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基于狂犬病病毒Leader序列熒光定量RT-PCR及其應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2021-09-09 10:35
  狂犬病是由狂犬病病毒(rabies virus, RABV)引起的一種古老的人獸共患病,以腦脊髓炎、狂躁不安及進(jìn)行性麻痹為主要特征,該病病死率為100%。近年來(lái)我國(guó)平均每年因狂犬病而死亡的人數(shù)約有2,000人,其中大多數(shù)是由犬、貓或野生動(dòng)物咬傷所致。動(dòng)物狂犬病的及時(shí)正確診斷對(duì)于疑似患者的暴露后治療及指導(dǎo)動(dòng)物狂犬病預(yù)防和控制具有重要意義。目前,用于動(dòng)物狂犬病診斷方法有多種,主要包括病毒直接觀察、病毒分離培養(yǎng)、病毒蛋白檢測(cè)及病毒基因檢測(cè)。病毒直接觀察能夠直接觀察到病毒真實(shí)形態(tài),但是需要在配備電鏡的專(zhuān)業(yè)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行觀察;病毒的分離培養(yǎng)可獲得病毒,但是需要考慮生物安全及病毒對(duì)細(xì)胞和動(dòng)物的適應(yīng)性差異;病毒蛋白檢測(cè)是WHO和OIE共同推薦的最廣泛應(yīng)用的金標(biāo)準(zhǔn)診斷方法,但是需要標(biāo)準(zhǔn)化熒光標(biāo)記抗體、熒光顯微鏡與經(jīng)過(guò)培訓(xùn)的操作人員,整個(gè)過(guò)程繁瑣且檢測(cè)敏感性低。傳統(tǒng)的狂犬病病毒基因檢測(cè)診斷方法包括普通RT-PCR和巢氏RT-PCR,但或敏感性差或耗時(shí)較長(zhǎng)且需接觸致癌染料。熒光定量RT-PCR作為新興的狂犬病病毒基因診斷方法由于其敏感、快速、結(jié)果直觀的特性受到廣泛應(yīng)用。國(guó)內(nèi)外已報(bào)道多種狂犬病病毒熒光定量RT-... 

【文章來(lái)源】:中國(guó)人民解放軍軍事科學(xué)院北京市

【文章頁(yè)數(shù)】:56 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于狂犬病病毒Leader序列熒光定量RT-PCR及其應(yīng)用


狂犬病病毒BD06株N基因擴(kuò)增Fig.1-1AmplificationofNgeneofRABVBD06

測(cè)序,狂犬病病毒,樣品,質(zhì)?截悢(shù)


圖 1-2 測(cè)序結(jié)果的 BLAST 比較Fig. BLAST Comparison of sequencing2.1.3 測(cè)得預(yù)稀釋過(guò)的重組質(zhì)粒 pMD18T-BD06-N 濃度為 3.17 ng / μL,計(jì)算得出10-1、10-2、10-3、10-4、10-5與 10-6稀釋梯度質(zhì)?截悢(shù)依次約為 1.3×108、1.3×107、1.3×106、1.3×105、1.3×104與 1.3×103。2.2 特異性試驗(yàn)對(duì) 16 份非狂犬病病毒樣品進(jìn)行熒光定量 RT-PCR,結(jié)果表明:所有樣品 Ct值均小于 NTC Ct 值,且陽(yáng)性對(duì)照最高峰 Tm 高于 80℃時(shí),陰性對(duì)照、陰性樣品(非狂犬病病毒樣品)及 NTC 的最高峰 Tm 值均低于 80℃。

熔解曲線,狂犬病病毒,樣品,質(zhì)?截悢(shù)


圖 1-2 測(cè)序結(jié)果的 BLAST 比較Fig. BLAST Comparison of sequencing2.1.3 測(cè)得預(yù)稀釋過(guò)的重組質(zhì)粒 pMD18T-BD06-N 濃度為 3.17 ng / μL,計(jì)算得出10-1、10-2、10-3、10-4、10-5與 10-6稀釋梯度質(zhì)?截悢(shù)依次約為 1.3×108、1.3×107、1.3×106、1.3×105、1.3×104與 1.3×103。2.2 特異性試驗(yàn)對(duì) 16 份非狂犬病病毒樣品進(jìn)行熒光定量 RT-PCR,結(jié)果表明:所有樣品 Ct值均小于 NTC Ct 值,且陽(yáng)性對(duì)照最高峰 Tm 高于 80℃時(shí),陰性對(duì)照、陰性樣品(非狂犬病病毒樣品)及 NTC 的最高峰 Tm 值均低于 80℃。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Epidemic and Maintenance of Rabies in Chinese Ferret Badgers (Melogale moschata) indicated by Epidemiology and the Molecular Signatures of Rabies Viruses[J]. Shoufeng Zhang,Ye Liu,Yanli Hou,Jinghui Zhao,Fei Zhang,Ying Wang,Rongliang Hu.  Virologica Sinica. 2013(03)
[2]江西省黃鼬和鼬獾狂犬病流行病學(xué)監(jiān)測(cè)[J]. 趙敬慧,張守峰,劉曄,陳奇,苗富春,王林棟,李易潞,扈榮良.  中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2012(11)
[3]狂犬病病毒SYBR-GreenⅠ實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 陸專(zhuān)靈,何曉霞,謝琳娟,梁湘,唐海波,羅揚(yáng),羅廷榮.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2012(05)
[4]狂犬病病毒熒光定量RT-PCR快速檢測(cè)試劑盒的評(píng)價(jià)及應(yīng)用[J]. 許運(yùn)斌,孫彥偉,邵明富,查云峰,范金紅,席進(jìn),朱妍,涂長(zhǎng)春.  中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2012(03)
[5]基因1型狂犬病病毒一步法熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 許運(yùn)斌,邵明富,范金紅,孫彥偉,席進(jìn),涂長(zhǎng)春.  中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào). 2011(04)
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本文編號(hào):3391940

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