)分析
3.1.1 朝鮮鵪鶉 TYR 基因的生物信息學(xué)分析
3.1.2 朝鮮鵪鶉 TYRP1 基因的生物信息學(xué)分析
3.2 TYR、TYRP1 基因在三種羽色(黑羽、栗羽和白羽)朝鮮鵪鶉皮膚組織中的表達(dá)研究
3.3 朝鮮鵪鶉 TYR、TYRP1 基因多態(tài)性研究
3.3.1 朝鮮鵪鶉 TYR 基因多態(tài)性研究
3.3.2 朝鮮鵪鶉 TYRP1 基因多態(tài)性研究
3.4 朝鮮鵪鶉 TYR 基因真核表達(dá)研究
3.4.1 重組真核表達(dá)載體 pcDNA3.1(+)-TYR 的鑒定
3.4.2 朝鮮鵪鶉胚胎中 pcDNA3.1(+)-TYR 的表達(dá)
第4章 討論
4.1 生物信息學(xué)分析
4.1.1 TYR 基因生物信息學(xué)分析
4.1.2 TYRP1 基因生物信息學(xué)分析
4.2 相對(duì)表達(dá)量分析
4.2.1 TYR 基因相對(duì)表達(dá)量分析
4.2.2 TYRP1 基因相對(duì)表達(dá)量分析
4.3 多態(tài)性分析
4.3.1 TYR 基因多態(tài)性分析
4.3.2 TYRP1 基因多態(tài)性分析
4.4 真核表達(dá)分析
第5章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間的研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蛋用鵪鶉黑羽基因遺傳機(jī)制及其與栗羽基因的互作關(guān)系[J]. 龐有志,王麗莎,趙淑娟,張小輝,李小三,于美琴. 中國(guó)家禽. 2013(15)
[2]蒙古白馬KIT基因的多態(tài)性及組織表達(dá)研究[J]. 白東義,烏尼爾夫,楊麗華,張焱茹,黃金龍,高雅罕,烏日古木拉,芒來. 畜牧與獸醫(yī). 2013(01)
[3]朝鮮鵪鶉黑素皮質(zhì)素受體1基因多態(tài)性及其在不同羽色個(gè)體中的表達(dá)[J]. 許華偉,張小輝,龐有志,趙淑娟,楊又兵. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(09)
[4]鵪鶉的繁殖與各階段飼養(yǎng)管理技術(shù)[J]. 趙艷君,袁淑芹. 養(yǎng)殖技術(shù)顧問. 2012(06)
[5]MC1R基因與朝鮮鵪鶉羽色關(guān)系的研究[J]. 許華偉,張小輝,龐有志,趙淑娟,楊又兵. 中國(guó)家禽. 2012(08)
[6]Kit基因?qū)Π遵R被毛褪色的影響[J]. 白東義,楊麗華,烏尼爾夫,趙一萍,趙啟南,哈斯高娃,芒來. 遺傳. 2011(11)
[7]生物信息學(xué)在醫(yī)藥學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用[J]. 孫紅,殷作群,孫妍,丁瑜. 醫(yī)學(xué)信息(上旬刊). 2011(09)
[8]應(yīng)用SYBR GreenⅠ實(shí)時(shí)熒光PCR溶解曲線檢測(cè)鵪鶉源性成分[J]. 張慧霞,宗卉,吳建平,張利平. 中國(guó)畜牧雜志. 2010(17)
[9]黑素皮質(zhì)素受體1(MC1R)基因的研究進(jìn)展[J]. 于云柱,何奕多,劉麗,王秀娟,劉情,鄧衛(wèi)東. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2010(06)
[10]PCR-SSCP技術(shù)在基因多態(tài)分析中的應(yīng)用[J]. 湯賢春,路健,李學(xué)英. 中國(guó)西部科技. 2010(06)
碩士論文
[1]鵪鶉GH、GHR基因多態(tài)性與生產(chǎn)性能相關(guān)性研究[D]. 王慶.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]四種羽色蛋用鵪鶉微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[D]. 吳勝軍.河南科技大學(xué) 2010
[3]河北柴雞MC1R基因變異研究[D]. 郭秀麗.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[4]15種雉科鳥類尾羽分類特征的研究[D]. 黎紅輝.湖南師范大學(xué) 2008
本文編號(hào):3396090
【文章來源】:河南科技大學(xué)河南省
【文章頁數(shù)】:62 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
符號(hào)表
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 鵪鶉羽色遺傳
1.1.1 種類及分布
1.1.2 形態(tài)特征
1.1.3 經(jīng)濟(jì)價(jià)值
1.1.4 羽色多樣性
1.2 鵪鶉羽色的形成機(jī)理
1.2.1 色素細(xì)胞的起源
1.2.2 色素細(xì)胞的種類
1.2.3 黑色素的種類
1.2.4 黑色素的理化性質(zhì)
1.2.5 黑色素的生物合成過程
1.3 鵪鶉羽色相關(guān)基因的研究進(jìn)展
1.3.1 TRP 基因家族
1.3.2 MC1R 基因
1.3.3 ASIP 基因
1.3.4 MITF 基因
1.3.5 EDNRB 基因
1.3.6 KIT 基因
1.3.7 SLC45A2 基因
1.4 相關(guān)試驗(yàn)技術(shù)
1.4.1 生物信息學(xué)分析
1.4.2 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR
1.4.3 PCR-SSCP
1.5 試驗(yàn)?zāi)康募耙饬x
第2章 材料與方法
2.1 試驗(yàn)材料
2.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
2.1.2 主要試驗(yàn)試劑
2.1.3 主要試驗(yàn)設(shè)備
2.1.4 引物的設(shè)計(jì)與合成
2.1.5 分析軟件
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 主要試劑配制
2.2.2 朝鮮鵪鶉基因組 DNA 的提取
2.2.3 朝鮮鵪鶉總 RNA 的提取
2.2.4 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
2.2.5 朝鮮鵪鶉 TYR、TYRP1 基因的擴(kuò)增及測(cè)序
2.2.6 生物信息學(xué)分析
2.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量分析
2.2.8 PCR-SSCP 分析
2.2.9 真核表達(dá)研究
第3章 結(jié)果與分析
3.1 生物信息學(xué)分析
3.1.1 朝鮮鵪鶉 TYR 基因的生物信息學(xué)分析
3.1.2 朝鮮鵪鶉 TYRP1 基因的生物信息學(xué)分析
3.2 TYR、TYRP1 基因在三種羽色(黑羽、栗羽和白羽)朝鮮鵪鶉皮膚組織中的表達(dá)研究
3.3 朝鮮鵪鶉 TYR、TYRP1 基因多態(tài)性研究
3.3.1 朝鮮鵪鶉 TYR 基因多態(tài)性研究
3.3.2 朝鮮鵪鶉 TYRP1 基因多態(tài)性研究
3.4 朝鮮鵪鶉 TYR 基因真核表達(dá)研究
3.4.1 重組真核表達(dá)載體 pcDNA3.1(+)-TYR 的鑒定
3.4.2 朝鮮鵪鶉胚胎中 pcDNA3.1(+)-TYR 的表達(dá)
第4章 討論
4.1 生物信息學(xué)分析
4.1.1 TYR 基因生物信息學(xué)分析
4.1.2 TYRP1 基因生物信息學(xué)分析
4.2 相對(duì)表達(dá)量分析
4.2.1 TYR 基因相對(duì)表達(dá)量分析
4.2.2 TYRP1 基因相對(duì)表達(dá)量分析
4.3 多態(tài)性分析
4.3.1 TYR 基因多態(tài)性分析
4.3.2 TYRP1 基因多態(tài)性分析
4.4 真核表達(dá)分析
第5章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間的研究成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蛋用鵪鶉黑羽基因遺傳機(jī)制及其與栗羽基因的互作關(guān)系[J]. 龐有志,王麗莎,趙淑娟,張小輝,李小三,于美琴. 中國(guó)家禽. 2013(15)
[2]蒙古白馬KIT基因的多態(tài)性及組織表達(dá)研究[J]. 白東義,烏尼爾夫,楊麗華,張焱茹,黃金龍,高雅罕,烏日古木拉,芒來. 畜牧與獸醫(yī). 2013(01)
[3]朝鮮鵪鶉黑素皮質(zhì)素受體1基因多態(tài)性及其在不同羽色個(gè)體中的表達(dá)[J]. 許華偉,張小輝,龐有志,趙淑娟,楊又兵. 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(09)
[4]鵪鶉的繁殖與各階段飼養(yǎng)管理技術(shù)[J]. 趙艷君,袁淑芹. 養(yǎng)殖技術(shù)顧問. 2012(06)
[5]MC1R基因與朝鮮鵪鶉羽色關(guān)系的研究[J]. 許華偉,張小輝,龐有志,趙淑娟,楊又兵. 中國(guó)家禽. 2012(08)
[6]Kit基因?qū)Π遵R被毛褪色的影響[J]. 白東義,楊麗華,烏尼爾夫,趙一萍,趙啟南,哈斯高娃,芒來. 遺傳. 2011(11)
[7]生物信息學(xué)在醫(yī)藥學(xué)領(lǐng)域中的應(yīng)用[J]. 孫紅,殷作群,孫妍,丁瑜. 醫(yī)學(xué)信息(上旬刊). 2011(09)
[8]應(yīng)用SYBR GreenⅠ實(shí)時(shí)熒光PCR溶解曲線檢測(cè)鵪鶉源性成分[J]. 張慧霞,宗卉,吳建平,張利平. 中國(guó)畜牧雜志. 2010(17)
[9]黑素皮質(zhì)素受體1(MC1R)基因的研究進(jìn)展[J]. 于云柱,何奕多,劉麗,王秀娟,劉情,鄧衛(wèi)東. 中國(guó)畜牧獸醫(yī). 2010(06)
[10]PCR-SSCP技術(shù)在基因多態(tài)分析中的應(yīng)用[J]. 湯賢春,路健,李學(xué)英. 中國(guó)西部科技. 2010(06)
碩士論文
[1]鵪鶉GH、GHR基因多態(tài)性與生產(chǎn)性能相關(guān)性研究[D]. 王慶.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[2]四種羽色蛋用鵪鶉微衛(wèi)星遺傳多樣性分析[D]. 吳勝軍.河南科技大學(xué) 2010
[3]河北柴雞MC1R基因變異研究[D]. 郭秀麗.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[4]15種雉科鳥類尾羽分類特征的研究[D]. 黎紅輝.湖南師范大學(xué) 2008
本文編號(hào):3396090
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