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家兔POMC和UCP2基因?qū)ιL性狀、屠體性狀和部分肉質(zhì)性狀的遺傳效應研究

發(fā)布時間:2021-08-31 16:28
  家兔的體重和生長速度取決于采食和能量消耗之間的平衡,同時,出欄體重與生長速度對胴體質(zhì)量和兔肉品質(zhì)具有顯著影響,因此,涉及采食和能量消耗兩大生理生化過程的基因有可能與家兔生長性狀、屠體性狀和肉質(zhì)性狀相關聯(lián)。減食欲神經(jīng)肽阿黑皮素原基因(Pro-opiomelanocortin,POMC)和解偶聯(lián)蛋白2基因(uncoupling protein 2,UCP2)分別涉及采食和能量消耗兩大過程。本試驗以伊拉兔、香檳兔、天府黑兔、新西蘭兔和歐洲大白兔共計797個樣本為材料(其中,伊拉兔、香檳兔和天府黑兔測定生長性狀、屠體性狀和肉質(zhì)性狀,新西蘭兔和歐洲大白兔只測定生長性狀),以POMC和UCP2為候選基因,采用直接測序法尋找兩個基因編碼區(qū)的遺傳變異,研究候選SNPs與家兔部分生產(chǎn)性狀的關聯(lián)性,并對UCP2基因mRNA相對表達量進行了分析,研究結(jié)果如下:1.在POMC基因外顯子2上檢測到一個同義突變c.498 T>G,在內(nèi)含子1上檢測到一個突變位點c.112-12 G>T。多態(tài)性分析表明,c.498 T>G在伊拉兔、香檳兔和天府黑兔三個品種中均只檢測到GT和GG兩種基因型,且表現(xiàn)為低... 

【文章來源】:四川農(nóng)業(yè)大學四川省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
1. 文獻綜述
    1.1 概述
    1.2 應用候選基因法尋找分子遺傳標記
        1.2.1 候選基因法
        1.2.2 候選基因的選擇
    1.3 阿黑皮素原(Pro-opiomelanocortin,POMC)
        1.3.1 POMC調(diào)節(jié)食欲的作用機制
        1.3.2 POMC基因的定位、結(jié)構(gòu)及蛋白質(zhì)翻譯加工過程
        1.3.3 POMC基因多態(tài)性研究進展
    1.4 解偶聯(lián)蛋白(uncoupling proteins,UCPs)
        1.4.1 UCP2蛋白及其介導質(zhì)子漏的機制
        1.4.2 UCP2基因的結(jié)構(gòu)及分布
        1.4.3 UCP2基因多態(tài)性研究進展
    1.5 質(zhì)譜(mass spectrometry,MS)技術在基因分型中的應用
    1.6 研究目的及試驗方案
        1.6.1 研究目的
        1.6.2 試驗方案
2. 試驗材料和方法
    2.1 試驗材料
        2.1.1 試驗動物
        2.1.2 樣品采集
    2.2 主要儀器設備和試劑
        2.2.1 主要儀器設備
        2.2.2 主要試劑及試劑盒
        2.2.3 主要試劑的配制
    2.3 試驗方法
        2.3.1 生產(chǎn)性能測定
        2.3.2 基因組DNA的提取及檢測
        2.3.3 引物的設計與合成
        2.3.4 DNA水平上SNPs位點的檢測
        2.3.5 對候選SNPs位點進行基因分型
        2.3.6 組織總RNA的提取
        2.3.7 cDNA的合成
        2.3.8 mRNA相對表達量研究
    2.4 數(shù)據(jù)分析
        2.4.1 主要分子生物學軟件
        2.4.2 數(shù)據(jù)處理
3. 結(jié)果與分析
    3.1 基因組DNA與肝臟組織總RNA抽提結(jié)果
    3.2 POMC基因?qū)彝蒙a(chǎn)性狀的遺傳效應分析
        3.2.1 POMC基因變異位點的檢測
        3.2.2 POMC基因變異位點的遺傳多態(tài)性
        3.2.3 POMC基因多態(tài)性對家兔生產(chǎn)性狀的遺傳效應
    3.3 UCP2基因?qū)彝蒙a(chǎn)性狀的遺傳效應分析
        3.3.1 UCP2基因變異位點的檢測結(jié)果
        3.3.2 候選SNP位點的分析篩選
A位點遺傳多態(tài)性">        3.3.3 UCP2基因c.72 G>A位點遺傳多態(tài)性
        3.3.4 UCP2基因多態(tài)性對生產(chǎn)性狀的遺傳效應
    3.4 UCP2基因mRNA相對表達量分析
        3.4.1 標準曲線的繪制
        3.4.2 UCP2基因在不同生長階段的mRNA表達差異
        3.4.3 UCP2基因不同基因型的mRNA相對表達量分析
4. 討論
    4.1 POMC和UCP2基因在家兔中的遺傳多態(tài)性分析
        4.1.1 POMC基因遺傳多態(tài)性分析
        4.1.2 UCP2基因遺傳多態(tài)性分析
    4.2 POMC基因多態(tài)性對家兔生產(chǎn)性狀的遺傳效應分析
    4.3 UCP2基因多態(tài)性對家兔生產(chǎn)性狀的遺傳效應分析
    4.4 UCP2基因mRNA相對表達量分析
        4.4.1 不同生長階段UCP2基因mRNA相對表達量分析
A位點對UCP2基因mRNA表達量的影響">        4.4.2 c.72 G>A位點對UCP2基因mRNA表達量的影響
5. 結(jié)論
參考文獻
致謝
攻讀學位期間發(fā)表的學術論文


【參考文獻】:
期刊論文
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[2]湖羊、東湖雜種羊POMC基因外顯子3單核苷酸多態(tài)性及其與生長性狀的關聯(lián)分析[J]. 王春玲,孟晨玲,曹少先,張俊,孟春花,王慧利,方永飛,朱冬冬,茆達干.  遺傳. 2013(09)
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[7]兔肉生產(chǎn)加工現(xiàn)狀及其發(fā)展前景探討[J]. 余紅仙,李洪軍,劉英,顧媛.  肉類研究. 2008(09)
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博士論文
[1]動物肌肉生長調(diào)控因子基因和豬脂肪沉積調(diào)控基因的研究[D]. 劉丑生.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2003

碩士論文
[1]西門塔爾牛飼料轉(zhuǎn)化效率分子遺傳標記的研究[D]. 陳翠.中國農(nóng)業(yè)科學院 2012
[2]豬解耦聯(lián)蛋白基因(UCP2和UCP3)遺傳變異研究[D]. 李艷華.中國農(nóng)業(yè)大學 2005



本文編號:3375224

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