為調(diào)查2018年大慶市某規(guī)�；i場豬流行性腹瀉病毒（PEDV）的感染及遺傳變異情況,應(yīng)用RT-PCR方法,對該規(guī)�；i場的兩個分場的仔豬腹瀉樣品進(jìn)行PEDV S1基因擴(kuò)增、測序及遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果表明兩個分場均存在PEDV感染;序列分析顯示,兩個分場PEDV S1基因序列核苷酸同源性為98.3%,推導(dǎo)氨基酸同源性為97.7%,與我國HGC-01-2015野毒株核苷酸同源性最高為99.0%,與2014年日本流行毒株ZK-O型毒株核苷酸同源性最低為84.9%。PEDV S1基因系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示,實(shí)驗(yàn)鑒定毒株均屬于GⅡb亞群,與近年國內(nèi)流行毒株及黑龍江省地區(qū)的流行毒株親緣關(guān)系較近,與早期經(jīng)典毒株CV777型毒株及國外流行毒株親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。 

【文章來源】：黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報. 2020,32(06)

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

PEDV S1基因PCR鑒定圖

對挑取的單菌落進(jìn)行菌落PCR鑒定，瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示，擴(kuò)增目的片段與預(yù)期的大小相符，獲得陽性菌落，如圖3所示。2.4 PEDV S1基因序列同源性分析

研究成功獲得了2株P(guān)EDV S1基因序列，將成功克隆并測序的基因序列遞交NCBI的Gen Bank數(shù)據(jù)庫，獲得Gen Bank編號為MK395356和MK395357，同源性分析顯示鑒定毒株S1基因的核苷酸同源性為98.3%，推導(dǎo)的氨基酸同源性為97.7%，與經(jīng)典毒株CV777相比，核苷酸序列同源性為91.4%～91.6%，推導(dǎo)的氨基酸同源性為89.8%～89.9%。分析顯示實(shí)驗(yàn)鑒定毒株S1基因與我國國內(nèi)流行HGC-01-2015毒株、HLJ-QTH-2018毒株同源性較高，與早期經(jīng)典毒株CV777、LZC毒株、ZK-O毒株同源性較低。PEDV S1基因序列比對分析見表8。2.5 PEDV S1基因遺傳進(jìn)化性分析

【參考文獻(xiàn)】：
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博士論文
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碩士論文
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本文編號：3378570