豬流行性腹瀉病毒TaqMan熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立及其初步應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-09-04 09:40
豬流行性腹瀉(PED)是由豬流行性腹瀉病毒(PEDV)引起豬的一種急性腸道傳染病,主要導(dǎo)致感染豬的腹瀉、嘔吐及脫水癥狀,對(duì)哺乳仔豬有很高的致死率,給世界養(yǎng)豬業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)有的比較常用的PEDV診斷方法有免疫熒光、ELISA、免疫組化、RT-PCR等,但是這些方法操作費(fèi)時(shí)且特異性、靈敏度不高,而且不能對(duì)疾病作出早期診斷,而熒光定量PCR則能夠彌補(bǔ)這些缺陷,且可進(jìn)行高通量檢測(cè)。PEDV是有囊膜的單股正鏈RNA病毒,其基因組中的M基因特別保守,通常被用來(lái)作為檢測(cè)方法的靶基因。我們參考GenBank中已經(jīng)公布的PEDV CV777株,設(shè)計(jì)出擴(kuò)增M基因全長(zhǎng)的特異性引物,另外設(shè)計(jì)一對(duì)特異性引物及TaqMan探針,擴(kuò)增長(zhǎng)度為196bp的片段。利用RT-PCR技術(shù),從陽(yáng)性病料中擴(kuò)增出681bp的M基因,序列比對(duì)結(jié)果表明,M基因序列與CV777株相應(yīng)M序列的同源性高達(dá)98%,并且與已經(jīng)發(fā)布的其它PEDV毒株的M基因序列相比,同源性也均在97%以上。我們將M基因克隆進(jìn)pMD18-T載體中,將鑒定正確的重組質(zhì)粒進(jìn)行10倍梯度系列稀釋以作為陽(yáng)性標(biāo)準(zhǔn)品,從而建立了一種快速檢測(cè)PEDV含量的Taq...
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:52 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
第一章 前言
1.1 PEDV病原結(jié)構(gòu)
1.2 PEDV基因組結(jié)構(gòu)
1.3 PED流行病學(xué)
1.4 PED臨床癥狀
1.5 PED病理變化
1.6 PED致病機(jī)理
1.7 PED診斷方法
1.8 研究目的與意義
第二章 豬流行性腹瀉病毒TaqMan熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 病毒、質(zhì)粒與菌株
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)器材
2.1.3 主要試劑和藥品
2.1.4 主要培養(yǎng)基和緩沖液的配制
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 熒光定量引物與探針的設(shè)計(jì)
2.2.2 核酸的提取
2.2.3 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的制備
2.2.4 熒光定量RT-PCR反應(yīng)體系及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
2.2.5 特異性實(shí)驗(yàn)
2.2.6 敏感性實(shí)驗(yàn)
2.2.7 重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
2.2.8 臨床樣本的檢測(cè)
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 PEDV M片段的擴(kuò)增及重組質(zhì)粒的鑒定
2.3.2 熒光定量RT-PCR反應(yīng)體系及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
2.3.3 特異性實(shí)驗(yàn)
2.3.4 敏感性實(shí)驗(yàn)
2.3.5 重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
2.3.6 臨床樣本的檢測(cè)
2.4 討論
第三章 PEDV變異株致病性的初步研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 病毒、抗體與實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 主要實(shí)驗(yàn)器材
3.1.3 主要試劑和藥品
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 攻毒病料的處理及熒光定量RT-PCR檢測(cè)
3.2.2 攻毒實(shí)驗(yàn)
3.2.3 熒光定量RT-PCR檢測(cè)糞便及組織
3.2.4 組織切片的制作
3.2.5 HE染色
3.2.6 免疫組化
3.3 結(jié)果及分析
3.3.1 攻毒病料的熒光定量RT-PCR檢測(cè)結(jié)果
3.3.2 臨床癥狀及病理變化
3.3.3 糞便的排毒規(guī)律
3.3.4 病理組織學(xué)檢測(cè)結(jié)果
3.3.5 免疫組化檢測(cè)結(jié)果
3.4 討論
第四章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬病毒性腹瀉的流行病學(xué)調(diào)查及分析[J]. 庫(kù)旭鋼,劉云波,凌澤熹,趙洪翠,廖榮斌,張坤,肖文,何啟蓋. 養(yǎng)豬. 2012(05)
[2]豬流行性腹瀉病毒(PEDV)與抗病毒天然免疫[J]. 張百靈,陳建飛,邢雅玲,馮力,陳忠斌. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2011(06)
[3]豬流行性腹瀉病毒核衣殼蛋白與感染細(xì)胞核磷蛋白的共定位分析[J]. 呂茂杰,陳建飛,時(shí)洪艷,陳小金,范秀萍,申識(shí)川,馮力. 微生物學(xué)報(bào). 2011(05)
[4]SYBR Green Ⅰ實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)豬流行性腹瀉病毒方法的建立及應(yīng)用[J]. 王金良,郭顯坡,魏鳳,沈志強(qiáng). 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(10)
[5]豬流行性腹瀉病毒、豬傳染性胃腸炎病毒和豬A群輪狀病毒多重RT-PCR檢測(cè)方法的建立及臨床應(yīng)用[J]. 張坤,何啟蓋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(08)
[6]TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)豬流行性腹瀉病毒方法的建立與初步應(yīng)用[J]. 劉鄧,袁秀芳,冉多良,徐麗華,牛登元,王朝文,王一成. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2010(01)
[7]豬流行性腹瀉病毒N蛋白的真核表達(dá)及其亞細(xì)胞定位的初步分析[J]. 呂茂杰,馮力,時(shí)洪艷,陳建飛,孫東波,申識(shí)川,崔小辰,王承寶,范秀萍. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(05)
[8]豬流行性腹瀉研究概況[J]. 鄔良賢,丘建華. 福建畜牧獸醫(yī). 2000(05)
[9]豬流行性腹瀉微量血清中和試驗(yàn)的建立和應(yīng)用[J]. 林志雄,季樹(shù)根,李力復(fù),陳茹,童昆周. 中國(guó)獸醫(yī)科技. 1994(11)
[10]豬傳染性胃腸炎和豬流行性腹瀉病毒的免疫電鏡診斷的研究[J]. 王繼科,劉長(zhǎng)明,馬思奇,王明,魏鳳祥,于文濤,周金法. 中國(guó)畜禽傳染病. 1991(02)
本文編號(hào):3383030
【文章來(lái)源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:52 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略語(yǔ)表
第一章 前言
1.1 PEDV病原結(jié)構(gòu)
1.2 PEDV基因組結(jié)構(gòu)
1.3 PED流行病學(xué)
1.4 PED臨床癥狀
1.5 PED病理變化
1.6 PED致病機(jī)理
1.7 PED診斷方法
1.8 研究目的與意義
第二章 豬流行性腹瀉病毒TaqMan熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的建立
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 病毒、質(zhì)粒與菌株
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)器材
2.1.3 主要試劑和藥品
2.1.4 主要培養(yǎng)基和緩沖液的配制
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 熒光定量引物與探針的設(shè)計(jì)
2.2.2 核酸的提取
2.2.3 標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的制備
2.2.4 熒光定量RT-PCR反應(yīng)體系及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
2.2.5 特異性實(shí)驗(yàn)
2.2.6 敏感性實(shí)驗(yàn)
2.2.7 重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
2.2.8 臨床樣本的檢測(cè)
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 PEDV M片段的擴(kuò)增及重組質(zhì)粒的鑒定
2.3.2 熒光定量RT-PCR反應(yīng)體系及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
2.3.3 特異性實(shí)驗(yàn)
2.3.4 敏感性實(shí)驗(yàn)
2.3.5 重復(fù)性實(shí)驗(yàn)
2.3.6 臨床樣本的檢測(cè)
2.4 討論
第三章 PEDV變異株致病性的初步研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 病毒、抗體與實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 主要實(shí)驗(yàn)器材
3.1.3 主要試劑和藥品
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 攻毒病料的處理及熒光定量RT-PCR檢測(cè)
3.2.2 攻毒實(shí)驗(yàn)
3.2.3 熒光定量RT-PCR檢測(cè)糞便及組織
3.2.4 組織切片的制作
3.2.5 HE染色
3.2.6 免疫組化
3.3 結(jié)果及分析
3.3.1 攻毒病料的熒光定量RT-PCR檢測(cè)結(jié)果
3.3.2 臨床癥狀及病理變化
3.3.3 糞便的排毒規(guī)律
3.3.4 病理組織學(xué)檢測(cè)結(jié)果
3.3.5 免疫組化檢測(cè)結(jié)果
3.4 討論
第四章 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]豬病毒性腹瀉的流行病學(xué)調(diào)查及分析[J]. 庫(kù)旭鋼,劉云波,凌澤熹,趙洪翠,廖榮斌,張坤,肖文,何啟蓋. 養(yǎng)豬. 2012(05)
[2]豬流行性腹瀉病毒(PEDV)與抗病毒天然免疫[J]. 張百靈,陳建飛,邢雅玲,馮力,陳忠斌. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2011(06)
[3]豬流行性腹瀉病毒核衣殼蛋白與感染細(xì)胞核磷蛋白的共定位分析[J]. 呂茂杰,陳建飛,時(shí)洪艷,陳小金,范秀萍,申識(shí)川,馮力. 微生物學(xué)報(bào). 2011(05)
[4]SYBR Green Ⅰ實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)豬流行性腹瀉病毒方法的建立及應(yīng)用[J]. 王金良,郭顯坡,魏鳳,沈志強(qiáng). 中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(10)
[5]豬流行性腹瀉病毒、豬傳染性胃腸炎病毒和豬A群輪狀病毒多重RT-PCR檢測(cè)方法的建立及臨床應(yīng)用[J]. 張坤,何啟蓋. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2010(08)
[6]TaqMan熒光定量PCR檢測(cè)豬流行性腹瀉病毒方法的建立與初步應(yīng)用[J]. 劉鄧,袁秀芳,冉多良,徐麗華,牛登元,王朝文,王一成. 中國(guó)動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2010(01)
[7]豬流行性腹瀉病毒N蛋白的真核表達(dá)及其亞細(xì)胞定位的初步分析[J]. 呂茂杰,馮力,時(shí)洪艷,陳建飛,孫東波,申識(shí)川,崔小辰,王承寶,范秀萍. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2009(05)
[8]豬流行性腹瀉研究概況[J]. 鄔良賢,丘建華. 福建畜牧獸醫(yī). 2000(05)
[9]豬流行性腹瀉微量血清中和試驗(yàn)的建立和應(yīng)用[J]. 林志雄,季樹(shù)根,李力復(fù),陳茹,童昆周. 中國(guó)獸醫(yī)科技. 1994(11)
[10]豬傳染性胃腸炎和豬流行性腹瀉病毒的免疫電鏡診斷的研究[J]. 王繼科,劉長(zhǎng)明,馬思奇,王明,魏鳳祥,于文濤,周金法. 中國(guó)畜禽傳染病. 1991(02)
本文編號(hào):3383030
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